Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr9
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  91122320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   

This is table  236  of  279  ( 33431 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77168164--77168244
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indels
Score
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77221261--77221328
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1.96
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Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Entropy
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22
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2.5
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80
6
90
27
3
18
50
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77295727--77295765
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0
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4.1
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60
0
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1.00
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1
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2.8
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1
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1.37
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2.0
43
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1.97
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11
11
1.73
77318650--77318716
29
2.3
30
87
7
111
44
20
8
23
1.80
77320315--77320456
27
5.3
26
83
4
131
33
21
24
19
1.97
77320315--77320451
54
2.5
54
83
2
150
33
21
24
20
1.97
77322073--77322182
26
4.2
26
94
2
168
36
23
4
35
1.76
77322741--77322806
33
2.0
33
96
0
123
51
16
9
22
1.72
77323807--77323931
41
3.0
40
83
4
124
26
16
15
41
1.88
77323928--77323966
18
2.2
18
86
9
53
17
0
2
79
0.84
77324077--77324117
7
5.7
7
91
5
64
21
0
2
75
0.92
77324068--77324118
7
6.8
8
93
4
63
19
0
3
76
0.94
77324671--77324717
21
2.2
22
84
3
60
42
42
2
12
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77324755--77324799
14
3.2
14
87
6
65
51
24
0
24
1.49
77328500--77328624
41
3.0
40
83
4
124
26
16
15
41
1.88
77328621--77328659
18
2.2
18
86
9
53
17
0
2
79
0.84
77328770--77328810
7
5.7
7
91
5
64
21
0
2
75
0.92
77328761--77328811
7
6.8
8
93
4
63
19
0
3
76
0.94
77329367--77329413
21
2.2
22
84
3
60
42
42
2
12
1.55
77329451--77329495
14
3.2
14
87
6
65
51
24
0
24
1.49
77329767--77329867
40
2.6
38
83
7
114
27
21
23
26
1.99
77330033--77330064
11
2.9
11
95
0
55
37
40
0
21
1.54
77330492--77330979
115
4.2
115
92
1
764
31
20
20
27
1.98
77330965--77330994
12
2.5
12
94
0
51
53
30
10
6
1.60
77335608--77335678
35
2.0
35
100
0
142
28
8
16
46
1.76
77342797--77342824
7
4.0
7
100
0
56
14
0
0
85
0.59
77349227--77349259
13
2.4
14
90
5
50
54
3
0
42
1.15
77350214--77350252
15
2.4
17
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8
55
61
2
0
35
1.10
77352538--77352604
18
3.8
18
78
5
66
56
0
1
41
1.08
77353281--77353311
15
2.0
16
93
6
55
3
12
0
83
0.75
77363842--77364013
88
2.0
88
96
0
317
43
8
10
37
1.70
77371588--77371621
14
2.4
14
100
0
68
55
0
20
23
1.43
77378704--77378830
42
3.0
42
86
6
170
29
26
14
29
1.95
77378789--77378912
47
2.7
46
86
2
167
29
27
16
27
1.97
77378930--77379078
31
4.8
31
93
0
244
26
26
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77379054--77379230
50
3.5
50
93
3
293
25
22
15
35
1.94
77387482--77387520
19
2.0
21
85
10
55
12
2
15
69
1.30
77390849--77390893
22
2.0
23
86
4
65
44
0
0
55
0.99
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28
2.0
28
89
6
87
52
0
0
47
1.00
77391114--77391205
46
2.0
44
85
8
123
38
25
5
31
1.78
77391184--77391234
16
3.2
16
82
0
75
27
23
5
43
1.77
77391787--77391881
13
6.4
14
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23
52
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3
3
47
1.34
77391840--77391876
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16
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0
0
59
0.97
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15
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49
1
1
48
1.17
77391917--77391948
16
1.9
17
93
6
57
37
0
0
62
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279