Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  81554553

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   

This is table  220  of  253  ( 30316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72236499--72236539
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2.8
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3
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12.2
6
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20
0
0.94
72251012--72251088
7
11.0
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17
54
76
3
19
0
0.94
72251491--72251531
19
2.1
20
86
4
57
56
2
9
31
1.45
72253626--72253669
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2.7
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10
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2
0
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0
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0
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110
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2.2
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25
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2
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0
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0
0
50
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22
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35
0
1
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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5
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23
0
5
71
1.05
72304702--72304766
19
2.9
23
84
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66
27
0
6
66
1.15
72309748--72309809
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2.6
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62
0
0
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47
0
2
50
1.14
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1.9
32
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30
17
11
40
1.85
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72
3.0
71
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42
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35
1.74
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3.8
20
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27
1.04
72313190--72313265
10
7.7
9
72
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69
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1
27
1.04
72313200--72313266
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2.3
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1
0
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19
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1.12
72313213--72313275
29
2.2
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81
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3
1
25
1.12
72313438--72313589
10
15.5
10
68
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54
30
5
1
63
1.25
72313440--72313504
20
3.4
19
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14
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27
9
1
61
1.35
72313438--72313495
19
2.9
19
76
19
57
25
8
1
63
1.32
72313435--72313520
38
2.2
39
76
10
88
31
6
1
60
1.31
72313508--72313561
11
5.2
11
73
8
51
25
3
0
70
1.04
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4.4
29
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115
33
3
0
61
1.19
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28
2.2
29
86
8
87
35
0
1
62
1.05
72313538--72313610
10
7.5
10
74
11
55
35
0
1
63
1.04
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28
2.5
29
82
11
85
33
0
2
63
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72319176--72319300
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2.9
43
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2.0
16
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0
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1.11
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20
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17
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33
0
2
64
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41
0
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1.27
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0
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0
0
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2.1
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11
4
48
1.60
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26
1.97
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1.95
72335461--72335920
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3.2
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5
589
28
15
22
33
1.95
72335468--72335953
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2.3
215
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16
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33
1.95
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2
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17
23
30
1.97
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59
0
58
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1.09
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0
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2.0
33
90
3
105
27
4
23
44
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72343857--72343908
24
2.2
24
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0
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55
9
1
32
1.43
72345828--72345879
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
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20
2.0
20
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53
0
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1.30
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2.0
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68
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20
1.27
72349331--72349388
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2.6
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6
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25
1.27
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1.9
18
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54
16
5
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1.12
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20
1.9
18
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56
16
5
2
75
1.10
72349583--72349643
21
2.8
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76
14
56
19
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1
72
1.16
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21
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18
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20
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19
2.6
19
86
6
62
51
4
2
42
1.33
72381530--72381566
16
2.3
16
85
0
56
70
0
2
27
1.01
72383055--72383165
37
2.8
38
75
14
100
36
18
17
27
1.93
72384029--72384093
4
15.5
4
83
12
69
1
26
3
69
1.12
72384120--72384194
7
10.6
7
78
16
66
52
1
2
44
1.23
72388266--72388411
68
2.1
68
98
0
283
44
4
17
34
1.67
72391576--72391607
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
72391576--72391606
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72397212--72397433
45
5.0
45
83
5
249
33
26
16
22
1.96
72399015--72399055
20
2.0
20
100
0
82
39
14
9
36
1.79
72399950--72400019
26
2.7
27
89
8
94
47
2
1
48
1.25
72400002--72400077
37
2.1
36
83
11
93
53
2
2
40
1.28
72399858--72400077
48
4.6
48
70
13
175
50
3
3
43
1.34
72400477--72400516
19
2.1
19
85
0
53
32
2
5
60
1.32
72403837--72403909
37
2.0
37
83
2
94
34
8
24
32
1.85
72405085--72405109
12
2.1
12
100
0
50
44
16
8
32
1.76
72407102--72407236
49
2.7
50
84
2
164
28
23
20
28
1.99
72411586--72411642
21
2.7
21
71
13
53
28
24
35
12
1.91
72427329--72427572
39
6.2
39
80
0
173
31
28
19
20
1.97
72427329--72427572
78
3.1
78
81
0
281
31
28
19
20
1.97
72427329--72427572
117
2.1
117
82
0
299
31
28
19
20
1.97
72431742--72431922
19
9.8
19
88
7
284
35
11
16
37
1.84
72431748--72431929
73
2.5
73
89
6
273
35
10
16
36
1.84
72431742--72431922
54
3.3
54
93
2
299
35
11
16
37
1.84
72437628--72437666
14
2.8
13
85
11
51
87
0
10
2
0.65
72437628--72437667
21
2.0
20
90
5
62
87
0
10
2
0.63
72438628--72439393
44
17.4
43
72
14
446
28
15
26
29
1.96
72438611--72438973
132
2.8
129
87
4
514
28
15
26
29
1.96
72438759--72439371
176
3.5
177
90
1
939
29
14
26
29
1.95
72438768--72439502
352
2.1
350
84
5
928
29
15
26
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72439416--72439733
44
7.1
45
72
9
161
31
15
24
28
1.96
72439416--72439691
134
2.1
134
90
0
435
30
16
24
28
1.96
72439423--72439619
44
4.4
45
73
11
170
30
18
22
27
1.97
72440133--72440276
19
7.8
19
85
7
199
36
10
16
36
1.83
72440139--72440283
54
2.7
55
88
4
215
37
10
16
35
1.83
72442016--72442119
45
2.3
45
83
6
122
25
25
17
31
1.97
72443430--72443514
30
2.8
30
87
5
109
36
7
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45
1.66
72443481--72443534
20
2.6
21
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8
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5
11
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1.62
72443803--72443837
18
1.9
18
94
0
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42
2
2
51
1.31
72448288--72448313
13
2.0
13
100
0
52
46
15
15
23
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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