Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81831061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   

This is table  13  of  259  ( 31025 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3721540--3721582
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3722118--3722151
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1.9
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1.25
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2.0
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0
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66
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0
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0.93
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8
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66
0
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2
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55
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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30
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0
0
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16
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2.2
31
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2
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1
1
57
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
0
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2.0
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100
0
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10
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2
2
63
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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1.67
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26
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0
0
64
0.94
3884208--3884234
14
1.9
14
100
0
54
40
0
0
59
0.98
3884204--3884292
18
4.9
19
68
25
59
31
2
1
65
1.12
3884225--3884293
20
3.6
19
75
9
68
30
2
1
65
1.16
3884256--3884301
20
2.2
22
84
7
60
30
2
0
67
1.03
3884743--3884775
5
6.8
5
93
6
59
36
0
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3884826--3884880
27
2.0
27
96
0
101
50
0
3
45
1.19
3888211--3888334
47
2.6
47
77
10
126
23
17
25
33
1.96
3890787--3890819
17
1.9
17
88
11
50
33
42
9
15
1.78
3891974--3892007
17
1.9
17
88
5
50
35
0
2
61
1.11
3892282--3892333
17
3.2
17
72
8
54
32
7
1
57
1.38
3892239--3892333
15
6.0
15
69
23
54
30
7
2
60
1.36
3895188--3895232
22
2.0
22
83
8
56
51
0
6
42
1.28
3896551--3896597
15
3.1
15
76
14
51
48
2
2
46
1.25
3897838--3898022
98
1.9
98
94
2
327
19
31
23
24
1.98
3899611--3899637
2
13.5
2
100
0
54
51
0
48
0
1.00
3900222--3900288
34
1.9
35
90
3
109
34
10
11
43
1.76
3901632--3901701
27
2.6
27
80
8
79
50
21
2
25
1.63
3907519--3907556
16
2.5
15
87
8
58
42
0
0
57
0.98
3913968--3914032
22
3.2
22
62
20
59
40
10
6
43
1.65
3913967--3914045
39
2.0
39
100
0
158
37
12
5
44
1.65
3922162--3922215
18
2.9
18
86
8
65
51
7
1
38
1.41
3923137--3923170
17
2.0
17
88
0
50
76
0
2
20
0.92
3923196--3923240
21
2.3
19
85
11
56
40
2
8
48
1.47
3924877--3924917
14
2.9
15
82
17
52
29
9
0
60
1.28
3924847--3924958
42
2.6
44
77
12
115
30
10
1
57
1.43
3924892--3925010
3
39.7
3
74
9
91
31
5
2
60
1.34
3924832--3924955
18
7.1
18
68
18
73
29
11
3
56
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3924934--3925041
54
2.0
54
81
3
128
33
5
2
58
1.36
3925173--3925252
3
26.3
3
73
12
65
23
6
2
67
1.26
3926742--3926783
18
2.3
18
84
8
59
28
4
4
61
1.36
3931201--3931266
33
2.0
33
93
0
114
27
16
19
36
1.93
3936492--3936571
34
2.4
34
85
10
103
28
23
26
21
1.99
3941725--3941955
40
5.8
39
94
3
340
26
28
22
22
1.99
3948562--3948670
9
11.4
9
71
20
62
19
4
1
74
1.09
3948565--3948602
19
1.9
21
89
10
62
23
2
0
73
0.95
3950937--3951014
34
2.3
34
77
4
95
25
19
23
32
1.98
3951034--3951076
23
1.9
23
95
4
79
18
51
4
25
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259