Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  91551117

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   

This is table  275  of  276  ( 33102 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90971742--90971781
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1.9
21
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0
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35
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90972221--90972357
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0
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20
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2
42
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2.3
19
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2.5
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2
3
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90978127--90978202
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2
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5
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0
0
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120
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1.40
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36
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53
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27
16
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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2.0
15
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.20
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62
5
0
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11
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2
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2.0
20
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1.97
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51
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187
23
19
26
29
1.98
91101996--91102177
101
1.8
101
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1
312
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19
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30
1.98
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22
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0
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1.9
13
100
0
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12
0
0
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0.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91145700--91145738
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2.4
16
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51
23
0
2
74
0.94
91145916--91145977
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2.3
27
86
13
83
59
3
0
37
1.13
91145942--91145989
17
2.6
19
81
15
57
62
2
0
35
1.07
91145958--91145992
16
2.1
17
89
5
54
62
2
0
34
1.10
91153445--91153607
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2.0
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20
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39
1.79
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2.9
17
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18
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52
0
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45
1.12
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28
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51
0
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0
0
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18
11
39
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12
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5
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20
12
37
1.89
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249
29
19
11
39
1.87
91170671--91171018
108
3.2
108
77
6
253
30
18
11
39
1.87
91170977--91171396
55
7.7
55
72
8
198
31
18
10
40
1.83
91171315--91171447
54
2.4
54
82
3
142
30
15
9
45
1.78
91172804--91172828
7
3.6
7
100
0
50
72
0
0
28
0.86
91175907--91175955
26
2.0
26
84
8
66
40
0
0
59
0.98
91177760--91177911
56
2.8
54
80
6
189
30
17
21
30
1.96
91180674--91180718
19
2.2
22
88
11
69
55
2
0
42
1.12
91183790--91183839
22
2.3
22
82
0
64
28
8
2
62
1.35
91183809--91183845
3
13.0
3
83
11
51
32
2
0
64
1.07
91183809--91183844
14
2.6
14
86
0
54
33
2
0
63
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91187622--91187663
15
2.8
15
78
10
50
33
19
11
35
1.88
91192456--91192516
22
2.7
24
80
10
74
50
0
4
44
1.23
91197342--91197372
7
4.4
7
100
0
62
45
0
0
54
0.99
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23
2.3
24
83
9
74
33
0
0
66
0.92
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26
3.2
26
78
9
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38
2
3
55
1.30
91203985--91204049
31
2.1
32
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8
80
40
0
3
56
1.15
91203979--91204159
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2.9
63
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11
156
42
0
3
53
1.23
91205702--91205830
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2.1
61
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152
43
8
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44
1.53
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24
2.0
24
100
0
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17
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17
2.0
17
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5
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1.76
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25
2.4
24
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14
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58
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14
1.52
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25
2.0
25
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0
91
50
8
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16
1.72
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13
2.1
14
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34
0
0
65
0.93
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25
2.1
25
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67
3
0
28
1.07
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3.2
17
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1
0
31
1.02
91247627--91247661
3
11.7
3
100
0
70
34
0
0
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0.93
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35
2.0
35
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5
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68
4
2
24
1.22
91247954--91248028
19
3.8
20
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19
68
60
2
0
37
1.11
91247937--91247990
17
3.2
17
78
17
60
64
1
0
33
1.04
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21
3.0
22
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13
60
59
1
0
38
1.07
91248002--91248065
29
2.3
29
81
7
80
65
3
1
29
1.17
91248596--91248628
11
2.9
12
86
13
52
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91249908--91249937
12
2.5
12
94
0
51
50
6
16
26
1.70
91250446--91250489
15
2.9
15
82
3
52
40
0
2
56
1.11
91257457--91257595
69
2.0
69
98
0
269
26
12
32
28
1.93
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3
100
0
70
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0
0
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0.90
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11
100
0
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0
0
7
0.39
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2
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11
1.32
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3
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0
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0
29
0
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0.87
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0
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1
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5
15.4
5
75
15
54
16
3
1
78
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276