Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81831061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   

This is table  211  of  259  ( 31025 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66798702--66798859
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5
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0
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20
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1.99
66812123--66812269
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2.0
74
97
0
276
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0
0
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1.00
66812526--66812573
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2.8
17
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3
69
35
6
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1.23
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100
0
52
0
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137
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18
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1.97
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2.0
25
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14
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1.60
66841683--66841948
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6.0
46
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1.95
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2.0
84
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0
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18
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1.9
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2
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2.6
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28
6
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1.54
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2.0
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20
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30
2.1
30
100
0
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9
17
15
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
21
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1
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1.21
66876688--66876757
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3.0
23
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5
0
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2.0
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19
25
1.69
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1.9
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0
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1
1
22
0.97
66898969--66899009
21
1.9
22
90
5
66
80
2
2
14
0.92
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2.0
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67
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2.2
29
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1.98
66901041--66901103
29
2.2
29
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0
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15
25
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1.95
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0
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2.0
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100
0
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2.0
156
100
0
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19
2.0
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100
0
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10
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1.61
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2.0
39
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39
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20
1.85
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2.0
33
90
0
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1.9
20
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51
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20
5
17
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1.9
20
94
0
67
28
0
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65
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20
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30
1
3
64
1.18
66967555--66967605
19
2.7
20
79
11
63
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
18
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0
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5
1.17
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1.9
21
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0
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10
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1.64
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2.3
15
90
0
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1.65
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2
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2
100
0
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51
0
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1.00
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21
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60
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1.46
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0
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57
0
0
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27
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10
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167
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561
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21
15
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0
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0
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2
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67033414--67033447
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1.61
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4.8
14
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17
4
43
1.71
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1.9
27
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42
1.64
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119
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19
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43
1.70
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12.4
13
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16
52
32
17
3
46
1.65
67039165--67039199
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2.3
15
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0
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25
11
0
62
1.28
67040305--67040333
14
2.1
14
100
0
58
58
0
20
20
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67051730--67051754
12
2.1
12
100
0
50
84
0
8
8
0.79
67055809--67055879
25
2.9
24
75
8
72
78
4
4
12
1.03
67055816--67055873
18
3.2
18
81
13
73
79
5
5
10
1.05
67055809--67055879
6
11.7
6
76
13
65
78
4
4
12
1.03
67062611--67062682
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24.0
3
81
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5
1
65
1.23
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6
9.3
6
88
0
76
16
3
3
76
1.06
67064242--67064298
18
3.1
18
82
7
71
14
5
3
77
1.08
67064230--67064311
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12
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17
6
4
71
1.24
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100
0
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15
0
15
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1.20
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100
0
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0
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1.29
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58
27
2
10
59
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3.0
23
74
26
70
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4
0
53
1.21
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29
2.7
27
77
18
77
44
3
0
51
1.20
67084491--67084523
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
67084599--67084647
26
2.0
24
88
8
71
30
0
6
63
1.19
67084853--67084939
41
2.1
41
97
2
167
40
13
8
37
1.75
67093058--67093090
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
67098431--67098469
6
6.5
6
90
0
60
15
5
0
79
0.90
67101404--67101436
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
67117200--67117237
20
1.9
20
84
10
51
39
10
2
47
1.52
67119270--67119468
100
2.0
100
100
0
398
27
19
7
46
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67121352--67121420
16
4.3
16
94
0
120
39
5
33
21
1.77
67121400--67121490
46
2.0
46
93
4
159
26
4
30
38
1.76
67121400--67121506
46
2.5
44
85
11
143
28
3
30
36
1.75
67121649--67121804
17
10.5
15
66
30
61
54
2
0
42
1.18
67121771--67121804
17
2.0
17
100
0
68
58
0
0
41
0.98
67121634--67122123
117
4.3
117
92
3
777
51
3
1
42
1.30
67121883--67121921
17
2.5
15
84
15
60
61
0
0
38
0.96
67121888--67121921
17
2.0
17
100
0
68
58
0
0
41
0.98
67121954--67121993
20
2.0
21
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5
55
60
5
0
35
1.19
67121961--67122040
28
2.8
28
81
11
92
56
1
0
42
1.07
67121738--67122073
43
8.3
41
65
24
137
51
4
1
42
1.31
67122083--67122146
32
2.0
32
81
0
74
48
3
0
48
1.17
67131411--67131604
97
2.0
98
97
1
372
27
19
7
46
1.76
67151086--67151142
30
1.9
30
85
0
78
24
33
29
12
1.92
67159374--67159424
27
1.9
27
84
4
68
19
0
9
70
1.14
67172472--67172501
16
1.9
15
93
6
51
43
6
3
46
1.46
67172491--67172528
17
2.2
18
95
4
69
44
13
0
42
1.43
67175207--67175265
22
2.6
21
87
12
66
27
3
3
66
1.24
67175209--67175265
8
7.6
7
96
4
78
24
3
3
68
1.21
67175209--67175265
15
3.8
14
90
9
78
24
3
3
68
1.21
67175224--67175265
7
5.6
8
97
2
63
23
4
0
71
1.05
67175381--67175444
25
2.6
25
73
14
60
46
4
4
43
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67175644--67175686
22
2.0
22
86
9
61
48
30
0
20
1.50
67175833--67175882
15
3.5
14
84
10
57
44
30
0
26
1.55
67175845--67175894
14
3.5
14
81
13
57
46
30
0
24
1.53
67176332--67176379
22
2.1
22
84
3
60
25
0
25
50
1.50
67176420--67176784
41
8.9
41
89
0
525
20
22
21
35
1.96
67176816--67176841
12
2.2
12
100
0
52
46
30
15
7
1.74
67180156--67180198
19
2.2
19
83
4
50
58
4
16
20
1.56
67182223--67182253
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6
96
0
53
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0
1.47
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34
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54
15
1
28
1.49
67188423--67188447
6
4.2
6
100
0
50
48
0
0
52
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259