Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81831061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   

This is table  241  of  259  ( 31025 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75553108--75553144
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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23
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2.0
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3.1
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0
0
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12
14
0
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1.13
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22
2.3
22
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3
64
14
14
0
71
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.10
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59
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1.22
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2.7
42
75
19
123
59
0
6
34
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75678250--75678333
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1
1
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1
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1.9
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1.11
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100
0
268
39
2
13
44
1.59
75762993--75763042
17
3.0
15
81
18
55
80
0
4
16
0.87
75762993--75763042
9
5.9
8
79
11
55
80
0
4
16
0.87
75763059--75763136
9
8.4
9
72
10
59
55
5
2
37
1.36
75763117--75763185
36
1.9
36
85
5
95
46
1
2
49
1.25
75763155--75763188
10
3.4
10
83
0
50
47
0
2
50
1.16
75763634--75763691
19
3.1
19
73
14
57
31
3
5
60
1.35
75763648--75763701
28
1.9
28
85
7
74
33
3
5
57
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75765030--75765055
11
2.4
11
100
0
52
0
0
7
92
0.39
75770256--75770511
131
2.0
131
90
0
404
34
18
19
27
1.95
75774569--75774619
21
2.4
21
90
0
75
27
37
9
25
1.87
75794731--75794756
3
8.7
3
100
0
52
65
0
0
34
0.93
75795748--75795786
19
2.1
19
95
0
69
38
0
5
56
1.22
75799171--75799308
39
3.6
38
87
5
181
48
5
15
31
1.66
75800111--75800143
17
1.9
17
93
0
57
33
9
3
54
1.47
75802414--75802464
26
1.9
27
84
4
68
7
52
1
37
1.42
75815351--75815415
30
2.2
31
83
5
80
56
9
1
32
1.40
75832228--75832262
11
3.3
11
88
8
54
91
2
5
0
0.50
75832228--75832269
15
2.7
15
85
10
50
88
2
9
0
0.61
75834481--75834513
7
4.7
7
100
0
66
27
12
0
60
1.32
75838783--75838840
29
2.0
28
90
3
89
34
1
0
63
1.04
75839221--75839253
16
2.1
17
88
11
52
63
0
0
36
0.95
75839204--75839251
19
2.5
19
75
3
51
56
0
0
43
0.99
75846377--75846402
12
2.2
12
100
0
52
42
15
0
42
1.47
75846982--75847056
30
2.4
31
80
11
89
58
10
4
26
1.49
75847082--75847124
22
2.0
22
85
0
59
58
11
11
18
1.63
75847089--75847129
11
3.7
11
80
0
55
56
9
14
19
1.66
75847377--75847455
39
2.0
39
100
0
158
22
12
22
41
1.88
75847598--75847634
15
2.5
15
95
0
65
48
21
0
29
1.50
75859841--75859875
2
17.5
2
100
0
70
0
51
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75862305--75862329
7
3.6
7
100
0
50
88
0
0
12
0.53
75868971--75869003
16
1.9
18
88
11
52
30
6
0
63
1.18
75871582--75871621
18
2.3
18
87
8
57
22
12
17
47
1.81
75872801--75872880
23
3.3
24
75
7
72
53
2
0
43
1.14
75872812--75872845
15
2.2
16
89
5
52
67
0
0
32
0.91
75872835--75872901
30
2.2
32
83
5
84
52
7
0
40
1.30
75887797--75887826
14
2.2
14
94
5
53
10
13
0
76
1.01
75890957--75890981
3
8.3
3
100
0
50
32
0
36
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1.58
75901309--75901351
14
3.1
14
82
0
50
69
2
16
11
1.28
75906566--75906637
31
2.4
30
79
6
83
43
1
6
48
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          257   258   259