Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  10  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2858232--2858316
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2.6
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2858232--2858309
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1.9
68
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1.50
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12
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2868759--2868799
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2.3
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1.9
16
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0
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0
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2.0
65
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0
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20
24
24
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2886803--2886975
41
4.2
41
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0
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0
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20
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2.8
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2.0
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2.1
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2.1
16
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59
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21
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28
1.80
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39
2.1
39
81
13
94
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1
2
37
1.19
2947124--2947180
19
3.0
18
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10
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5
1
31
1.28
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2.2
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110
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1
2
63
1.19
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92
1.9
91
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247
43
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1.9
13
100
0
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114
1.9
114
94
0
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17
6
41
1.76
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2.7
62
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167
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3
10
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2.0
13
100
0
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30
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0
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2.3
13
94
5
51
68
0
0
31
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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99
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4
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16
2.1
16
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0
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2
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2.0
70
91
0
222
32
25
22
19
1.97
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505
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21
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22
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0
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0
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21
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1
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9
14.6
9
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2
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1.64
2976736--2976870
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2
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2
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21
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0
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2
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142
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24
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1.99
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1
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2.0
44
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0
165
41
24
11
22
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3005206--3005326
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29
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2.1
29
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0
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10
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1.89
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21
2.5
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10
3
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1.53
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50
1.9
50
100
0
194
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16
10
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2.0
21
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0
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0
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0
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25
2.4
25
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61
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12
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14
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0
80
25
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24
2.2
24
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90
35
14
12
37
1.85
3055798--3055959
25
6.5
25
71
7
114
25
19
19
34
1.96
3055813--3055952
50
2.8
49
76
6
156
26
20
17
35
1.95
3065664--3065860
102
1.9
102
92
0
331
40
12
10
36
1.78
3066274--3066329
25
2.2
26
96
3
105
32
14
19
33
1.92
3067347--3067421
37
2.0
38
84
2
98
24
25
28
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3070520--3070562
21
2.0
21
86
0
59
16
16
18
48
1.81
3070541--3070640
40
2.5
40
83
1
130
13
19
26
42
1.87
3076788--3076869
42
2.0
42
97
0
155
35
17
3
43
1.66
3077022--3077078
8
7.1
8
76
21
57
49
0
0
50
1.00
3077022--3077080
30
1.9
32
89
6
95
50
0
0
49
1.00
3079075--3079100
11
2.4
11
100
0
52
15
0
7
76
0.99
3079289--3079531
41
5.9
40
77
11
199
37
22
16
23
1.93
3079290--3079531
82
2.9
79
83
7
243
38
22
15
23
1.93
3079304--3079531
123
1.9
123
82
3
289
37
22
15
24
1.93
3079672--3079713
11
3.8
11
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0
75
26
9
0
64
1.24
3079672--3079721
22
2.2
22
89
3
73
24
8
0
68
1.16
3081247--3081353
40
2.7
39
81
8
117
28
20
24
26
1.99
3091993--3092095
31
3.4
29
78
8
116
53
5
1
38
1.36
3093809--3093937
64
2.0
64
90
3
206
30
16
14
38
1.89
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177
2.2
177
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0
601
29
20
22
26
1.99
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24
2.1
24
100
0
102
19
11
11
56
1.65
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16
2.5
16
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55
35
0
2
62
1.09
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126
2.5
126
84
1
408
27
15
18
38
1.91
3099506--3099540
12
2.9
12
87
12
54
57
0
0
42
0.99
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4
8.5
4
100
0
68
50
0
23
26
1.50
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13
2.0
13
100
0
52
23
0
30
46
1.53
3117820--3117955
49
2.8
49
94
0
227
28
27
19
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3122835--3122933
40
2.5
40
79
12
125
16
16
25
42
1.88
3133704--3133896
9
20.6
9
68
18
74
63
2
2
32
1.20
3133770--3133927
10
16.2
10
68
20
68
63
3
2
31
1.23
3133777--3133868
19
4.8
20
78
7
84
64
3
3
29
1.25
3133865--3133959
39
2.5
39
75
11
97
62
2
3
32
1.23
3134151--3134200
19
2.8
17
85
11
64
34
2
0
64
1.05
3134157--3134192
18
1.9
19
94
5
65
36
2
0
61
1.11
3134225--3134427
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2.3
90
80
1
239
34
8
18
37
1.82
3136701--3136770
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2.3
31
85
5
88
22
2
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1.69
3136818--3136859
22
1.9
22
85
9
59
4
16
0
78
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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