Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  191  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.92
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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56
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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59
66
3
2
27
1.20
59944933--59945031
51
1.9
51
80
11
114
57
2
5
35
1.32
59947212--59947242
12
2.6
12
94
0
53
35
29
35
0
1.58
59947397--59947508
33
3.4
33
79
11
122
17
43
11
26
1.84
59950947--59950995
18
2.8
17
77
22
57
4
34
0
61
1.15
59951097--59951153
27
2.1
27
83
0
69
28
22
26
22
1.99
59954533--59954595
31
2.0
31
100
0
126
39
12
12
34
1.82
59955595--59955785
18
10.6
18
73
10
140
37
15
12
34
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59955595--59955797
54
3.8
54
75
6
178
36
15
12
34
1.85
59956043--59956067
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
59961408--59961703
18
16.1
18
70
12
145
36
15
12
35
1.85
59961898--59961922
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
59965248--59965407
32
5.0
32
89
0
248
33
11
10
45
1.73
59967415--59967467
21
2.5
21
93
0
88
30
35
9
24
1.87
59969356--59969390
18
1.9
18
88
0
52
48
0
0
51
1.00
59969349--59969409
22
2.8
22
78
7
70
47
1
1
49
1.21
59969703--59969846
71
2.0
71
100
0
288
38
19
9
31
1.84
59975065--59975129
31
2.1
31
91
0
103
40
9
16
33
1.81
59976770--59976797
5
5.6
5
100
0
56
17
21
39
21
1.93
59976759--59976798
15
2.6
16
84
11
57
15
20
45
20
1.86
59977040--59977069
15
2.0
15
93
0
51
43
0
23
33
1.54
59977588--59977645
29
2.0
29
86
0
80
5
24
17
53
1.64
59979548--59979601
26
2.1
26
92
0
90
35
7
14
42
1.74
59980597--59980685
42
2.1
42
83
2
108
21
8
40
29
1.83
59984197--59984303
53
2.0
53
87
3
153
25
11
26
37
1.89
59984250--59984369
47
2.6
46
84
7
138
25
12
25
36
1.91
59984291--59984376
44
1.9
45
88
2
129
22
15
31
31
1.94
59986917--59987288
130
2.9
130
82
1
442
29
18
17
34
1.94
59990874--59990925
21
2.5
21
96
3
97
26
19
9
44
1.81
59999121--59999492
44
8.5
44
91
0
555
29
14
28
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60003604--60003635
2
16.0
2
93
0
55
53
0
0
46
1.00
60006108--60006194
36
2.3
37
84
5
104
26
3
25
44
1.70
60006334--60006376
14
3.3
14
81
15
56
34
0
9
55
1.32
60015390--60015430
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
60031731--60031759
13
2.1
14
93
6
51
51
0
3
44
1.18
60032271--60032334
31
2.0
32
85
8
87
45
0
7
46
1.32
60033259--60033303
15
3.0
15
80
0
63
40
0
13
46
1.43
60033807--60033880
19
4.2
19
69
20
63
45
4
21
28
1.70
60033823--60033888
33
2.0
33
100
0
132
45
9
18
27
1.79
60035080--60035209
60
2.2
60
87
5
183
26
24
20
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250