Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  117  of  284  ( 34012 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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100
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2.00
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138
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37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
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Indels
Score
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20
20
1.96
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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50
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180
25
21
28
25
1.99
38933517--38933541
12
2.1
12
100
0
50
52
24
0
24
1.48
38947039--38947206
40
4.2
40
91
1
266
22
22
26
28
1.99
38956601--38956643
20
2.2
20
95
0
77
44
27
13
13
1.83
38958714--38958866
43
3.6
43
90
2
229
26
21
24
26
1.99
38958939--38959020
31
2.6
32
80
3
85
60
14
4
19
1.51
38959259--38959306
21
2.3
21
81
0
60
0
47
18
33
1.49
38964889--38964947
9
6.6
9
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0
82
28
1
23
45
1.63
38964890--38964947
27
2.1
27
93
0
98
29
1
22
46
1.62
38964946--38965379
241
1.8
241
94
1
780
33
14
18
33
1.91
38965394--38965460
33
2.0
33
94
0
116
44
16
23
14
1.85
38968799--38968895
27
3.6
27
91
2
149
30
28
13
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38968798--38968920
55
2.2
56
85
1
167
31
30
13
25
1.93
38969371--38969396
12
2.2
12
100
0
52
42
0
7
50
1.31
38970240--38970411
86
2.0
87
97
1
328
20
20
13
44
1.86
38971240--38971344
27
3.9
27
70
5
79
36
22
8
32
1.85
38971328--38971465
27
5.1
27
85
4
172
34
14
21
28
1.93
38972062--38972147
6
14.0
6
74
13
68
22
19
11
46
1.82
38972065--38972156
25
4.0
25
68
23
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21
21
11
44
1.84
38972068--38972180
43
2.6
43
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6
149
22
19
11
46
1.81
38972729--38972885
78
2.0
78
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2
262
33
19
21
26
1.97
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3.9
27
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0
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40
23
3
32
1.73
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27
5.0
27
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0
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17
20
25
1.94
38975028--38975139
6
18.3
6
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18
72
19
19
14
46
1.84
38975034--38975094
24
2.5
25
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5
88
18
21
14
45
1.84
38975050--38975130
37
2.2
36
91
2
126
18
20
14
45
1.85
38977097--38977157
27
2.3
27
82
0
77
39
24
6
29
1.80
38977161--38977292
27
4.9
27
87
1
176
34
18
20
26
1.95
38977161--38977292
53
2.5
54
86
2
185
34
18
20
26
1.95
38979367--38979551
40
4.7
40
81
6
207
25
22
26
25
2.00
38979423--38979584
79
2.1
79
81
6
186
27
20
26
25
1.99
38991427--38991483
20
2.8
20
74
12
62
12
17
29
40
1.86
38991721--38991796
31
2.5
31
86
0
116
18
19
13
48
1.80
38991742--38991810
6
11.3
6
76
14
70
18
18
13
49
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38991692--38991789
25
3.7
25
72
19
90
19
19
13
47
1.81
38993950--38994151
107
1.9
107
90
4
327
41
20
14
23
1.89
38993950--38994199
27
9.4
27
86
2
310
40
20
15
24
1.90
39001688--39001717
16
1.9
16
93
6
53
33
23
0
43
1.54
39004523--39004680
29
5.4
29
78
6
90
23
27
12
36
1.91
39004493--39004682
58
3.3
56
71
14
170
22
27
12
37
1.90
39004493--39004690
87
2.3
87
82
4
238
23
26
12
37
1.91
39020828--39020928
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2.4
43
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8
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18
20
31
1.97
39020819--39020981
43
3.8
44
75
12
133
28
17
22
31
1.96
39030997--39031025
14
2.1
14
100
0
58
20
0
27
51
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284