Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81831061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   

This is table  48  of  259  ( 31025 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15084230--15084289
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1.98
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178
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28
29
1.96
15092491--15092646
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1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
15092487--15092667
82
2.2
81
83
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229
26
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1.96
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2.3
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15097565--15097762
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1.8
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92
3
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29
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
46
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15151627--15152005
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2.0
188
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1.88
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2.1
37
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115
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18
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25
1.98
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2.4
43
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0
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1.92
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2.6
29
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2.6
40
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2.0
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0
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4.1
47
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0
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10
31
27
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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10
1.08
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12
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1.13
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26
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1.99
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1.97
15197805--15198032
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2.3
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285
30
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16
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1.97
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2.0
602
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1820
46
20
12
20
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15244458--15244497
3
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0
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24
28
19
27
1.99
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19
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0
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131
29
22
22
25
1.99
15264037--15264208
46
3.7
45
78
11
188
21
20
29
28
1.98
15264029--15264200
93
1.8
93
92
2
292
20
21
29
27
1.98
15272695--15272816
48
2.6
46
83
3
165
25
22
23
28
1.99
15281153--15281183
15
2.1
15
100
0
62
35
12
6
45
1.68
15287138--15287404
48
5.6
48
72
12
201
29
25
19
25
1.99
15287690--15287824
67
2.0
67
98
0
261
41
16
2
40
1.60
15289129--15289246
58
2.0
58
90
4
184
27
10
22
38
1.87
15291297--15291341
6
7.5
6
97
0
81
35
0
35
28
1.58
15293901--15294072
40
4.3
40
88
2
213
26
27
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15293903--15294125
40
5.6
39
83
5
207
26
27
21
25
1.99
15294057--15294134
40
1.9
41
82
10
97
28
28
20
23
1.99
15297186--15297400
45
4.9
45
80
5
217
26
20
26
26
1.99
15308917--15309231
48
6.6
48
78
8
279
28
18
29
23
1.98
15308967--15309231
142
1.9
142
89
6
419
27
17
30
24
1.97
15308907--15309231
96
3.4
96
82
4
399
28
17
29
24
1.97
15311519--15311616
28
3.5
27
75
10
90
27
15
30
26
1.96
15311530--15311645
56
2.1
56
85
3
155
30
15
29
25
1.96
15311721--15311787
32
2.1
32
85
0
89
38
10
19
31
1.85
15316005--15316050
23
2.0
23
95
0
83
36
26
19
17
1.94
15333369--15333438
28
2.5
28
88
9
99
31
27
14
27
1.95
15344902--15344940
20
2.0
20
84
0
51
38
0
17
43
1.50
15350054--15350218
59
2.8
59
84
0
240
33
31
13
21
1.92
15353479--15353606
37
3.5
37
98
0
247
24
32
20
23
1.98
15353753--15354145
48
8.1
48
91
2
642
33
25
5
36
1.78
15353753--15354145
98
4.1
96
91
2
642
33
25
5
36
1.78
15353753--15354138
146
2.6
146
97
0
709
32
25
5
36
1.78
15357608--15357994
40
9.7
40
92
0
612
26
28
21
23
1.99
15359249--15359391
37
3.9
37
97
0
250
25
32
18
23
1.97
15359541--15359980
48
9.1
48
93
2
763
32
26
5
35
1.79
15359541--15359980
146
3.0
146
95
0
794
32
26
5
35
1.79
15359541--15359980
194
2.3
194
94
1
767
32
26
5
35
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15371680--15371714
14
2.5
14
95
0
61
57
0
0
42
0.99
15373598--15373660
31
2.0
31
100
0
126
23
22
12
41
1.88
15376176--15376223
24
2.0
24
100
0
96
37
12
8
41
1.73
15377411--15377456
4
11.0
4
86
9
65
21
2
2
73
1.04
15377411--15377456
21
2.2
21
88
7
67
21
2
2
73
1.04
15377411--15377458
17
2.9
16
90
6
69
20
2
2
75
1.02
15377809--15377869
10
5.9
10
70
14
52
59
1
0
39
1.08
15386876--15386909
17
2.0
17
88
11
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29
8
5
1.54
15394899--15394923
12
2.1
12
100
0
50
24
8
28
40
1.83
15402062--15402109
14
3.3
15
77
14
55
58
0
4
37
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259