Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81554553

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   

This is table  242  of  253  ( 30316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.6
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3
3
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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182
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26
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2.4
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2
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2
5
25
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.64
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14
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14
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12
1.68
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4.8
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279
29
29
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20
1.98
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1.8
93
93
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15
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15
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15
100
0
58
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17
13
1.52
78371247--78371640
178
2.2
178
93
0
680
36
18
16
28
1.93
78371493--78371720
74
2.9
79
85
6
331
32
22
17
27
1.96
78383564--78383604
20
2.0
20
85
0
55
43
12
17
26
1.84
78384416--78384474
28
2.1
28
90
6
93
59
5
5
30
1.41
78386615--78386647
14
2.3
15
89
5
50
33
9
0
57
1.30
78389212--78389305
21
4.5
21
71
0
62
19
8
52
20
1.72
78393107--78393154
18
2.6
18
83
3
60
64
0
2
33
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78406903--78406945
16
2.6
16
82
14
52
55
0
2
41
1.12
78410620--78410657
19
2.0
19
100
0
76
42
0
21
36
1.53
78416145--78416183
19
2.0
20
85
5
53
53
0
0
46
1.00
78417958--78418027
33
2.1
33
100
0
140
8
20
11
60
1.57
78417968--78418027
18
3.5
19
68
23
60
6
20
13
60
1.55
78419422--78419525
51
2.0
51
92
0
172
14
3
46
35
1.63
78426159--78426336
61
3.0
60
71
16
152
43
1
2
52
1.26
78426251--78426309
26
2.3
25
85
8
82
40
0
1
57
1.09
78426264--78426319
15
4.0
15
73
17
57
44
0
0
55
0.99
78426290--78426358
22
3.3
22
69
22
67
43
2
0
53
1.15
78426236--78426375
17
8.6
17
67
23
61
45
1
0
52
1.14
78426603--78426670
16
4.2
16
92
0
118
35
36
0
27
1.58
78426897--78426933
19
1.9
19
94
0
65
0
43
10
45
1.39
78426955--78427016
15
4.1
15
78
15
65
0
24
8
67
1.17
78426978--78427011
13
2.7
13
95
4
61
0
29
8
61
1.26
78426973--78427042
30
2.3
30
85
7
88
4
30
11
54
1.55
78429307--78429354
18
2.8
18
74
22
50
43
0
0
56
0.99
78429324--78429375
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
78429372--78429566
56
3.1
65
65
22
182
41
2
6
49
1.40
78429290--78429610
119
2.7
120
98
1
619
43
1
4
50
1.32
78429443--78429494
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
78429572--78429613
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78429563--78429604
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
78443823--78443888
31
2.1
31
85
0
87
42
12
4
40
1.62
78445713--78445900
50
3.8
50
82
4
227
26
18
25
29
1.98
78449676--78449713
20
1.9
20
94
0
67
44
0
0
55
0.99
78450518--78450556
18
2.2
18
90
4
62
33
0
0
66
0.92
78455327--78455380
18
3.1
18
78
5
65
48
3
0
48
1.19
78455319--78455381
18
3.4
18
71
8
56
49
4
0
46
1.23
78455624--78455670
24
1.9
25
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4
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34
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1.74
78456145--78456174
16
1.9
15
93
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51
60
16
6
16
1.56
78460689--78460724
18
2.0
18
88
0
54
52
11
5
30
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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