Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81831061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   

This is table  24  of  259  ( 31025 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6600801--6600848
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5.0
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0
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0
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0
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5
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25
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0
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.0
20
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1.9
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0
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0
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0
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6710818--6710880
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0
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77
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1
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0.93
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17
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2
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2.0
42
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2.0
25
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75
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2.3
20
85
7
60
38
10
21
29
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
26
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88
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1.98
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2.7
25
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28
21
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24
1.99
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0
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4.7
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8
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22
26
17
1.96
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2.7
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137
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2.0
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100
0
54
0
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0
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21
2
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1.63
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2.0
42
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2
163
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20
6
36
1.80
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0
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2.1
65
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2
218
24
26
9
39
1.86
6771276--6771450
46
3.8
45
79
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199
28
29
21
21
1.98
6771284--6771454
93
1.8
93
93
0
297
28
29
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6771281--6771470
46
4.1
46
71
18
135
28
28
21
21
1.98
6780213--6780267
25
2.1
28
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10
71
60
1
27
10
1.41
6780715--6780754
11
3.6
11
79
0
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20
15
7
57
1.61
6780720--6780762
22
2.0
22
95
0
77
23
11
6
58
1.57
6781595--6781619
13
1.9
13
100
0
50
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16
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32
1.64
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16
2.0
16
93
0
55
56
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0
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1.43
6784475--6784584
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2.0
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0
220
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17
14
39
1.89
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25
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34
31
14
20
1.92
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24
4.0
24
74
13
96
39
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11
26
1.88
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1.9
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16
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0
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12
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1.50
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5
119
23
22
18
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1.96
6821750--6821863
47
2.4
47
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133
24
22
18
34
1.96
6821750--6821881
23
5.5
23
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10
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25
21
19
32
1.97
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24
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0
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20
14
29
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1.93
6829569--6829614
24
1.9
24
90
0
74
21
26
19
32
1.97
6833573--6833605
17
1.9
17
100
0
66
48
12
0
39
1.40
6837100--6837170
26
2.7
27
84
6
92
43
11
14
30
1.80
6840517--6840717
90
2.2
90
83
2
242
31
19
20
28
1.97
6841746--6841802
15
3.9
15
79
20
59
47
1
0
50
1.11
6843944--6844010
4
16.8
4
100
0
134
25
0
23
50
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6851638--6851684
18
2.6
18
83
6
60
44
29
10
14
1.79
6853191--6853237
24
2.0
24
95
0
85
34
10
14
40
1.81
6856070--6856146
18
4.4
17
81
14
77
37
32
15
14
1.88
6856332--6856388
3
19.0
3
100
0
114
33
0
0
66
0.92
6857713--6857774
5
12.4
5
100
0
124
40
0
0
59
0.97
6859045--6859078
15
2.3
15
94
0
59
35
0
14
50
1.44
6859459--6859544
23
4.0
23
77
13
83
13
22
25
38
1.91
6859471--6859544
20
3.5
22
80
12
82
12
21
27
39
1.89
6860673--6860705
15
2.3
15
89
5
50
51
0
6
42
1.26
6861019--6861057
13
3.2
12
83
16
53
48
5
0
46
1.24
6863454--6863510
24
2.5
23
81
13
73
49
1
0
49
1.11
6863453--6863510
11
5.1
11
80
12
64
50
1
0
48
1.11
6863552--6863590
18
2.2
18
85
0
51
48
2
2
46
1.29
6864223--6864259
19
1.9
19
89
10
58
35
8
24
32
1.85
6867704--6867791
43
2.0
44
91
2
142
26
17
13
43
1.86
6868847--6868932
40
2.1
41
91
2
138
34
22
23
19
1.96
6869545--6869593
24
2.0
24
100
0
98
53
0
4
42
1.20
6882656--6882686
15
2.1
15
100
0
62
6
32
6
54
1.51
6883891--6884012
50
2.4
50
86
0
154
26
26
27
20
1.99
6884498--6884533
19
1.9
18
88
5
54
50
5
5
38
1.49
6886556--6886583
8
3.5
8
100
0
56
25
0
0
75
0.81
6892660--6892727
31
2.2
31
100
0
136
30
8
23
36
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6895198--6895257
28
2.1
28
84
6
77
30
6
10
53
1.60
6896119--6896523
202
2.0
201
99
0
801
40
8
13
37
1.75
6898168--6898201
13
2.6
13
85
0
50
41
0
0
58
0.98
6898190--6898231
15
2.8
16
82
13
54
54
0
0
45
0.99
6898240--6898307
34
2.1
31
86
8
91
52
4
0
42
1.21
6898256--6898307
15
3.2
15
73
19
50
55
1
0
42
1.10
6912705--6912761
12
4.8
12
77
0
51
5
54
3
36
1.40
6915517--6915564
25
1.9
25
100
0
96
31
6
25
37
1.81
6916437--6916628
104
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103
96
2
359
49
8
16
25
1.74
6917239--6917267
15
1.9
15
100
0
58
31
13
0
55
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259