Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  73211361

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   

This is table  227  of  240  ( 28759 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68200148--68200202
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21
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10.0
10
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1.36
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324
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25
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2
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2
20
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20
3.1
20
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1
3
61
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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54
0
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43
1.14
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70
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2
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1.35
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120
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120
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2
44
1.35
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68256973--68257210
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25
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18
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25
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132
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19
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79
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16
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2.4
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9
58
0
16
0
83
0.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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109
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11
2.8
11
95
0
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19
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3
29
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68389804--68389894
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11
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0
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19
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1.64
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21
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1.26
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0
0
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0.95
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2
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1.56
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2.2
26
69
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63
31
17
12
38
1.87
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16
2.9
16
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61
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15
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2.3
18
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7
61
34
2
0
63
1.07
68432554--68432613
20
3.1
20
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13
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33
1
3
61
1.22
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2.2
71
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5
181
32
15
21
30
1.94
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2.1
38
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0
129
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15
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25
0
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20
2.3
18
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61
34
2
0
63
1.07
68444390--68444449
20
3.1
20
81
13
56
33
1
3
61
1.22
68456089--68456129
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
68467482--68467524
21
2.0
21
100
0
86
27
9
18
44
1.80
68477116--68477145
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
68480193--68480248
3
18.7
3
100
0
112
33
0
0
66
0.92
68481748--68481778
14
2.1
15
94
5
55
25
25
0
48
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68488156--68488197
15
2.9
15
96
3
77
26
0
7
66
1.17
68488270--68488302
16
2.1
16
88
11
50
75
6
0
18
1.00
68491429--68491629
100
2.0
100
99
0
393
40
12
17
29
1.86
68492428--68492594
87
1.9
87
95
0
298
31
21
16
29
1.96
68492664--68492965
153
2.0
153
84
3
394
37
17
20
23
1.94
68494062--68494099
20
1.9
20
88
0
58
18
31
2
47
1.62
68504209--68504418
70
3.0
70
92
0
348
37
11
28
22
1.89
68504840--68504865
9
2.9
9
100
0
52
57
0
0
42
0.98
68506011--68506041
12
2.6
12
89
0
53
74
0
9
16
1.07
68511116--68511158
19
2.3
18
92
4
68
32
2
0
65
1.06
68511497--68511528
12
2.7
12
100
0
64
62
0
6
31
1.20
68520140--68520170
14
2.1
15
94
5
55
25
25
0
48
1.52
68522616--68522689
37
2.1
36
94
5
132
18
12
5
63
1.47
68524240--68524283
20
2.3
18
88
7
61
34
2
0
63
1.07
68528066--68528106
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
68531879--68531984
52
2.0
53
83
5
135
35
11
17
34
1.86
68537042--68537072
14
2.1
15
94
5
55
25
25
0
48
1.52
68538379--68538415
19
1.9
19
94
0
65
62
0
2
35
1.10
68539230--68539268
18
2.3
18
86
8
55
43
12
5
38
1.65
68539425--68539455
15
2.1
15
100
0
62
22
32
6
38
1.80
68543587--68543625
18
2.3
18
86
8
55
43
12
5
38
1.65
68543782--68543812
15
2.1
15
100
0
62
22
32
6
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68552044--68552077
16
2.1
16
100
0
68
26
23
17
32
1.97
68558877--68558917
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
68562113--68562143
3
10.3
3
100
0
62
32
0
0
67
0.91
68563779--68563820
16
2.6
16
96
0
75
33
14
14
38
1.86
68580145--68580169
6
4.2
6
100
0
50
16
0
0
84
0.63
68583724--68583769
6
7.7
6
97
0
65
39
0
60
0
0.97
68584886--68585054
87
1.9
87
92
0
284
30
20
18
30
1.96
68588561--68588601
21
2.0
21
81
18
50
31
19
26
21
1.97
68591528--68591568
20
2.0
21
90
4
66
21
29
2
46
1.64
68591558--68591587
16
1.9
15
93
6
51
13
36
6
43
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240