Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  22  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6319923--6319955
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0
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0
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0
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6335238--6335290
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2.5
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6335567--6335608
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30
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2.0
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0
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1.9
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0
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0
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1.00
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1
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1.30
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2.0
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6386958--6387004
20
2.3
20
85
7
60
38
10
21
29
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6387054--6387112
26
2.3
26
88
11
88
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18
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1.98
6387054--6387122
25
2.7
25
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24
1.99
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1.9
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2.0
23
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6397655--6397756
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2.2
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20
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2.0
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14
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2.1
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218
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1.8
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93
0
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28
29
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21
1.98
6427200--6427375
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3.8
46
79
10
205
28
29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
2.0
22
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2.0
16
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0
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0
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2
0
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0
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0
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3
68
38
0
11
50
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6515231--6515316
23
4.0
23
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13
22
25
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6515243--6515316
20
3.5
22
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12
82
12
21
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2.3
15
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50
51
0
6
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1.26
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12
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18
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2
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19
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1.85
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17
13
43
1.86
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2.1
41
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2
138
34
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19
1.96
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18
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50
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50
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0
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26
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1.99
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0
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0
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100
0
136
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28
2.1
28
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3
77
31
6
9
52
1.60
6553821--6553854
13
2.6
13
85
0
50
41
0
0
58
0.98
6553843--6553884
15
2.8
16
82
13
54
54
0
0
45
0.99
6553909--6553960
15
3.2
15
73
19
50
53
1
0
44
1.11
6568174--6568230
12
4.8
12
77
0
51
5
54
3
36
1.40
6570985--6571032
25
1.9
25
100
0
96
31
6
25
37
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6571909--6572102
104
1.9
104
97
1
372
50
8
15
25
1.72
6572713--6572741
15
1.9
15
100
0
58
31
13
0
55
1.39
6573954--6573983
15
2.0
15
93
0
51
63
0
13
23
1.29
6577776--6577882
3
33.7
3
71
15
65
64
3
5
26
1.32
6577820--6577898
16
4.8
16
69
17
54
68
1
6
24
1.20
6579351--6579980
44
13.7
44
71
11
334
27
20
19
31
1.97
6584003--6584115
32
3.5
32
80
6
129
37
13
9
39
1.77
6585339--6585388
23
2.1
24
92
3
84
38
12
20
30
1.88
6595402--6595494
10
9.7
10
73
20
65
32
1
1
65
1.07
6599193--6599223
14
2.2
14
94
0
53
58
0
0
41
0.98
6605789--6605815
6
4.5
6
100
0
54
51
0
0
48
1.00
6606017--6606068
9
5.7
9
81
4
68
34
1
42
21
1.64
6606017--6606069
19
2.9
18
86
5
79
35
1
41
20
1.64
6607432--6607492
23
2.5
23
84
10
68
44
8
3
44
1.50
6607862--6607886
11
2.3
11
100
0
50
44
0
0
56
0.99
6607991--6608029
18
2.2
18
85
0
51
64
0
0
35
0.94
6612562--6612616
18
3.1
18
86
5
76
38
0
9
52
1.33
6612713--6612740
10
2.8
10
100
0
56
32
0
17
50
1.47
6616467--6616508
18
2.4
18
80
4
50
30
11
16
40
1.85
6622872--6622943
28
2.6
28
86
0
90
27
18
13
40
1.88
6625318--6625365
20
2.5
20
89
3
71
64
2
4
29
1.23
6625389--6625418
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6625414--6625443
5
5.8
5
96
4
51
76
0
0
23
0.78
6628896--6628996
28
3.6
28
84
6
125
23
28
16
30
1.97
6635350--6635392
16
2.6
17
78
14
54
44
9
0
46
1.35
6638174--6638255
24
3.3
24
78
10
94
45
35
8
10
1.70
6641032--6641080
3
16.3
3
100
0
98
32
0
0
67
0.91
6651616--6651641
10
2.6
10
100
0
52
7
0
11
80
0.89
6658418--6658478
13
4.7
13
79
0
77
32
8
24
34
1.85
6661036--6661075
19
2.1
19
85
0
53
20
2
7
70
1.24
6669723--6669749
2
13.5
2
100
0
54
0
48
0
51
1.00
6670254--6670312
30
2.0
30
96
0
109
42
0
15
42
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250