Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A09
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  77927517

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   

This is table  249  of  250  ( 29906 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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29
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25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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0
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18
140
48
3
3
45
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.08
77796141--77796302
87
1.9
87
84
2
218
25
24
20
29
1.99
77796228--77796526
131
2.3
131
79
9
315
25
22
22
30
1.99
77796230--77796525
87
3.4
85
78
6
272
25
22
21
30
1.99
77796101--77796572
218
2.2
218
94
0
829
26
22
21
30
1.98
77796153--77796526
44
8.6
44
74
6
287
25
22
21
30
1.99
77809073--77809131
9
5.9
10
77
16
52
64
5
3
27
1.30
77814782--77814818
18
2.1
18
100
0
74
37
10
5
45
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77820247--77820290
13
3.4
13
77
0
52
36
9
15
38
1.80
77820243--77820308
26
2.5
26
77
0
69
37
9
16
36
1.81
77822080--77822117
19
2.0
19
100
0
76
21
5
10
63
1.46
77832240--77832274
4
8.8
4
100
0
70
25
0
22
51
1.48
77841114--77841206
43
2.2
44
92
3
154
51
13
6
27
1.66
77845844--77845936
43
2.2
44
92
3
154
51
13
6
27
1.66
77864405--77864429
12
2.1
12
100
0
50
48
16
16
20
1.82
77873455--77873497
21
2.0
23
86
9
63
51
0
6
41
1.29
77874866--77874917
20
2.6
20
90
0
77
9
36
34
19
1.84
77875445--77875480
13
2.7
13
91
4
54
52
19
0
27
1.46
77876852--77876899
19
2.6
18
83
9
53
2
27
2
68
1.11
77877073--77877110
3
13.0
3
84
15
53
65
0
2
31
1.06
77884055--77884583
120
4.4
120
94
1
902
43
0
3
51
1.26
77884171--77884324
18
8.9
18
66
18
76
42
0
2
54
1.19
77884055--77884569
237
2.2
237
93
1
877
43
0
3
51
1.25
77884527--77884561
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
77884787--77884848
16
3.9
16
89
6
90
29
33
0
37
1.58
77884713--77884810
45
2.2
44
81
1
115
33
26
5
34
1.79
77884789--77884858
32
2.2
32
87
5
97
32
32
0
34
1.58
77884791--77884858
16
4.3
15
88
7
73
32
33
0
33
1.58
77885155--77885188
13
2.6
13
90
0
50
14
0
32
52
1.42
77887267--77887301
17
2.0
18
88
5
54
51
5
14
28
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77887385--77887511
50
2.5
51
87
1
175
35
15
22
26
1.94
77887482--77887665
31
6.0
31
85
5
230
28
16
27
27
1.97
77887482--77887655
92
1.9
92
86
2
251
29
15
27
27
1.96
77887687--77887854
47
3.6
46
88
3
192
28
14
26
30
1.95
77887765--77887898
49
2.9
48
84
8
163
31
13
26
29
1.94
77891820--77891847
14
2.0
14
100
0
56
28
21
7
42
1.79
77891919--77891991
30
2.4
30
76
15
78
35
4
2
57
1.32
77892478--77892516
14
2.9
14
84
3
53
76
5
0
17
0.96
77892535--77892575
18
2.3
18
91
0
64
29
7
14
48
1.71
77900020--77900049
14
2.1
15
93
6
53
53
0
13
33
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250