Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81831061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   

This is table  25  of  259  ( 31025 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6918481--6918510
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0
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0
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6922345--6922420
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1.21
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324
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6924338--6924513
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1.9
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20
19
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1.97
6928525--6928637
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3.5
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0
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1
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0
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1.61
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18
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2.0
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0
0
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0.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6973374--6973474
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28
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110
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0
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15
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0
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25
2.5
26
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69
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1
7
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1.39
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2.6
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56
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1.9
18
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5
61
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0
5
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2.1
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90
0
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16
14
22
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1.9
20
88
0
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42
7
23
26
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
0
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122
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30
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18
1.93
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1.98
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3.5
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8
174
24
28
18
27
1.98
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29
2.2
29
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0
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11
14
19
1.68
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18
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50
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18
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2.1
35
87
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107
33
28
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18
1.96
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10
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3.0
13
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7
13
63
1.51
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2.3
24
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14
71
64
1
1
31
1.13
7121281--7121341
26
2.3
26
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5
97
40
1
1
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1.19
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3.5
15
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23
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42
2
0
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1.11
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7
100
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25
24
21
1.99
7123427--7123534
40
2.7
39
84
4
128
27
22
21
28
1.99
7123176--7123601
152
2.8
153
85
2
586
31
19
20
28
1.97
7123617--7123742
7
17.7
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9
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20
0
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1.56
7123617--7123742
14
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20
0
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1.56
7123617--7123741
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21
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101
20
0
32
46
1.57
7123665--7123712
15
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15
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5
62
18
0
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1.50
7127572--7127930
43
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6
322
27
14
27
30
1.95
7127594--7127930
124
2.7
124
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7
364
27
14
28
29
1.95
7127594--7127915
81
3.9
81
72
10
258
27
14
27
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7128258--7128295
18
2.2
18
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4
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2
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1.59
7129078--7129133
27
2.1
27
86
0
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19
5
41
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1.74
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2.1
19
90
0
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35
35
7
22
1.82
7133045--7133094
23
2.2
21
77
19
55
36
18
18
28
1.94
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24
3.8
24
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87
35
18
21
23
1.95
7133050--7133128
24
3.3
24
85
5
97
39
16
22
21
1.92
7140433--7140544
48
2.4
45
80
12
120
31
16
27
24
1.97
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16
2.0
16
100
0
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37
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1.9
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0
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16
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18
32
1.97
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184
1.9
184
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3
493
25
23
18
31
1.98
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18
2.4
18
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14
56
31
0
22
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21
2.0
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100
0
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4
14
19
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1.8
90
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212
25
24
21
28
1.99
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42
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0
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3.6
48
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3
195
29
31
15
23
1.95
7173553--7173652
41
2.5
42
85
4
109
55
15
4
26
1.58
7174190--7174302
42
2.7
42
87
0
145
31
30
14
23
1.94
7174093--7174336
132
1.8
132
79
3
285
27
27
18
27
1.98
7174330--7174435
48
2.2
48
81
0
113
27
27
20
24
1.99
7189627--7189651
11
2.3
11
100
0
50
28
0
0
72
0.86
7193011--7193065
28
2.0
28
92
0
92
36
14
3
45
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7195530--7195583
24
2.2
25
80
12
67
3
27
0
68
1.06
7215452--7215498
21
2.1
23
85
14
64
59
0
4
36
1.17
7216173--7216237
20
3.3
20
66
23
57
23
9
13
53
1.68
7219539--7219589
20
2.5
20
80
0
66
37
15
13
33
1.87
7219901--7219962
31
2.0
31
84
6
81
37
20
4
37
1.75
7233354--7233406
25
2.1
25
85
0
70
45
22
15
16
1.85
7235809--7236020
28
7.6
28
83
2
212
31
16
15
35
1.91
7235782--7236023
28
8.7
29
79
7
180
30
17
16
35
1.92
7245877--7245983
27
4.0
27
81
0
115
42
19
14
23
1.87
7246099--7246132
17
1.9
17
88
5
50
14
44
29
11
1.81
7254569--7254675
43
2.5
43
84
0
133
29
26
18
25
1.98
7255763--7255793
16
1.9
16
93
0
53
48
3
12
35
1.58
7258488--7259516
179
5.8
179
93
1
1649
28
24
18
29
1.98
7258782--7258876
43
2.2
45
82
3
113
29
23
13
33
1.93
7258961--7259055
43
2.2
45
86
3
131
28
25
14
31
1.95
7259140--7259234
43
2.2
45
86
3
131
28
25
14
31
1.95
7259319--7259413
43
2.2
45
86
3
131
28
25
14
31
1.95
7260640--7260796
51
2.9
54
85
6
205
15
21
17
45
1.84
7262217--7262269
15
3.5
15
78
0
52
67
1
1
28
1.11
7262247--7262348
11
8.8
11
68
25
59
60
1
3
33
1.26
7263934--7264184
83
3.0
83
88
0
342
28
18
18
33
1.95
7264109--7264581
119
4.0
119
92
1
761
31
18
16
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7276468--7276514
15
3.1
15
81
6
51
72
4
0
23
1.02
7276460--7276604
11
12.7
11
68
23
54
62
3
2
31
1.26
7278164--7278362
81
2.5
82
85
7
266
29
18
19
33
1.95
7278315--7278757
119
3.7
119
89
2
667
31
19
15
33
1.93
7301421--7301535
57
2.0
57
100
0
230
33
1
22
42
1.64
7305420--7305500
31
2.5
31
84
4
99
60
19
6
13
1.54
7311158--7311333
9
20.0
9
67
11
71
35
2
18
43
1.62
7311142--7311377
52
4.7
52
73
15
199
35
2
16
44
1.63
7311175--7311381
43
4.6
43
79
11
216
35
2
16
44
1.63
7311208--7311381
95
1.8
95
86
0
249
35
2
16
45
1.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259