Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81554553

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   

This is table  246  of  253  ( 30316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79193410--79193507
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0
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2.5
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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1.97
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178
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2
615
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22
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1.97
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2.6
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12
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13
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4.0
26
91
0
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32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.96
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1.98
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2.5
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1.49
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0
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1.47
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207
2.1
203
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1.19
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7
14.3
7
72
19
63
67
1
3
26
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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17
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17
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50
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13
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13
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0
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29
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25
37
1.84
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2.5
26
81
0
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29
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25
37
1.84
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22
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48
1
3
46
1.24
79357318--79357377
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2.2
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79
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36
1
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56
1.31
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2.0
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1.47
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1
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38
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110
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1
6
32
1.30
79363644--79363708
26
2.5
26
74
18
64
58
1
1
38
1.17
79364824--79364881
22
2.6
22
94
0
98
12
3
55
29
1.53
79365621--79365856
74
3.2
73
80
4
253
38
20
16
24
1.92
79365731--79365958
120
1.9
123
87
4
345
34
24
17
24
1.96
79387917--79387967
21
2.5
20
87
12
68
62
0
7
29
1.23
79387929--79387996
33
2.0
33
83
8
84
67
0
5
26
1.13
79387932--79387974
15
2.9
15
78
21
54
65
0
4
30
1.13
79389228--79389285
22
2.6
22
88
0
89
12
5
55
27
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79392144--79392272
50
2.5
51
87
5
181
37
16
21
24
1.93
79392248--79392427
31
5.8
31
91
2
272
27
18
27
26
1.98
79392452--79392616
47
3.7
46
83
6
169
29
16
25
29
1.97
79392549--79392660
42
2.7
43
87
4
156
31
16
25
27
1.96
79393587--79393628
15
2.7
15
82
14
50
40
4
7
47
1.52
79394744--79394807
29
2.2
29
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0
83
39
0
0
60
0.97
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15
3.5
15
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15
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0
0
62
0.95
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17
2.0
17
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0
5
1.26
79405182--79405215
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
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10
100
0
50
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0
0
72
0.86
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18
2.3
19
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12
61
26
2
4
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1.23
79415332--79415459
64
2.0
64
98
0
247
33
15
7
43
1.74
79415446--79415504
19
3.4
19
65
29
58
35
6
10
47
1.64
79415445--79415508
33
1.9
33
100
0
128
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6
10
45
1.65
79415783--79415914
65
2.0
64
98
1
255
31
6
6
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1.51
79415878--79415934
21
2.8
20
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17
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5
1
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1.28
79415882--79415913
3
10.7
3
93
0
55
31
3
0
65
1.08
79416023--79416098
37
2.1
37
100
0
152
30
7
21
40
1.81
79416319--79416345
6
4.5
6
100
0
54
0
70
0
29
0.88
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13
2.9
13
80
11
51
63
0
0
36
0.95
79422650--79423019
132
2.8
131
78
5
343
35
17
18
28
1.93
79422777--79423021
131
1.9
132
85
2
341
37
15
17
29
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79424667--79424915
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
79424666--79424915
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
79425010--79425040
13
2.4
13
94
0
53
54
12
0
32
1.38
79425253--79425310
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
79428828--79429348
131
4.0
131
94
0
889
27
27
17
27
1.98
79429378--79429557
64
2.8
64
93
1
290
38
11
17
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1.85
79432711--79433082
132
2.8
131
78
6
383
35
17
17
29
1.93
79435526--79435589
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2.0
32
96
0
119
12
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20
1.78
79439195--79439405
31
6.8
31
91
0
305
27
19
26
26
1.99
79439528--79439638
42
2.6
42
84
7
136
32
14
25
27
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253