Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr3 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 100348136

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  73  of  290  ( 34714 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24065012--24065234
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19
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1.98
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18
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1.98
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2.5
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0
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3.2
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2.0
25
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2.0
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2.3
23
83
0
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40
20
16
22
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
1.96
24187565--24187720
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1.9
81
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233
29
28
15
26
1.96
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2.3
60
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19
30
1.98
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28
3.4
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25
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28
1.99
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2.3
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28
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2.00
24197377--24197561
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4.7
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216
24
22
28
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2.00
24197430--24197594
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2.1
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2.00
24205020--24205183
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4.1
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27
24
2.00
24205020--24205170
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27
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2.00
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4.0
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207
17
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22
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1.95
24221925--24222092
54
3.1
53
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230
17
24
22
35
1.95
24221925--24222110
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2.3
80
85
4
248
18
24
21
35
1.95
24221936--24222110
27
6.5
26
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160
18
25
21
35
1.95
24224791--24224824
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2.9
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61
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8
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1.54
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153
35
14
23
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
180
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30
1.84
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2.6
44
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13
22
27
1.92
24253932--24254065
46
3.0
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82
4
153
35
14
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26
1.93
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2.0
30
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18
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18
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17.8
27
85
0
566
43
20
13
22
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24297225--24297324
23
4.4
21
80
15
103
23
21
21
35
1.96
24297219--24297313
45
2.1
47
88
7
142
20
23
21
35
1.96
24297225--24297329
45
2.3
45
84
11
133
21
20
20
37
1.95
24297500--24297577
20
3.9
19
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75
34
11
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1.83
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120
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15
39
1.80
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143
25
17
26
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1.97
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31
23
22
23
1.98
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2.2
25
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1
1
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20
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25
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0
0
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23
2.2
23
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3
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15
15
26
42
1.87
24323783--24323845
32
2.0
32
100
0
126
44
17
19
19
1.87
24325185--24325357
48
3.6
48
88
0
247
28
17
27
25
1.98
24325185--24325392
48
4.3
48
86
1
220
29
18
25
26
1.98
24333862--24333904
20
2.2
20
83
8
52
37
25
4
32
1.77
24346794--24346854
27
2.3
27
85
0
77
40
18
14
26
1.89
24347700--24347987
56
5.1
56
97
0
549
45
9
22
22
1.81
24349116--24349300
79
2.3
81
83
7
218
25
22
27
24
2.00
24349116--24349300
40
4.6
40
82
5
200
25
22
27
24
2.00
24349169--24349333
79
2.1
79
83
6
201
26
20
27
25
1.99
24353551--24353723
46
3.7
46
75
13
183
30
26
20
23
1.98
24353549--24353742
46
4.2
47
71
12
150
29
27
19
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24354145--24354204
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
24361908--24362323
203
2.0
203
90
0
643
28
12
31
27
1.93
24363570--24363609
21
1.9
21
84
0
53
30
10
25
35
1.88
24364006--24364039
18
1.9
18
88
5
52
20
23
41
14
1.89
24364099--24364196
28
3.6
26
79
8
88
25
14
31
28
1.95
24371507--24371583
25
3.1
25
74
7
84
27
20
22
29
1.98
24371502--24371608
50
2.1
50
84
3
144
28
23
20
27
1.99
24371514--24371597
25
3.4
24
71
12
71
28
22
21
27
1.99
24374086--24374256
93
1.8
93
94
0
306
28
28
21
21
1.98
24374081--24374253
46
3.7
46
77
13
201
29
27
20
21
1.98
24384937--24384995
29
2.0
29
93
0
100
32
10
22
35
1.87
24397582--24397732
43
3.5
43
84
3
180
27
14
23
33
1.94
24405607--24405718
51
2.2
50
93
1
188
33
16
22
26
1.96
24426377--24426407
12
2.6
12
94
0
53
29
38
19
12
1.89
24428870--24429023
27
5.8
26
74
11
98
40
21
9
29
1.84
24429001--24429115
27
4.4
27
79
6
137
33
20
20
24
1.97
24429251--24429333
27
3.1
27
82
3
98
22
21
19
36
1.95
24429491--24429557
28
2.4
28
82
2
73
22
19
23
34
1.97
24429525--24429652
33
3.9
33
77
7
134
25
20
25
28
1.99
24437644--24437795
27
5.6
27
91
3
223
26
13
28
31
1.94
24437644--24437795
55
2.8
55
91
0
241
26
13
28
31
1.94
24449056--24449112
25
2.3
25
87
0
78
36
24
15
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24461296--24461461
46
3.6
45
77
12
144
29
18
28
23
1.97
24461434--24461609
50
3.6
49
77
8
155
26
19
29
23
1.99
24463159--24463296
43
3.2
44
79
4
165
26
14
25
34
1.94
24465476--24465595
25
4.8
25
75
5
109
37
22
16
23
1.94
24467938--24468048
55
2.0
55
96
0
204
34
10
22
32
1.89
24468152--24468327
46
3.8
46
74
11
162
22
20
27
29
1.99
24468149--24468320
93
1.8
93
87
2
256
23
20
27
28
1.99
24475208--24475273
26
2.5
27
76
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66
24
9
18
48
1.76
24482935--24483054
61
2.0
60
95
1
206
30
7
34
26
1.84
24491201--24491233
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290