Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr9
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  91122320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   

This is table  276  of  279  ( 33431 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.23
Indices
Period
Size
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Number
Consensus
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Score
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
71
30
17
27
25
1.97
90304158--90304197
6
6.7
6
85
0
53
20
5
12
62
1.48
90304158--90304311
12
12.8
12
75
6
73
24
9
12
54
1.66
90304158--90304203
18
2.6
18
82
0
56
21
6
10
60
1.52
90304216--90304305
6
15.0
6
88
0
72
23
6
14
55
1.62
90304772--90304811
15
2.7
15
84
0
53
20
10
32
37
1.85
90306475--90306572
40
2.5
40
89
3
153
23
10
20
45
1.81
90306552--90306611
29
2.1
28
84
6
77
21
6
16
55
1.64
90308010--90308095
36
2.3
36
84
4
109
44
23
10
22
1.83
90308038--90308114
36
2.1
36
85
4
102
49
22
9
19
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90308447--90308483
19
1.9
19
88
0
56
2
37
0
59
1.12
90309902--90309961
28
2.1
28
82
11
70
30
3
3
63
1.27
90318252--90318414
81
2.0
81
87
0
236
37
17
17
27
1.92
90320746--90320809
33
1.9
33
96
0
119
15
9
42
32
1.79
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24
3.2
23
71
13
67
52
7
0
40
1.29
90336176--90336209
17
2.0
17
100
0
68
58
17
0
23
1.38
90340157--90340329
83
2.1
85
86
6
264
42
13
16
27
1.86
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141
2.4
139
75
9
367
41
14
16
26
1.87
90340408--90340521
58
1.9
59
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1
167
46
16
15
21
1.84
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103
2.4
104
91
3
409
29
28
21
20
1.98
90345784--90345832
21
2.3
20
80
10
53
65
0
14
20
1.27
90348353--90348714
142
2.6
141
86
5
511
32
18
14
35
1.90
90348606--90348814
101
2.1
102
85
6
282
35
14
11
39
1.81
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244
2.0
243
85
5
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33
16
13
35
1.88
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105
1.8
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253
39
13
13
34
1.83
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9
8.0
8
82
11
73
14
1
2
80
0.90
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9
9.2
9
76
12
66
14
2
3
80
0.95
90349936--90350002
17
4.0
16
79
13
73
14
1
2
80
0.90
90349926--90350002
13
5.8
13
74
17
59
14
2
2
80
0.93
90349926--90350017
37
2.5
37
77
8
91
16
2
3
78
0.98
90349937--90350016
13
6.0
13
77
11
65
15
1
3
80
0.92
90349940--90350010
23
3.1
23
75
13
65
14
1
4
80
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90350065--90350145
35
2.3
35
83
6
103
39
2
2
55
1.26
90350148--90350176
14
2.1
14
100
0
58
51
0
0
48
1.00
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21
2.0
20
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35
0
2
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1.09
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163
2.7
163
97
1
805
41
2
2
53
1.26
90350311--90350339
14
2.1
14
100
0
58
51
0
0
48
1.00
90350370--90350411
21
2.0
20
90
4
66
35
0
2
61
1.09
90350357--90350545
36
5.3
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77
15
147
40
1
2
55
1.24
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1
2
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1.23
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2.1
12
100
0
50
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0
0
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0.99
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19
2.7
19
87
6
68
43
0
0
56
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279