Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  241  of  284  ( 34012 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80841968--80842075
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3.1
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2.1
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2.0
125
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398
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16
30
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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1.98
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2.0
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1.98
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26
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2.7
31
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134
26
25
16
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.80
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1.83
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2.1
21
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0
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18
2.1
18
86
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27
0
10
62
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.94
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22
18
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13
21
20
1.86
81039960--81040195
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2.6
92
80
3
287
44
13
21
20
1.86
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1.9
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5
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17
23
25
1.96
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2.4
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80
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84
37
17
21
23
1.94
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107
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107
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0
250
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17
23
24
1.96
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0
20
0
0.72
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4.0
43
76
8
152
26
12
24
36
1.91
81054867--81055025
86
1.9
85
82
4
203
26
12
25
35
1.91
81061455--81061613
43
3.7
43
78
4
160
28
16
23
30
1.97
81063134--81063158
12
2.1
12
100
0
50
24
24
8
44
1.80
81063562--81063601
21
1.9
21
100
0
80
30
10
20
40
1.85
81068067--81068157
19
4.9
19
82
8
125
38
8
15
37
1.78
81068076--81068145
17
4.0
16
78
12
59
38
7
15
38
1.75
81070145--81070302
79
2.0
79
93
0
271
48
13
20
17
1.81
81073551--81073600
7
6.5
8
77
13
52
86
0
10
4
0.71
81073534--81073602
22
3.2
22
76
13
72
82
1
11
4
0.87
81073487--81073759
123
2.2
123
99
0
537
58
11
19
10
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81073674--81073723
7
6.5
8
77
13
52
86
0
10
4
0.71
81073657--81073725
22
3.2
22
76
13
72
82
1
11
4
0.87
81074915--81075632
207
3.5
207
94
0
1240
29
17
22
29
1.97
81077544--81077720
27
6.6
27
81
3
169
32
14
19
32
1.92
81077544--81077720
81
2.2
81
79
4
187
32
14
19
32
1.92
81078691--81078724
12
2.8
12
86
4
50
14
20
2
61
1.46
81079775--81079916
24
5.8
25
76
8
123
19
21
21
37
1.95
81079815--81079911
50
2.0
49
81
6
115
20
21
20
37
1.95
81082233--81082671
219
2.0
219
100
0
878
31
23
14
30
1.94
81088991--81089039
20
2.5
20
86
6
64
51
10
0
38
1.36
81089003--81089043
20
2.0
20
100
0
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43
14
0
41
1.45
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40
6.6
39
86
4
278
25
27
21
25
1.99
81091853--81092115
120
2.2
119
82
4
307
25
27
21
25
1.99
81092047--81092124
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
81099802--81099973
40
4.3
40
88
2
222
25
27
21
25
1.99
81099804--81100026
40
5.6
39
83
5
216
25
27
21
25
1.99
81099802--81100026
80
2.8
79
80
7
240
25
27
21
25
1.99
81099958--81100035
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
81102059--81102183
63
2.0
63
90
0
196
36
18
11
34
1.86
81103277--81103333
28
2.0
28
89
0
87
24
5
22
47
1.72
81103717--81103795
39
2.0
39
100
0
158
35
12
20
31
1.90
81112212--81112360
63
2.3
63
79
12
158
25
28
15
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81113064--81113124
30
2.0
30
84
6
79
31
24
4
39
1.77
81114566--81114604
18
2.2
18
90
4
62
23
7
2
66
1.30
81116237--81116261
13
1.9
13
100
0
50
0
36
0
64
0.94
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47
2.8
47
82
0
154
46
15
14
23
1.82
81123035--81123236
100
2.0
100
100
0
404
34
24
12
27
1.92
81124118--81124277
27
5.9
27
76
12
141
35
22
23
18
1.96
81124160--81124277
54
2.2
55
92
1
193
34
24
23
16
1.95
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27
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33
22
25
18
1.96
81132140--81132501
54
6.7
54
96
1
654
33
22
25
18
1.96
81132888--81132959
16
4.4
16
72
10
65
9
23
22
44
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284