Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  91551117

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   

This is table  36  of  276  ( 33102 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11323422--11323463
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15
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28
1.98
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38
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3.6
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32
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11333906--11334069
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1.9
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285
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2.7
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2.2
120
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2.0
183
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0
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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25
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1.99
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113
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3.2
39
89
0
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2.6
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74
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0
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29
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22
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81
11
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57
10
13
18
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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26
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1.98
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28
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93
0
184
27
8
1
62
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11554015--11554094
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2
10
53
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17
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1.92
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1.28
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10
5.2
10
77
18
61
68
2
2
28
1.12
11586262--11586316
9
5.9
9
76
21
51
63
1
1
32
1.15
11586262--11586313
27
1.9
27
88
7
79
65
1
1
30
1.14
11586440--11586532
45
2.1
45
95
0
168
35
11
18
34
1.87
11586528--11586589
29
2.1
29
85
5
81
22
4
3
69
1.22
11591095--11591146
20
2.6
20
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0
77
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28
1.87
11593537--11593580
20
2.2
20
100
0
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18
25
0
56
1.41
11595708--11595856
43
3.5
42
80
6
156
26
16
25
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1.97
11599454--11599486
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
11602787--11602829
22
1.9
23
85
4
61
34
11
37
16
1.85
11604835--11604933
6
18.8
5
73
20
53
20
4
1
74
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11604840--11604913
6
12.2
6
78
8
78
18
4
1
75
1.03
11604834--11604933
18
5.9
17
78
10
82
20
4
1
75
1.03
11604869--11604933
23
2.7
22
83
7
67
18
4
1
75
1.05
11611470--11611524
26
2.1
26
100
0
110
29
27
21
21
1.99
11621499--11621553
22
2.5
22
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2
94
45
0
9
45
1.35
11639811--11639836
13
2.0
13
100
0
52
30
23
23
23
1.99
11643477--11643504
14
2.0
14
100
0
56
57
7
7
28
1.52
11648107--11648362
41
6.1
40
76
13
185
37
20
21
20
1.94
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89
2.1
89
98
0
360
42
19
18
20
1.90
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2.4
47
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1
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49
28
1
20
1.58
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8
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19
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70
1
0
27
1.04
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7
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7
78
7
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72
1
1
25
0.99
11649524--11649608
22
3.8
22
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1
107
72
1
1
24
0.98
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7
7.0
7
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4
64
80
0
0
20
0.72
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30
2.0
29
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3
89
65
1
1
31
1.13
11649525--11649615
15
6.1
15
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70
1
1
27
1.01
11649667--11649708
18
2.4
18
88
4
59
76
0
2
21
0.90
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4
6.2
4
100
0
50
24
0
0
76
0.80
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21
2.2
21
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0
56
45
2
21
30
1.64
11654875--11654942
30
2.3
30
82
10
77
30
1
4
63
1.23
11654897--11654950
20
2.7
19
78
13
56
27
1
1
68
1.10
11654886--11654942
30
2.0
30
86
6
82
29
1
3
64
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11656094--11656123
14
2.1
15
93
6
53
56
13
10
20
1.65
11657693--11657732
21
1.9
21
85
10
55
30
27
17
25
1.97
11667954--11668123
46
3.7
46
73
14
161
22
17
28
31
1.97
11672213--11672291
39
2.0
39
92
0
131
40
11
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1.81
11675283--11675405
39
3.2
39
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0
210
35
27
17
19
1.94
11675378--11675431
26
2.1
26
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0
99
31
22
20
25
1.98
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11
3.8
11
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4
0
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0
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0
0
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0.92
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24
3.8
24
77
5
87
11
20
41
26
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276