Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr9
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  91122320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   

This is table  239  of  279  ( 33431 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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22
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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27
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100
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1.9
226
79
10
489
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5
6
55
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
16
0.64
77952324--77952546
75
3.0
75
92
0
356
28
16
21
34
1.94
77952526--77952560
14
2.5
14
90
0
52
20
17
2
60
1.49
77952615--77952658
14
3.2
14
90
3
63
20
11
4
63
1.44
77952526--77952746
103
2.2
103
85
5
288
27
15
14
42
1.86
77952629--77952906
86
3.2
86
82
7
346
26
17
17
37
1.93
77952826--77952970
74
2.0
74
88
0
218
28
19
20
31
1.97
77952829--77952986
74
2.1
74
84
3
210
29
18
18
32
1.95
77954564--77954637
14
5.3
14
75
19
57
33
4
1
60
1.24
77954688--77954729
3
14.0
3
80
9
50
35
2
2
59
1.23
77954832--77954929
23
4.2
23
75
16
85
31
3
6
59
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77954845--77954932
46
1.9
46
84
9
117
30
2
5
61
1.31
77955056--77955118
24
2.6
24
80
11
67
38
6
4
50
1.49
77955172--77955236
31
2.1
30
82
5
76
35
6
3
55
1.40
77955224--77955271
25
1.9
25
91
0
78
31
8
8
52
1.61
77955213--77955277
25
2.5
25
80
5
76
33
7
6
52
1.55
77958228--77958316
27
3.3
27
82
0
97
22
33
22
21
1.97
77958252--77958347
27
3.6
27
79
8
90
22
33
23
19
1.97
77959440--77959515
32
2.3
32
76
8
82
28
1
1
68
1.06
77959434--77959504
25
2.9
24
81
8
90
32
1
0
66
1.01
77959711--77959749
20
2.1
18
85
9
51
74
0
2
23
0.94
77960351--77960411
28
2.2
26
81
16
70
32
6
3
57
1.41
77960678--77960765
29
2.9
31
67
24
78
42
21
4
31
1.73
77960961--77961029
21
3.2
21
74
11
68
59
1
0
39
1.06
77962053--77962228
86
2.0
86
89
2
264
16
17
14
51
1.77
77963592--77963652
20
3.0
20
76
7
61
32
1
3
62
1.21
77963620--77963707
28
3.1
28
81
12
101
32
2
3
61
1.25
77963631--77963707
27
2.8
27
78
18
88
32
2
2
62
1.23
77963603--77963766
9
17.3
10
65
19
66
31
1
3
62
1.23
77963694--77963765
28
2.6
28
82
8
76
30
1
2
65
1.15
77963616--77963774
37
4.3
36
75
15
121
32
1
3
62
1.21
77965268--77965342
31
2.4
31
82
4
89
42
12
6
38
1.68
77966321--77966360
20
2.0
20
85
0
53
15
12
15
57
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77973485--77973525
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
77978484--77978533
26
2.0
25
88
7
75
62
4
0
34
1.14
77978516--77978544
12
2.4
12
100
0
58
68
6
0
24
1.13
77980054--77980108
21
2.7
21
71
20
53
34
3
12
49
1.59
77990469--77990494
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
77991260--77991285
12
2.2
12
100
0
52
15
0
15
69
1.20
77996379--77996428
26
1.9
26
87
0
73
36
24
22
18
1.95
78012739--78012811
35
2.1
34
94
2
128
32
24
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1.94
78016729--78016778
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2.0
24
84
7
64
62
6
0
32
1.20
78017474--78017595
55
2.2
55
83
0
154
18
26
28
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          273   274   275   276   277   278   279