Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr3 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 100348136

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  214  of  290  ( 34714 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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53
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20
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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40
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
1.9
21
84
5
53
41
10
10
38
1.73
74168756--74168793
18
2.2
18
90
9
62
21
5
2
71
1.19
74170722--74170781
20
3.0
20
100
0
120
35
0
35
30
1.58
74174318--74174488
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
74174310--74174485
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
74193065--74193110
16
2.9
16
90
0
74
36
2
26
34
1.69
74193270--74193449
59
2.9
60
86
8
222
53
2
2
42
1.25
74194151--74194203
25
2.1
25
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0
97
28
28
13
30
1.94
74198499--74198656
40
4.0
40
92
0
262
29
27
19
24
1.98
74203505--74203570
34
2.0
34
84
3
89
25
27
21
25
1.99
74211755--74211973
40
5.5
40
96
1
388
23
23
27
25
2.00
74219642--74219712
36
2.0
36
97
0
133
35
14
25
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74220350--74220386
18
2.2
18
85
9
51
37
8
16
37
1.78
74233074--74233287
47
4.6
47
76
11
158
28
18
28
24
1.98
74239453--74239657
53
3.8
54
74
3
189
18
25
17
38
1.92
74247775--74247816
16
2.4
17
81
14
50
16
4
4
73
1.17
74257905--74258139
118
2.0
118
94
0
416
37
15
8
38
1.79
74263308--74263457
75
2.0
75
97
0
282
31
15
20
32
1.94
74268202--74268253
23
2.3
22
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9
23
1
65
1.32
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4.2
6
100
0
50
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0
0
16
0.63
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23
2.4
22
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20
56
9
18
1
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1.25
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20
2.7
20
70
0
54
33
20
25
20
1.97
74277537--74277568
12
2.7
12
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0
55
18
21
0
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1.38
74277550--74277611
27
2.3
27
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10
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9
19
1
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1.25
74277574--74277693
12
10.0
12
69
19
63
8
17
3
70
1.25
74277552--74277610
14
4.3
14
74
16
52
10
16
1
71
1.22
74277572--74277679
6
17.7
6
69
9
67
6
17
3
72
1.21
74278763--74278787
12
2.1
12
100
0
50
16
0
8
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1.02
74278864--74278894
11
2.7
12
95
5
55
6
3
6
83
0.88
74280106--74280179
37
2.0
37
97
0
139
52
13
12
21
1.72
74281059--74281110
23
2.3
22
75
21
54
9
23
1
65
1.32
74281104--74281142
18
2.2
18
85
0
51
12
23
2
61
1.43
74285294--74285424
38
3.2
38
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17
118
30
24
13
31
1.94
74285339--74285464
48
2.7
47
87
3
173
30
23
14
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74288167--74288208
15
2.8
15
88
0
66
52
14
16
16
1.75
74289241--74289288
25
1.9
25
95
0
87
37
8
18
35
1.81
74294669--74294760
42
2.2
42
94
3
159
32
20
14
32
1.92
74295762--74295826
27
2.4
27
82
5
78
21
24
18
35
1.96
74295880--74296121
27
8.9
27
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123
30
9
19
41
1.83
74295970--74296126
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2.9
54
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149
29
10
19
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1.86
74296125--74296322
27
7.3
27
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2
218
39
8
23
29
1.83
74296125--74296322
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2.4
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1
281
39
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1.83
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3.1
54
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0
240
40
8
23
27
1.84
74296168--74296342
81
2.2
81
88
0
251
39
9
21
29
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290