Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr3 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 100348136

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  2  of  290  ( 34714 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
343145--343229
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2.0
42
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0
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20
17
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354209--354325
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2.7
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1.92
357897--357933
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4.5
8
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6
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10
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1.89
357883--357937
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2.2
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3
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25
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23
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3.9
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29
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375763--375925
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2.0
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220
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238
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0
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223
24
21
28
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1.99
401033--401215
79
2.3
80
80
1
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20
28
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0
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2.0
21
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7
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0
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22
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11
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2
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1.9
28
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2.0
50
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0
180
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0
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299
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18
27
26
1.98
456429--456748
97
3.3
98
88
3
425
27
18
27
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
456429--456748
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144
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18
27
26
1.98
464245--464405
27
6.0
27
90
0
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21
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1.9
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1.95
464901--465070
6
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18
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2.6
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0
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19
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2.6
25
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0
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1.84
464901--465058
62
2.5
62
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0
271
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18
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464901--465070
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5.5
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10
150
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18
14
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1.82
464989--465070
37
2.2
37
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19
13
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5.7
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262
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19
27
25
1.99
466940--467217
97
2.9
97
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375
27
19
27
25
1.99
466942--467215
146
1.9
145
83
6
358
27
19
27
25
1.99
467852--467880
14
2.1
14
100
0
58
27
0
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469574--469624
26
2.0
26
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39
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480328--480472
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40
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10
172
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27
23
24
2.00
484109--484437
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2.0
164
100
0
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12
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2.8
42
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2
123
23
17
25
33
1.96
490333--490371
22
1.9
20
85
15
53
15
33
17
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492878--492974
39
2.5
38
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25
25
22
25
2.00
498358--498386
14
2.0
15
93
6
51
27
0
20
51
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
27
24
2.00
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1.98
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1.9
93
93
0
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1.98
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1.9
13
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0
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16
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21
27
1.98
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0
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20
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23
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0
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19
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0
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145
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1.97
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18
30
22
1.97
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46
3.7
46
77
7
166
29
19
29
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
576809--577066
46
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14
161
29
18
29
22
1.98
576809--577108
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6.4
47
75
11
176
29
18
29
23
1.98
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1.9
20
89
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60
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20
33
1.74
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18
2.2
18
90
9
60
32
2
5
59
1.34
589895--589993
51
1.9
51
97
0
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25
23
1.81
603012--603071
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2.0
30
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41
3
25
30
1.71
603535--603661
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1.9
68
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6
177
33
14
27
23
1.94
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29
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15
100
0
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26
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0
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18
27
23
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80
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21
27
25
1.99
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40
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25
21
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1.99
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25
21
27
26
1.99
640099--640276
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
640120--640275
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
658372--658882
49
10.7
48
73
13
346
26
20
29
23
1.99
658510--658837
98
3.3
98
100
0
656
26
20
29
23
1.99
661765--661843
23
3.5
22
70
17
63
36
20
18
24
1.95
662691--662788
52
1.9
51
87
6
144
29
9
17
43
1.80
662695--662799
52
2.0
52
85
3
140
28
7
16
47
1.73
667032--667242
40
5.3
40
83
7
225
25
23
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
667032--667242
79
2.7
79
82
5
275
25
23
26
24
2.00
675239--675353
27
4.3
27
87
9
155
34
22
23
19
1.96
679546--679624
28
2.8
28
82
0
95
32
12
26
27
1.93
686396--686485
28
3.3
28
84
4
112
36
21
21
21
1.95
688453--688510
28
2.1
27
80
3
62
58
18
3
18
1.53
698730--698913
67
2.8
64
77
10
187
29
17
29
23
1.97
707485--707739
55
4.8
53
77
9
220
21
24
17
36
1.95
707532--707730
108
1.8
110
84
4
278
23
24
17
34
1.95
713683--713717
18
1.9
18
100
0
70
31
17
17
34
1.93
731766--731810
19
2.4
19
89
10
67
42
4
8
44
1.56
731848--731931
42
2.0
42
90
0
132
27
13
14
45
1.81
737451--737604
42
3.6
42
78
3
166
30
22
14
31
1.94
739267--739312
19
2.5
19
89
10
69
41
4
8
45
1.55
748643--748911
46
5.7
49
73
13
174
27
19
30
23
1.98
751018--752017
54
18.5
54
96
0
1779
23
22
15
38
1.92
751975--752208
95
2.5
89
75
10
216
22
25
17
34
1.96
751980--752207
47
4.9
46
72
7
156
22
25
17
33
1.96
754069--754128
28
2.1
28
93
0
102
18
20
46
15
1.84
756847--756889
20
2.3
18
81
14
52
41
0
20
37
1.53
762394--762571
89
2.0
89
97
0
338
20
24
19
35
1.96
764585--764629
21
2.1
22
84
12
58
28
20
2
48
1.61
765792--765824
7
4.7
7
92
0
57
27
0
12
60
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
766442--766483
18
2.3
18
87
0
57
19
28
7
45
1.76
766730--766774
21
2.1
21
95
4
81
35
44
15
4
1.67
766730--766785
21
2.6
21
86
8
78
30
46
17
5
1.71
767032--767062
9
3.6
9
91
8
55
35
0
0
64
0.94
770096--770933
125
6.7
126
92
3
1324
28
18
15
38
1.91
771255--771293
15
2.5
16
87
4
53
48
35
0
15
1.45
771154--771688
154
3.5
154
99
0
1061
39
22
2
35
1.69
771409--771447
15
2.5
16
87
4
53
48
35
0
15
1.45
771563--771601
15
2.5
16
87
4
53
48
35
0
15
1.45
771607--772198
114
5.2
114
98
0
1130
36
19
4
40
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290