Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  91551117

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   

This is table  63  of  276  ( 33102 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19569577--19569626
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63
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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20
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2
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2.5
25
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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25
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20
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9
6
44
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19751299--19751394
40
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40
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42
1.57
19751341--19751394
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19
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3
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42
1.49
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18
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1.97
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112
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0
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40
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0
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60
25
0
25
48
1.51
19756208--19756255
15
3.3
15
77
16
55
20
0
33
45
1.52
19756203--19756252
22
2.3
21
77
16
57
24
0
30
46
1.53
19756244--19756284
14
2.9
15
85
7
59
19
2
43
34
1.64
19756237--19756276
21
1.9
21
84
0
53
15
2
42
40
1.60
19766286--19766364
39
2.0
39
100
0
158
27
12
12
46
1.78
19769206--19769277
33
2.1
34
80
14
78
51
5
5
37
1.49
19769763--19769841
39
2.0
39
92
0
131
24
26
5
44
1.74
19771274--19771375
44
2.3
44
91
0
159
23
31
14
30
1.94
19771357--19771400
22
2.0
22
95
0
79
13
29
9
47
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19771318--19771444
66
1.9
66
91
0
209
20
30
14
34
1.92
19771374--19772002
44
14.6
44
88
5
829
22
31
15
30
1.95
19771265--19771488
110
2.0
110
89
0
342
21
29
14
34
1.93
19771566--19772606
132
7.8
132
82
7
1144
22
30
16
30
1.96
19771981--19772024
21
2.1
21
91
0
70
11
38
13
36
1.81
19771938--19772062
65
1.9
65
90
0
196
21
31
14
32
1.93
19772003--19772606
44
13.7
44
88
0
902
21
29
17
30
1.96
19771894--19772111
109
2.0
109
86
0
301
20
31
16
32
1.94
19771850--19772151
153
2.0
153
86
1
417
21
30
15
31
1.95
19771805--19772200
197
2.0
197
88
0
594
21
31
16
31
1.95
19772825--19772943
61
1.9
65
89
6
192
38
11
15
33
1.84
19773378--19773509
66
2.0
65
95
1
237
27
20
17
34
1.95
19785399--19785745
44
7.8
44
78
2
336
31
18
23
25
1.97
19785395--19785745
89
3.9
89
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2
384
32
18
23
25
1.97
19785491--19785738
133
1.9
133
90
0
397
31
18
23
26
1.98
19786323--19786373
23
2.2
23
86
10
77
70
9
11
7
1.33
19787135--19787193
12
5.0
12
73
19
52
45
1
0
52
1.10
19787348--19787395
3
16.0
3
95
0
87
33
0
2
64
1.05
19787510--19787562
11
4.5
12
80
15
58
20
7
0
71
1.10
19792438--19792501
22
2.9
22
76
0
65
10
20
20
48
1.79
19796676--19796724
24
2.1
23
85
11
64
32
0
2
65
1.04
19796688--19796770
42
2.1
39
84
8
105
46
0
1
51
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19798325--19798418
30
3.1
30
92
1
143
26
24
6
42
1.78
19798335--19798412
15
5.2
15
71
11
70
26
21
7
43
1.80
19807541--19807580
20
2.1
19
86
13
55
7
17
0
75
1.03
19807541--19807580
19
2.0
20
85
4
55
7
17
0
75
1.03
19807964--19808010
13
3.6
13
88
0
67
74
17
2
6
1.12
19807964--19807997
6
5.3
6
86
13
50
79
17
0
2
0.86
19811625--19811672
3
15.7
3
81
12
53
68
2
4
25
1.18
19811781--19811958
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3
90
3
275
62
1
2
32
1.19
19813017--19813046
14
2.1
14
100
0
60
13
30
13
43
1.82
19824097--19824137
17
2.4
18
80
12
50
36
7
4
51
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276