Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81831061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   

This is table  199  of  259  ( 31025 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63468330--63468436
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0
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2.0
24
91
0
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2
6
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0.74
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26
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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2.1
132
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10
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31
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0
0
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2.0
69
98
0
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11
33
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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63540388--63540503
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162
37
22
23
17
1.94
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16
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1.92
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17
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1.94
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18
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1.95
63553516--63553993
252
1.9
245
85
5
647
35
20
17
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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82
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38
20
15
25
1.92
63553741--63554075
88
4.0
83
83
5
397
37
20
15
25
1.93
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9
97
0
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22
10
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39
1.86
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21
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10
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10
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1.65
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17
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27
1.97
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9
126
37
8
16
37
1.78
63574702--63574730
12
2.5
12
94
5
51
10
24
37
27
1.88
63576672--63576711
21
1.9
21
84
0
53
65
5
0
30
1.14
63576872--63576897
8
3.2
8
100
0
52
65
0
0
34
0.93
63577033--63577096
23
2.7
23
84
11
76
57
7
1
32
1.37
63577036--63577103
3
22.3
3
73
8
57
61
5
1
30
1.28
63577527--63577564
18
2.1
18
90
0
58
50
0
50
0
1.00
63577528--63577560
11
2.9
12
91
8
52
48
0
51
0
1.00
63579193--63579233
17
2.4
18
80
12
50
0
31
0
68
0.90
63579202--63579275
11
6.8
10
73
15
58
4
20
4
71
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63581137--63581416
131
2.2
130
78
8
284
35
9
12
43
1.75
63582439--63582531
44
2.1
44
97
0
177
35
23
6
34
1.81
63600214--63600246
15
2.2
15
94
0
57
12
15
6
66
1.42
63619298--63619333
1
36.0
1
100
0
72
100
0
0
0
0.00
63620244--63621134
44
20.3
44
74
6
654
28
16
25
29
1.97
63620493--63621134
132
4.9
132
97
0
1203
28
15
25
29
1.96
63623021--63623050
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
63623643--63623848
105
2.0
105
93
0
349
30
19
18
30
1.96
63626768--63626804
17
2.2
17
90
0
56
43
2
0
54
1.14
63630068--63630158
44
2.1
44
85
4
121
46
7
5
40
1.56
63634486--63634514
5
6.0
5
96
4
51
41
0
0
58
0.98
63634514--63634542
13
2.1
14
93
6
51
75
0
3
20
0.94
63635408--63635446
5
7.8
5
97
0
60
41
12
5
41
1.65
63639464--63639507
17
2.7
16
82
3
52
70
2
2
25
1.10
63640444--63640484
19
2.2
19
86
8
57
48
0
0
51
1.00
63641468--63641520
26
2.0
26
82
7
63
43
9
0
47
1.36
63654597--63654648
27
1.9
27
84
0
68
21
26
32
19
1.97
63654847--63654885
19
2.1
18
85
4
51
64
0
33
2
1.08
63655155--63655514
113
3.2
113
91
2
593
32
0
16
50
1.51
63655632--63655663
15
2.1
16
94
5
57
37
0
6
56
1.25
63657798--63657856
21
2.6
22
82
12
68
61
0
3
35
1.13
63657906--63657944
19
2.1
19
95
0
69
51
5
12
30
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63657974--63658019
23
2.0
23
87
4
67
54
8
4
32
1.51
63658127--63658235
3
34.7
3
71
14
69
58
2
5
33
1.35
63659885--63660201
88
3.6
87
81
6
358
35
19
16
27
1.93
63660099--63660131
15
2.2
15
94
0
57
69
0
9
21
1.15
63660115--63660418
74
4.2
73
86
3
441
32
20
18
29
1.96
63660115--63660418
147
2.1
146
89
2
466
32
20
18
29
1.96
63671782--63672148
46
7.6
49
86
8
422
34
14
22
28
1.93
63671782--63672148
98
3.7
97
83
9
483
34
14
22
28
1.93
63671796--63672148
196
1.8
196
91
0
589
35
14
22
28
1.93
63672112--63672221
37
3.0
37
94
1
195
37
16
21
24
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259