Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  25  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7248398--7248567
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4.4
39
82
5
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1.91
7248370--7248581
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2.7
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28
17
37
1.91
7248453--7248514
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3.2
20
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13
56
14
37
19
29
1.91
7255137--7255208
36
2.0
36
91
0
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27
29
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20
1.99
7257019--7257196
17
10.4
17
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15
28
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1.95
7257039--7257220
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26
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1.96
7257045--7257172
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1.9
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0
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32
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1.97
7257109--7257220
17
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17
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2
91
32
16
26
25
1.96
7257226--7257343
17
6.9
17
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3
94
27
20
26
26
1.99
7257230--7257339
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3.2
34
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5
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29
20
24
25
1.99
7257227--7257370
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2.1
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2
164
27
20
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26
1.99
7263628--7263673
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5.5
8
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10
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1.27
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9
9.9
9
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2
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1.18
7263627--7263673
17
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17
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0
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1.25
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0
0
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0
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0.80
7263664--7263715
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1.00
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2
0
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0
0
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0.97
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2.6
29
83
12
93
44
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7263805--7263874
25
3.1
21
74
20
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41
0
0
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3.1
18
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10
51
50
0
0
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1.00
7264259--7264312
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2.0
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72
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0
1
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1.09
7264255--7264320
27
2.4
28
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10
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54
1
1
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1.18
7264288--7264546
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13
162
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1
2
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1.25
7264400--7264469
14
4.5
14
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22
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55
0
1
42
1.08
7264402--7264546
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4.1
35
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10
129
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2
1
39
1.19
7264507--7264539
13
2.7
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9
52
60
0
0
39
0.97
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15
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55
3
0
41
1.18
7264657--7264710
19
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20
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75
0
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1.03
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19
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1
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17
1.12
7264805--7264844
13
3.2
13
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20
0
0
80
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7264805--7264842
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18
0
0
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1
0
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2.6
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0
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60
1
0
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1.07
7265095--7265199
34
3.0
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12
113
60
0
0
39
1.04
7265103--7265173
13
5.9
12
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21
60
60
1
0
38
1.06
7265111--7265207
33
2.9
32
78
17
99
60
2
0
37
1.08
7265142--7265214
24
3.1
25
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57
2
0
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1.13
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8
5.5
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82
7
56
76
4
8
10
1.15
7265240--7265299
9
6.9
9
73
21
56
75
3
11
10
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7265253--7265303
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3.1
16
86
10
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7
9
1.07
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21
2.0
21
90
0
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19
29
21
29
1.98
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12
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19
5
19
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1.62
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77
18
263
37
15
23
23
1.93
7295356--7295656
46
6.7
46
85
6
377
38
14
23
22
1.92
7295310--7295612
84
3.5
84
90
3
435
37
14
23
23
1.92
7295917--7295963
25
2.0
25
83
8
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53
4
14
27
1.60
7301141--7301311
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1.8
93
91
2
281
27
29
21
21
1.99
7301133--7301307
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3.8
45
78
10
192
28
29
21
21
1.99
7301138--7301327
46
4.1
46
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20
128
27
28
21
22
1.99
7304615--7304678
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2.0
32
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3
110
40
1
1
56
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2.4
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0
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3.4
30
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40
14
14
29
1.87
7324814--7324889
30
2.5
31
84
2
91
43
10
14
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1.79
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2.5
18
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3
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47
13
13
26
1.78
7329809--7329848
18
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18
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55
20
0
12
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0
0
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15
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0
57
23
2
69
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1.20
7343824--7343871
21
2.3
21
81
0
60
22
2
68
6
1.23
7347326--7347402
37
2.1
37
95
0
136
19
20
10
49
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7348976--7349006
14
2.2
14
94
0
53
9
0
29
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1.28
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17
2.6
17
81
0
52
11
13
6
68
1.39
7353478--7353858
198
1.9
198
98
0
735
38
22
8
30
1.85
7366523--7366563
15
2.7
15
88
0
64
63
0
4
31
1.15
7366527--7366584
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2.4
24
82
0
71
56
1
6
34
1.36
7366787--7366904
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3
72
16
62
58
3
3
34
1.31
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45
4.4
43
66
24
111
60
7
2
29
1.36
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1.9
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13
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58
9
0
32
1.30
7366833--7367304
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3.4
136
86
6
593
59
6
2
30
1.37
7367282--7367493
3
70.7
3
73
10
139
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2
5
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1.34
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15
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0
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0
0
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1.00
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3
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11
50
36
2
2
57
1.29
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17
3.2
17
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56
45
0
20
33
1.52
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28
3.0
28
87
1
114
21
3
28
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1.68
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14
2.4
15
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4
63
28
2
5
62
1.32
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24
2.7
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20
66
33
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4
52
1.54
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5
100
0
84
40
0
0
59
0.97
7383531--7383561
3
10.3
3
92
0
53
0
32
0
67
0.91
7383889--7383949
13
4.5
13
76
12
52
55
0
4
39
1.21
7383910--7383949
13
3.1
13
85
0
53
62
0
2
35
1.09
7385668--7385710
18
2.4
18
88
7
61
58
2
9
30
1.42
7389341--7389371
14
2.2
14
100
0
62
19
6
29
45
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7389631--7389660
12
2.5
12
94
0
51
13
23
20
43
1.86
7390175--7390382
91
2.3
91
86
2
274
45
4
3
46
1.41
7390412--7390443
16
1.9
17
93
6
57
53
0
0
46
1.00
7390436--7390648
61
3.4
63
69
17
194
41
2
6
49
1.41
7390398--7390690
120
2.4
120
92
2
482
42
2
5
50
1.36
7390519--7390553
18
2.0
17
88
5
52
40
0
0
60
0.97
7390639--7390673
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
7390627--7390901
147
1.9
149
96
1
509
47
2
3
46
1.33
7390786--7390820
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
7390982--7391159
44
4.1
44
73
10
170
30
27
5
36
1.78
7390953--7391119
83
2.0
83
98
0
325
29
26
4
38
1.77
7391140--7391207
16
4.2
16
92
0
109
35
35
0
29
1.58
7391725--7391774
26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
7392295--7392327
5
6.8
5
93
3
50
87
0
12
0
0.53
7397859--7398084
112
2.0
112
100
0
452
45
9
16
28
1.79
7408888--7408994
26
4.1
26
85
0
124
28
20
23
28
1.99
7414294--7414370
39
2.0
39
94
0
136
19
23
10
46
1.80
7418584--7418608
12
2.1
12
100
0
50
32
28
16
24
1.96
7424781--7424824
23
1.9
23
81
9
54
54
6
13
25
1.63
7442156--7442231
20
3.8
20
73
13
66
39
17
10
32
1.83
7442405--7442459
23
2.4
23
79
8
69
34
18
27
20
1.95
7442695--7442765
35
2.0
36
88
2
108
35
18
5
40
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7448056--7448090
17
2.1
17
88
0
52
45
14
17
22
1.84
7448588--7448685
20
4.9
19
81
7
79
38
16
10
34
1.82
7448589--7448695
40
2.7
40
80
1
115
41
16
9
32
1.81
7448635--7448695
20
3.0
20
90
0
95
42
18
6
32
1.76
7448862--7448918
23
2.5
23
80
2
62
38
17
17
26
1.92
7461870--7461970
39
2.6
39
88
0
157
38
23
24
12
1.90
7475315--7475404
37
2.4
37
83
3
101
31
12
18
37
1.88
7480847--7480900
8
6.6
8
80
16
58
59
0
0
40
0.98
7480847--7480897
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10.0
5
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12
77
58
0
0
41
0.98
7482054--7482109
25
2.2
25
96
0
103
35
0
16
48
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250