Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  242  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.2
24
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.0
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25
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19
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24
0
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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2.0
20
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10
20
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.57
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0
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19
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50
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2.0
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13
47
1.58
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21
2.0
21
90
0
64
21
29
19
29
1.98
75132003--75132270
104
2.6
105
93
1
450
18
20
30
29
1.97
75136510--75136549
20
2.0
21
90
9
66
37
0
5
57
1.21
75142128--75142162
18
1.9
18
88
11
54
37
0
0
62
0.95
75143844--75143893
26
1.9
26
87
0
73
62
0
2
36
1.07
75144403--75144526
18
6.9
18
81
4
144
38
12
9
38
1.77
75144403--75144526
35
3.5
35
83
2
158
38
12
9
38
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75144403--75144526
53
2.3
53
81
5
160
38
12
9
38
1.77
75145149--75145173
9
2.8
9
100
0
50
0
24
8
68
1.16
75150705--75150739
6
5.8
6
89
0
52
0
17
14
68
1.21
75153611--75153644
17
2.0
17
94
0
59
50
0
0
50
1.00
75156928--75156970
3
14.3
3
95
0
68
60
0
4
34
1.17
75162213--75162264
18
2.9
18
82
0
59
26
21
30
21
1.98
75164331--75164361
2
15.5
2
93
0
53
0
45
3
51
1.17
75169987--75170027
21
1.9
21
85
5
55
41
2
0
56
1.13
75177315--75177361
21
2.2
21
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0
58
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14
1.92
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19
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19
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11
59
40
0
6
52
1.28
75193332--75193369
15
2.6
15
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4
51
57
21
0
21
1.40
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55
2.0
55
100
0
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22
23
14
39
1.91
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14
2.3
14
100
0
64
6
15
46
31
1.71
75220786--75220817
14
2.3
14
100
0
64
6
15
46
31
1.71
75226278--75226387
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4.0
27
76
12
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22
28
19
30
1.98
75226286--75226411
56
2.2
56
88
2
182
24
30
17
27
1.97
75226311--75226411
28
3.6
28
80
10
125
24
31
14
28
1.95
75226706--75226853
63
2.3
63
78
12
156
25
26
16
31
1.97
75230356--75230511
68
2.2
68
79
11
165
20
28
16
33
1.95
75234100--75234173
37
2.0
37
97
0
139
36
16
9
37
1.81
75238240--75238280
17
2.3
18
84
16
50
48
0
0
51
1.00
75239874--75239913
13
3.3
13
73
20
50
30
15
0
55
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75239859--75239914
23
2.4
23
93
0
94
33
12
0
53
1.39
75242019--75242054
18
1.9
19
88
5
56
69
11
11
8
1.37
75243714--75243771
30
1.9
30
85
0
80
41
1
24
32
1.65
75243983--75244014
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
75244109--75244350
50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
75244109--75244358
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
75255483--75255528
22
2.1
22
84
11
60
56
6
2
34
1.37
75259857--75259895
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2.2
17
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13
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33
0
20
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1.51
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23
94
0
134
19
21
27
31
1.97
75262442--75262470
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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