Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  250  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77900400--77900430
16
2.0
15
93
6
53
41
0
0
58
0.98
77900427--77900495
19
3.7
18
73
7
57
34
0
2
62
1.10
77900428--77900495
20
3.6
19
75
9
59
35
0
2
61
1.11
77903877--77903910
13
2.5
13
95
4
59
23
35
29
11
1.90
77904348--77904995
322
2.0
322
98
0
1260
40
18
15
24
1.90
77910490--77910515
7
3.7
7
100
0
52
69
0
0
30
0.89
77916039--77916109
16
4.4
16
92
0
115
36
7
28
28
1.83
77916356--77916388
17
1.9
17
100
0
66
63
0
0
36
0.95
77916544--77916598
19
2.9
19
100
0
110
30
10
9
49
1.69
77916954--77917118
40
4.1
40
93
0
258
33
16
9
41
1.80
77918937--77921140
7
313.1
7
86
8
906
10
10
44
34
1.72
77918957--77918997
8
5.4
8
88
8
50
7
12
51
29
1.66
77918943--77918992
15
3.4
15
88
2
66
10
14
46
30
1.77
77919132--77919180
20
2.5
20
89
0
71
0
4
55
40
1.19
77919215--77919320
22
4.9
21
83
12
117
11
16
42
29
1.83
77919411--77919497
15
6.2
13
84
11
77
13
0
48
37
1.43
77919565--77919783
48
4.6
48
78
5
144
2
3
49
43
1.34
77919817--77919890
8
10.0
8
85
14
106
13
0
40
45
1.43
77920723--77920920
39
4.7
45
76
16
158
10
3
39
45
1.56
77922577--77922618
8
5.1
8
80
13
50
16
0
50
33
1.46
77923188--77923353
15
11.3
14
80
16
185
12
3
40
43
1.58
77923190--77923353
52
3.2
49
80
14
188
12
3
40
43
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77923196--77923353
82
1.9
82
85
10
216
12
3
40
43
1.59
77923188--77923353
7
22.6
7
81
15
185
12
3
40
43
1.58
77924001--77924082
7
12.1
7
75
17
84
14
1
39
45
1.53
77924217--77927511
7
461.9
7
81
16
3536
14
0
41
43
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250

The End!