Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr3 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 100348136

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  168  of  290  ( 34714 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
42
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15
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32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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28
1.97
57663246--57663426
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2.2
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82
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220
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28
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1.99
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2.2
120
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82
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220
25
27
22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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224
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1.95
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220
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243
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22
31
15
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
29
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27
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2.00
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24
19
25
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1.98
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139
1.9
139
86
1
375
23
20
26
29
1.99
57833818--57833988
43
4.0
43
78
6
184
32
27
15
24
1.96
57837048--57837231
40
4.6
39
79
9
185
25
23
27
23
2.00
57837103--57837254
79
1.9
79
82
7
193
27
21
26
25
1.99
57840891--57840989
40
2.4
40
81
6
108
26
18
26
29
1.98
57841998--57842026
12
2.3
13
94
5
51
27
31
24
17
1.97
57848275--57848901
208
3.0
208
88
3
875
35
16
24
23
1.94
57848497--57848901
108
3.7
108
95
0
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34
16
26
22
1.95
57853267--57853374
26
4.2
26
89
0
171
33
6
23
37
1.80
57854972--57855031
27
2.2
27
88
5
86
18
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25
35
1.96
57862522--57862546
13
1.9
13
100
0
50
40
24
4
32
1.73
57869609--57869740
47
2.8
48
87
3
187
23
14
28
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57870462--57870517
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2.6
22
76
15
55
26
10
23
39
1.87
57873439--57873469
12
2.6
12
94
0
53
9
16
6
67
1.39
57873472--57873510
18
2.1
19
85
4
53
17
28
2
51
1.59
57876104--57876198
48
2.0
48
89
0
145
29
21
21
28
1.98
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6
7.5
6
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0
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4
0
82
0.82
57885493--57885539
24
2.0
24
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0
85
12
6
0
80
0.88
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2.2
13
100
0
58
31
0
13
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1.39
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4.5
48
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6
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26
19
29
24
1.98
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2.0
48
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2
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29
18
22
29
1.97
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16
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0
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22
0
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2.0
20
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1.54
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33
1.96
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4.8
55
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11
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21
26
17
34
1.95
57920218--57920248
16
1.9
16
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0
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0
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57920215--57920254
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2.0
20
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0
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22
0
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1.54
57920417--57920671
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265
21
25
18
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1.95
57920464--57920661
108
1.8
110
89
4
312
22
25
17
33
1.96
57923303--57923334
4
8.0
4
92
0
55
21
0
28
50
1.49
57929294--57929436
38
3.6
38
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14
196
34
16
24
24
1.95
57929332--57929598
46
5.7
46
83
7
315
38
16
24
21
1.93
57929424--57929448
12
2.1
12
100
0
50
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16
24
24
1.94
57929859--57929905
25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57930910--57930988
19
4.2
19
90
9
126
37
10
16
35
1.82
57930900--57930987
36
2.4
36
80
17
119
38
10
15
35
1.82
57934345--57934385
23
1.9
21
85
14
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53
0
21
24
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57934715--57934764
15
3.3
15
82
0
73
36
2
12
50
1.51
57935145--57935230
21
3.9
23
79
10
90
16
20
24
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1.93
57935392--57935432
19
2.2
19
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0
21
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57935519--57935551
17
1.9
17
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0
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1.74
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14
2.1
14
93
0
51
36
6
10
46
1.64
57948421--57948915
200
2.4
201
93
2
832
30
17
22
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290