Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  238  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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128
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34
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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5
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0
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
68
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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37
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1.90
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100
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0
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15
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1.80
73757002--73757029
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
73761066--73761103
17
2.2
18
90
4
60
18
5
10
65
1.41
73770242--73770283
16
2.7
16
85
3
50
16
4
7
71
1.26
73770414--73770468
17
3.1
17
75
17
58
36
0
1
61
1.06
73770414--73770462
9
5.3
10
80
11
52
36
0
2
61
1.08
73770434--73770510
39
2.0
39
82
10
95
40
0
3
55
1.18
73770996--73771085
40
2.2
40
88
5
137
51
5
1
42
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73771626--73771652
14
1.9
14
100
0
54
70
14
0
14
1.17
73775823--73775891
22
3.1
21
70
25
61
27
1
13
57
1.44
73778601--73778649
25
2.0
25
84
4
64
40
2
18
38
1.62
73779384--73779437
20
2.6
21
82
11
67
35
0
7
57
1.27
73779427--73779454
11
2.5
11
100
0
56
28
0
0
71
0.86
73781536--73782068
46
11.6
46
89
2
788
39
14
23
22
1.90
73781537--73781608
21
3.2
21
65
14
54
40
9
23
26
1.85
73781546--73782068
137
3.8
137
91
2
818
39
14
23
22
1.90
73781531--73782058
183
2.9
183
89
3
794
39
14
23
22
1.91
73783429--73783462
5
6.8
5
100
0
68
20
0
0
79
0.73
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21
2.2
21
92
0
74
32
28
13
26
1.93
73793109--73793133
10
2.5
10
100
0
50
0
0
8
92
0.40
73793359--73793432
21
3.3
21
75
16
69
29
1
1
67
1.07
73793469--73793603
71
1.9
71
85
0
189
46
17
14
22
1.83
73802786--73802865
37
2.2
37
97
0
151
43
12
11
32
1.78
73805740--73805785
23
2.0
23
84
12
60
32
2
4
60
1.28
73805746--73805802
28
2.1
28
90
3
89
36
0
5
57
1.21
73806192--73806253
27
2.2
28
82
2
72
32
1
3
62
1.20
73806260--73806301
20
2.2
19
86
4
57
35
4
2
57
1.33
73813297--73813355
15
3.9
15
84
8
84
54
13
15
16
1.72
73813296--73813354
30
2.0
30
93
0
100
54
13
15
16
1.72
73821140--73821190
25
2.1
25
96
3
95
15
27
23
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73827455--73827492
20
1.9
20
88
0
58
13
23
26
36
1.91
73829194--73829231
20
1.9
20
88
0
58
13
23
26
36
1.91
73830935--73830972
20
1.9
20
88
0
58
13
23
26
36
1.91
73846138--73846184
21
2.2
21
80
0
58
46
31
2
19
1.61
73846602--73846629
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
73847619--73847667
20
2.3
20
79
10
53
40
2
6
51
1.38
73876347--73876509
35
4.7
35
84
1
211
30
11
25
32
1.91
73877867--73877954
35
2.5
35
81
7
124
28
26
18
27
1.98
73879922--73879965
21
2.1
21
87
8
63
34
9
2
54
1.44
73881735--73881784
25
2.0
25
92
7
84
38
20
28
14
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250