Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  234  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72220275--72220321
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1.81
72280028--72280180
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6.6
23
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5
114
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20
7
34
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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117
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10
0
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0
0
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1.9
31
85
0
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35
8
11
44
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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12
12
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0
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10.8
5
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12
62
44
0
1
53
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72400836--72400874
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28
1.99
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19
2.2
19
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46
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1.44
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22
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1.58
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2.3
19
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1.24
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15
2.9
17
78
21
55
42
0
0
57
0.98
72451754--72451780
3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
72455437--72455536
44
2.2
45
82
3
112
31
21
13
35
1.91
72458283--72458319
19
2.1
19
90
10
60
35
0
5
59
1.20
72461167--72461242
26
2.9
26
92
0
125
36
23
5
34
1.78
72479686--72479718
15
2.2
16
89
10
52
51
3
0
45
1.16
72479824--72479872
25
2.0
24
84
7
64
53
8
4
34
1.50
72488853--72489212
46
7.8
46
92
0
497
40
14
23
21
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72492685--72492774
25
3.6
25
75
0
81
33
15
30
21
1.94
72494374--72494426
18
2.8
19
86
8
65
58
3
3
33
1.34
72494646--72494686
20
2.0
22
90
9
68
36
0
0
63
0.95
72495578--72495636
28
2.0
28
90
6
91
35
8
3
52
1.49
72496751--72496783
12
2.8
12
86
4
50
33
0
0
66
0.92
72500632--72500671
21
1.9
21
85
10
55
45
2
7
45
1.45
72512389--72512417
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
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9
4.8
9
91
8
68
9
7
0
82
0.83
72520553--72520649
18
5.5
17
73
19
60
15
8
3
73
1.20
72520597--72520670
36
2.0
36
85
12
98
22
5
2
68
1.23
72520624--72520671
18
2.7
17
81
9
60
29
4
0
66
1.10
72520691--72520729
21
1.9
20
84
5
51
38
0
2
58
1.12
72520680--72520740
19
3.0
19
73
21
52
37
0
3
59
1.14
72520667--72520752
22
3.9
22
74
13
70
40
0
2
56
1.12
72520770--72520840
37
1.9
36
85
2
97
45
1
4
49
1.30
72521265--72521308
22
2.0
23
82
8
56
45
0
2
52
1.13
72521237--72521304
36
1.9
36
84
3
93
39
1
2
55
1.24
72521365--72521389
7
3.6
7
100
0
50
16
0
0
84
0.63
72521424--72521486
9
6.5
10
73
10
51
61
0
3
34
1.12
72521512--72521600
10
9.4
9
72
11
63
52
2
1
43
1.20
72521512--72521600
19
4.7
18
73
12
63
52
2
1
43
1.20
72521502--72521614
29
3.9
28
76
5
109
53
1
1
42
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72521570--72521660
33
2.7
34
79
16
100
53
1
1
43
1.15
72530808--72530900
30
3.1
30
88
0
132
26
26
21
24
1.99
72536027--72536066
5
7.6
5
83
10
53
42
0
2
55
1.13
72536011--72536065
15
4.1
13
80
19
60
47
0
1
50
1.11
72537377--72537415
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
72537655--72537789
39
3.4
39
74
6
112
23
20
28
28
1.99
72537912--72537952
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
72539485--72539550
26
2.4
27
78
14
73
42
1
4
51
1.31
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2.4
34
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8
92
55
5
0
40
1.22
72539698--72539749
23
2.3
23
80
6
61
57
0
0
42
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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