Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81554553

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   

This is table  180  of  253  ( 30316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58810965--58811552
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2.0
299
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1.39
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119
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26
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2.3
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25
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2
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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35
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62
1.09
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270
2.4
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790
30
3
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1.39
58842667--58842709
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2.5
18
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39
0
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19
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1.70
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2.1
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10
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37
0
5
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0
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2.5
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2.1
42
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26
14
25
1.94
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3.7
42
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3
138
30
24
15
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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100
0
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15
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18
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1.97
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1.98
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2.8
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2
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30
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28
1.97
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15
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0
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0
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5.1
47
87
2
290
26
28
10
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58975752--58975823
22
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22
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1.93
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23
27
21
27
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12
100
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20
14
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1.59
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294
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0
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4
23
1.73
59032499--59032819
47
6.7
47
91
3
491
32
9
30
28
1.88
59032499--59032819
96
3.4
96
93
1
513
32
9
30
28
1.88
59032938--59033090
37
4.1
37
95
0
261
21
18
33
26
1.96
59035354--59035574
48
4.6
48
75
10
163
25
28
19
27
1.99
59035451--59035612
48
3.5
44
82
9
148
25
30
19
25
1.98
59044954--59045040
26
3.4
26
68
4
61
39
27
8
25
1.84
59048072--59048118
23
2.0
24
87
4
69
59
6
2
31
1.34
59057535--59057585
25
2.0
25
96
0
93
35
15
21
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59060467--59060521
27
2.1
26
83
10
67
32
0
7
60
1.24
59063845--59063919
34
2.2
33
81
6
87
41
16
13
29
1.86
59063854--59063920
34
2.0
34
87
0
98
44
14
11
28
1.81
59072735--59072855
55
2.2
54
82
5
136
22
33
22
22
1.98
59078712--59078753
14
3.0
14
83
10
50
38
0
2
59
1.10
59087151--59087189
14
2.9
13
81
7
51
23
5
0
71
1.05
59089477--59089700
48
4.7
48
77
6
179
21
29
19
29
1.98
59089620--59089712
48
1.9
48
82
0
114
21
30
21
26
1.98
59097121--59097399
48
5.8
48
75
5
224
22
28
18
29
1.98
59097119--59097393
96
2.9
92
77
11
286
22
28
19
30
1.98
59103386--59103435
25
2.0
25
96
0
91
14
24
32
30
1.94
59103592--59103643
26
2.0
26
96
0
95
13
23
34
28
1.92
59103307--59103675
103
3.6
103
92
3
616
18
20
30
30
1.97
59114860--59115118
128
2.0
128
87
1
367
37
14
18
29
1.90
59119251--59119554
46
6.5
46
77
10
210
27
18
28
25
1.98
59129920--59130070
43
3.5
43
79
6
180
33
25
14
25
1.94
59131939--59131979
12
3.4
12
90
6
57
21
0
7
70
1.11
59131948--59131996
21
2.4
20
86
3
62
24
0
4
71
1.03
59138617--59138748
68
1.9
68
100
0
264
39
14
10
35
1.81
59140591--59140635
21
2.1
21
84
8
56
60
6
24
8
1.51
59142526--59142567
21
2.0
21
95
0
75
33
9
26
30
1.88
59144097--59144271
30
5.8
30
91
0
287
25
48
3
22
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59144097--59144271
60
2.9
60
97
0
323
25
48
3
22
1.66
59144753--59144884
25
5.5
23
69
13
72
34
3
3
58
1.32
59144830--59144972
25
5.6
25
70
14
94
34
5
4
55
1.45
59144950--59145005
19
2.8
20
81
8
69
32
5
5
57
1.44
59145126--59145159
15
2.3
14
90
10
50
29
0
5
64
1.17
59145126--59145159
8
4.5
8
96
3
54
29
0
5
64
1.17
59145126--59145166
16
2.6
15
88
7
55
29
0
4
65
1.13
59150117--59150294
27
6.6
27
75
6
119
29
26
16
28
1.97
59150117--59150294
54
3.3
54
74
12
150
29
26
16
28
1.97
59158120--59158297
27
6.6
27
75
6
119
29
26
16
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253