Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  232  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
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0
0
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3.3
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191
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.9
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2
25
28
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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3.0
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2.2
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2.1
30
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29
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14
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1.75
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14
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32
1.75
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14
8
31
1.75
71834444--71834513
27
2.6
27
80
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14
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32
1.75
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0
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32
2.1
32
91
0
105
48
3
0
48
1.17
71843291--71843420
66
2.0
66
90
3
208
26
6
18
49
1.71
71847872--71847932
30
2.0
30
84
6
79
36
3
6
54
1.43
71849569--71849743
46
3.8
46
79
10
212
28
29
20
21
1.98
71849577--71849748
93
1.8
93
94
0
308
27
29
20
21
1.98
71852013--71852120
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
71859366--71859468
44
2.3
45
84
3
127
30
21
13
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71859388--71859473
46
1.9
44
90
4
136
29
23
13
33
1.93
71861112--71861192
28
2.9
27
76
10
81
44
3
0
51
1.19
71861110--71861195
9
9.2
9
76
10
57
47
3
0
48
1.18
71869869--71869911
18
2.4
18
88
7
61
46
0
0
53
1.00
71873133--71873202
31
2.3
31
84
0
86
54
11
1
32
1.45
71878760--71878799
20
2.0
20
100
0
80
45
15
15
25
1.84
71881191--71881218
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
71881718--71881802
30
2.8
30
73
8
84
63
5
0
30
1.18
71881735--71881802
29
2.4
28
82
9
75
69
5
0
25
1.11
71884984--71885029
20
2.3
20
96
0
83
10
8
30
50
1.68
71894728--71894762
19
1.9
17
88
11
52
45
0
0
54
0.99
71896824--71896866
16
2.7
16
82
7
52
34
4
2
58
1.32
71897548--71897573
11
2.4
11
100
0
52
34
0
0
65
0.93
71901065--71901136
28
2.4
30
84
9
103
50
5
2
41
1.40
71913638--71913683
24
2.0
23
84
12
60
63
0
6
30
1.20
71926848--71926899
20
2.5
20
90
3
86
25
15
11
48
1.78
71926920--71926968
20
2.5
20
96
0
89
48
6
16
28
1.69
71935405--71935480
40
1.9
40
97
2
145
52
11
13
22
1.72
71937330--71937366
3
12.3
3
100
0
74
67
0
0
32
0.91
71938974--71939040
25
2.8
25
91
8
104
49
14
0
35
1.44
71939577--71939603
7
3.9
7
100
0
54
85
0
0
14
0.61
71946237--71946271
17
2.1
17
100
0
70
22
37
11
28
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71950157--71950202
23
2.0
24
83
12
60
43
8
6
41
1.61
71953246--71953345
52
1.9
52
91
0
164
45
11
11
33
1.75
71953538--71953598
3
20.3
3
76
18
56
34
0
1
63
1.04
71953538--71953598
12
5.4
11
76
20
63
34
0
1
63
1.04
71954715--71954803
46
1.9
46
84
8
119
43
1
21
33
1.60
71954742--71954803
23
2.7
24
77
7
74
43
0
22
33
1.54
71954715--71954812
11
8.5
11
71
10
72
44
1
21
32
1.59
71955792--71955855
12
4.8
13
77
21
62
50
0
1
48
1.10
71955804--71955847
22
2.1
22
87
8
65
50
0
0
50
1.00
71955769--71955854
7
11.9
7
70
24
54
47
1
1
50
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250