Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81554553

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   

This is table  228  of  253  ( 30316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74601757--74601851
3
33.0
3
74
10
65
31
6
1
61
1.28
74601979--74602087
43
2.5
43
86
0
146
33
26
16
22
1.95
74606317--74606359
22
2.0
22
95
0
77
32
18
18
30
1.95
74607911--74608168
3
85.3
3
65
22
64
31
6
1
60
1.32
74608297--74608334
16
2.4
16
82
8
51
34
0
0
65
0.93
74608287--74608396
41
2.4
47
80
16
135
32
1
2
62
1.20
74608318--74608396
11
6.7
11
73
18
61
31
2
2
63
1.21
74608318--74608393
26
3.1
24
73
15
75
32
2
2
61
1.23
74608288--74608385
39
2.4
40
81
10
110
33
2
2
62
1.18
74608318--74608349
13
2.6
13
90
9
50
28
0
3
68
1.04
74608287--74608421
21
6.0
21
70
21
78
33
2
3
60
1.26
74608342--74608496
25
6.4
25
70
17
87
35
7
3
53
1.47
74608642--74608676
17
2.0
18
88
5
54
28
2
2
65
1.21
74608377--74608684
136
2.2
140
77
13
312
34
6
5
54
1.49
74611314--74611352
17
2.3
17
86
0
51
53
10
2
33
1.48
74611875--74611925
21
2.5
19
74
22
50
35
23
7
33
1.84
74616243--74616279
19
1.9
19
88
0
56
48
16
0
35
1.46
74616452--74616541
24
3.7
23
81
10
83
32
20
23
24
1.98
74620389--74620414
13
2.0
13
100
0
52
23
23
7
46
1.78
74626438--74626476
20
2.0
20
90
10
62
46
0
2
51
1.14
74627578--74627603
12
2.2
12
100
0
52
76
0
0
23
0.78
74628602--74628657
28
2.0
28
100
0
112
42
7
14
35
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74638252--74638337
40
2.2
39
85
2
109
25
15
27
31
1.95
74638349--74638448
28
3.6
28
72
5
85
27
16
32
25
1.96
74641736--74641785
22
2.3
22
78
21
61
34
4
4
58
1.36
74642542--74642843
151
2.0
149
98
1
586
39
16
17
26
1.91
74644821--74644859
20
2.0
20
85
10
53
51
5
0
43
1.24
74644942--74645018
33
2.3
33
86
2
100
53
9
5
32
1.55
74652138--74652185
12
3.9
13
74
20
50
62
2
0
35
1.07
74653699--74653749
22
2.3
22
96
0
93
11
3
52
31
1.56
74654396--74654714
89
3.6
88
75
11
299
40
18
14
26
1.90
74654714--74655029
70
4.5
70
77
7
277
31
23
16
28
1.96
74654714--74655057
74
4.9
73
76
13
260
32
22
16
28
1.96
74668212--74668259
20
2.3
20
75
3
51
39
2
58
0
1.10
74668793--74668850
22
2.6
22
94
0
98
12
3
55
29
1.53
74669131--74669266
45
3.0
44
81
6
157
36
13
22
27
1.92
74672598--74672640
17
2.5
17
85
7
61
41
9
4
44
1.57
74675553--74675592
20
2.0
20
85
9
55
32
7
5
55
1.50
74675777--74675817
21
2.0
20
85
4
55
34
2
7
56
1.40
74675956--74675999
12
3.7
12
76
11
54
31
9
2
56
1.43
74676282--74676327
23
2.0
23
91
0
74
23
6
4
65
1.35
74676401--74676523
3
41.3
3
72
13
76
32
6
3
57
1.40
74681986--74682019
15
2.1
16
89
10
52
73
2
0
23
0.97
74683954--74683998
17
2.7
16
83
10
54
35
0
2
62
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74685619--74685698
28
2.9
27
76
14
81
48
11
21
18
1.79
74685619--74685700
29
2.9
29
77
17
82
50
10
20
18
1.77
74685787--74685918
28
4.5
28
71
11
86
40
9
27
21
1.85
74685816--74685938
61
2.0
61
84
6
160
46
8
26
19
1.77
74687438--74687469
15
2.1
15
100
0
64
28
28
25
18
1.98
74693462--74693512
24
2.0
26
85
11
70
5
7
17
68
1.34
74694209--74694250
19
2.2
19
86
0
57
21
0
4
73
1.01
74694304--74694339
18
2.0
18
88
0
54
16
5
0
77
0.94
74694396--74694439
3
15.0
3
95
4
81
31
0
0
68
0.90
74696478--74696604
62
2.1
62
81
7
147
34
7
1
56
1.36
74696497--74696625
62
2.1
60
81
8
145
32
8
2
56
1.42
74696689--74696786
4
22.8
4
70
13
54
28
5
1
65
1.20
74696696--74696968
71
3.8
69
75
15
200
26
8
4
60
1.44
74696720--74696969
73
3.5
71
78
9
233
26
8
4
60
1.46
74697793--74698001
111
1.9
108
81
8
251
38
17
13
29
1.89
74703423--74704205
89
8.8
87
77
7
626
32
15
21
30
1.94
74703481--74704204
133
5.4
132
84
4
751
32
15
21
30
1.94
74703437--74704190
266
2.8
265
82
4
865
32
15
21
30
1.94
74703423--74704205
44
17.6
44
75
6
621
32
15
21
30
1.94
74704600--74704676
4
18.8
4
69
15
50
66
3
23
6
1.32
74704648--74704678
16
1.9
16
100
0
62
74
0
19
6
1.03
74711909--74711937
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74713949--74714192
44
5.4
44
75
8
211
30
15
23
30
1.95
74715696--74715735
12
3.2
12
89
10
55
32
0
0
67
0.91
74715898--74715946
3
17.0
3
83
8
66
32
4
0
63
1.13
74716093--74716122
4
7.2
4
92
7
51
23
3
0
73
0.98
74724629--74724729
24
4.2
24
71
14
73
31
22
13
31
1.93
74724654--74724763
48
2.3
48
82
0
121
30
19
14
35
1.91
74729223--74729300
13
5.9
13
80
8
86
32
6
25
35
1.81
74729517--74729589
21
3.6
19
78
10
65
50
0
1
47
1.09
74738747--74738820
31
2.5
31
77
16
75
48
0
5
45
1.25
74738923--74738957
16
2.2
16
90
10
54
54
0
0
45
0.99
74738931--74738970
21
1.9
21
84
0
53
62
0
2
35
1.09
74739765--74739823
21
2.8
19
78
19
55
44
3
20
32
1.68
74742323--74742379
27
2.1
27
100
0
114
38
10
7
43
1.66
74744272--74744301
15
2.0
15
93
0
51
36
13
3
46
1.60
74745124--74745186
32
2.0
32
96
0
117
33
17
14
34
1.90
74745275--74745309
17
2.1
17
100
0
70
28
11
20
40
1.87
74747601--74747638
18
2.1
18
95
0
67
21
21
26
31
1.98
74747785--74747811
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
74753242--74753785
273
2.0
272
90
1
856
35
15
16
32
1.90
74755722--74755758
19
1.9
19
94
0
65
32
29
29
8
1.86
74767611--74767934
46
7.0
46
91
0
443
40
15
23
21
1.90
74768699--74768738
18
2.2
18
95
0
71
22
37
15
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74771634--74771671
18
2.2
18
90
4
60
71
0
0
28
0.87
74772914--74772949
19
1.9
19
94
5
65
47
11
13
27
1.77
74772946--74773193
119
2.1
118
87
2
354
41
8
9
41
1.66
74776529--74776639
33
3.6
33
83
8
128
54
5
0
39
1.23
74776550--74776628
3
26.3
3
71
10
54
59
3
0
36
1.16
74779713--74779759
5
9.4
5
81
9
60
57
17
23
2
1.50
74781458--74781514
26
2.2
26
83
0
69
19
24
17
38
1.93
74781591--74781710
25
4.9
25
74
3
109
20
28
19
31
1.97
74783253--74783533
104
2.7
104
81
4
325
22
29
23
24
1.99
74785192--74785241
17
2.9
17
77
16
59
6
32
2
60
1.32
74786200--74786276
40
1.9
40
83
0
100
18
14
32
35
1.91
74792291--74792336
17
2.9
16
78
12
51
2
21
2
73
1.04
74793023--74793088
33
2.0
33
96
0
123
31
18
13
36
1.90
74795370--74795407
19
2.0
20
89
5
60
73
0
0
26
0.83
74798198--74798235
14
2.9
13
81
11
51
63
0
0
36
0.95
74803012--74803055
21
2.1
21
86
0
61
65
0
0
34
0.93
74803009--74803095
29
3.0
28
80
9
70
67
1
2
28
1.10
74803013--74803106
10
9.7
10
67
13
54
64
1
2
31
1.12
74803002--74803078
38
2.1
35
81
11
84
70
0
1
28
0.96
74803033--74803095
9
7.0
9
73
18
51
69
1
3
25
1.12
74803098--74803141
22
2.0
22
86
8
63
70
6
0
22
1.11
74808281--74808308
7
4.0
7
100
0
56
14
0
0
85
0.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74809323--74809350
5
5.6
5
100
0
56
21
0
0
78
0.75
74809394--74809424
15
2.0
16
93
6
55
29
0
0
70
0.87
74811445--74811498
9
5.6
10
74
14
51
38
0
0
61
0.96
74811445--74811502
18
3.0
19
87
10
82
41
0
0
58
0.98
74813780--74813817
13
2.9
13
80
11
51
63
0
0
36
0.95
74813831--74813869
20
2.0
20
90
10
62
76
0
12
10
1.01
74821319--74821356
13
2.9
13
80
11
51
63
0
0
36
0.95
74821370--74821408
20
2.0
20
90
10
62
76
0
12
10
1.01
74822341--74822384
6
7.2
6
86
2
61
15
18
18
47
1.83
74824847--74824964
38
3.1
38
77
2
121
32
14
14
38
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253