Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  231  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71301780--71301857
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2.7
20
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10
0
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9
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22
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3.2
16
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71385188--71385255
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2.1
32
91
0
109
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2
27
27
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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26
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0
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20
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10
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1.65
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3
17.0
3
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18
3.1
17
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12
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3
1
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11
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1.70
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170
47
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11
31
1.73
71427666--71427826
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150
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11
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8
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12
103
0
20
0
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0.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Entropy
(0-2)
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0
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40
76
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113
24
19
25
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71462537--71462576
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2.2
18
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0
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47
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10
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1.38
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2.6
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1
1
20
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1
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24
14
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16
2.1
17
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55
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11
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1.63
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20
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59
0
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35
1.23
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1.11
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52
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135
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1
4
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1.24
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20
60
60
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21
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0
62
60
0
7
32
1.25
71485299--71485323
6
4.2
6
100
0
50
36
0
0
64
0.94
71492959--71493008
20
2.5
20
73
0
55
38
0
2
60
1.09
71509835--71509878
21
2.1
21
87
8
63
72
2
6
18
1.17
71510436--71510475
20
2.0
21
90
5
64
30
22
7
40
1.81
71518061--71518113
25
2.2
24
86
3
70
35
0
0
64
0.94
71518076--71518113
13
3.1
13
88
11
62
31
0
0
68
0.90
71518078--71518131
24
2.2
24
87
6
74
27
0
3
68
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71526641--71526678
11
3.5
11
85
0
58
28
13
0
57
1.36
71526837--71526886
21
2.4
21
80
16
59
34
2
2
62
1.18
71529682--71529714
17
2.1
16
88
11
50
51
6
9
33
1.58
71541807--71541855
21
2.5
21
81
18
61
53
6
0
40
1.26
71542270--71542296
6
4.5
6
100
0
54
85
0
14
0
0.61
71548576--71548624
20
2.5
20
80
6
57
40
0
8
51
1.32
71554351--71554421
22
3.3
22
76
11
92
40
1
15
42
1.56
71554336--71554426
43
2.1
43
100
0
182
39
3
13
43
1.60
71565025--71565075
18
3.0
16
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18
59
78
0
1
19
0.85
71565027--71565075
9
5.2
9
80
5
53
79
0
2
18
0.83
71565025--71565075
17
3.0
17
86
8
68
78
0
1
19
0.85
71565033--71565162
9
14.7
9
72
11
83
62
3
1
33
1.20
71565113--71565162
19
2.7
18
77
20
57
58
4
0
38
1.17
71565181--71565214
10
3.4
10
83
0
50
44
2
2
50
1.32
71565661--71565718
19
3.1
19
73
14
57
31
3
5
60
1.35
71565675--71565728
28
1.9
28
85
7
74
33
3
5
57
1.40
71572206--71572538
131
2.6
131
84
4
408
34
19
18
27
1.95
71576579--71576629
21
2.4
21
90
0
75
27
37
9
25
1.87
71581739--71581780
20
2.0
21
86
4
59
54
16
0
28
1.42
71596710--71596754
23
2.0
21
83
8
54
55
11
0
33
1.35
71600480--71600617
39
3.6
38
87
5
181
48
5
15
31
1.66
71601419--71601451
17
1.9
17
93
0
57
33
9
3
54
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71603723--71603773
26
1.9
27
84
4
68
7
52
1
37
1.42
71610607--71610699
39
2.5
37
80
7
98
27
29
22
20
1.98
71610875--71610919
22
2.0
24
82
8
58
37
22
0
40
1.54
71610869--71610919
23
2.2
23
82
10
59
37
21
0
41
1.54
71611782--71611815
17
2.1
16
88
5
50
2
14
5
76
1.09
71611804--71611854
14
3.6
14
76
7
50
17
13
0
68
1.21
71612004--71612040
14
2.4
17
86
13
53
51
0
0
48
1.00
71624767--71624839
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2.5
29
78
8
78
54
9
1
34
1.41
71632836--71632861
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
71643981--71644020
7
5.7
7
100
0
80
27
12
0
60
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250