Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr9
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  91122320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   

This is table  183  of  279  ( 33431 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60033243--60033268
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1
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0
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3.0
42
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12
27
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.0
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19
21
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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10
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3.0
57
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0
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24
13
9
52
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60180921--60180945
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2.8
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100
0
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52
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12
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1.72
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2.0
25
100
0
100
40
12
20
28
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72
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15
1.11
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0
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10
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2.0
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0
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0
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2.0
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100
0
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23
35
1.79
60294054--60294087
15
2.2
16
89
5
52
41
14
11
32
1.82
60309328--60309826
247
2.0
247
97
0
935
34
19
16
28
1.94
60309955--60310080
55
2.3
55
77
1
128
28
26
27
16
1.97
60317845--60317989
51
2.9
49
82
4
191
27
26
20
26
1.99
60325278--60325427
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
60325302--60325485
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
60329506--60329568
31
2.0
31
96
0
117
26
22
7
42
1.81
60330517--60330590
3
24.3
3
83
8
96
62
0
6
31
1.21
60332093--60332133
19
2.2
19
86
8
57
24
4
21
48
1.69
60332394--60333378
44
22.1
44
69
8
285
28
17
21
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60332447--60333598
224
5.2
224
88
1
1612
28
18
21
32
1.96
60335033--60335083
27
1.9
27
88
4
77
0
13
5
80
0.89
60335047--60335087
9
4.6
9
81
0
55
0
7
7
85
0.75
60340715--60340745
7
4.4
7
100
0
62
70
0
0
29
0.87
60340824--60340858
3
11.3
3
87
6
52
65
2
2
28
1.21
60341136--60341186
21
2.5
20
84
12
68
64
0
9
25
1.24
60344978--60345026
19
2.6
18
75
9
53
63
2
4
30
1.24
60344975--60345074
38
2.6
36
80
16
105
64
1
3
32
1.16
60345021--60345062
16
2.5
17
88
7
59
64
0
2
33
1.07
60345016--60345084
13
4.8
15
73
20
67
63
0
2
33
1.09
60345198--60345243
20
2.3
19
85
14
58
63
2
4
30
1.26
60346882--60347434
204
2.7
205
88
1
784
29
20
18
32
1.96
60355501--60355537
15
2.5
16
87
12
53
43
10
24
21
1.84
60355557--60355586
14
2.1
14
93
0
51
46
10
6
36
1.64
60359527--60359583
20
2.9
19
77
15
53
63
5
1
29
1.27
60359800--60359845
20
2.3
19
85
14
58
63
2
4
30
1.26
60358859--60360642
683
2.6
683
86
7
2215
53
5
8
32
1.53
60360215--60360284
18
3.8
18
68
25
56
57
1
5
35
1.32
60360272--60360320
19
2.6
18
75
9
53
63
2
4
30
1.24
60360269--60360368
38
2.6
36
80
16
105
64
1
3
32
1.16
60360315--60360356
16
2.5
17
88
7
59
64
0
2
33
1.07
60360310--60360378
13
4.8
15
73
20
67
63
0
2
33
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60360492--60360537
20
2.3
19
85
14
58
63
2
4
30
1.26
60362944--60363003
31
1.9
31
83
6
77
63
10
8
18
1.50
60365510--60365552
23
1.9
22
85
4
59
11
18
4
65
1.42
60366588--60366705
18
6.6
18
75
7
69
38
17
7
36
1.79
60366650--60366758
18
6.1
18
86
5
132
35
15
15
33
1.89
60369800--60369877
27
2.9
26
86
7
95
34
21
24
19
1.96
60371114--60371142
15
1.9
15
100
0
58
24
0
0
75
0.80
60371112--60371136
12
2.1
12
100
0
50
24
0
0
76
0.80
60373023--60373056
13
2.6
13
95
0
59
0
17
0
82
0.67
60373645--60373972
131
2.5
128
84
2
415
35
19
15
28
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279