Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  61  of  284  ( 34012 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21444932--21446490
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2.0
780
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0
2530
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25
17
30
1.98
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10.6
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20
167
32
20
18
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1.96
21450915--21451193
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1.95
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5.3
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1
527
32
20
18
28
1.96
21452701--21452739
20
1.9
21
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5
62
43
12
0
43
1.42
21454298--21454354
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2.6
22
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0
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28
28
29
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1.95
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27
4.9
27
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137
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25
18
1.96
21455668--21455801
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2.5
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1
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21
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1.9
132
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1
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16
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1.8
132
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1
329
29
20
17
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132
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335
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20
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2.3
15
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0
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20
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20
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0
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19
36
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20
2.0
20
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30
20
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10
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18
2.0
19
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58
48
8
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45
4.8
45
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5
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49
13
15
20
1.78
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45
5.4
45
86
4
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49
14
16
20
1.79
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90
2.9
91
82
6
316
48
14
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20
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2.4
26
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0
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22
0
24
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40
4.6
40
84
2
244
25
26
23
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21505467--21506690
612
2.0
612
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2
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27
24
17
31
1.97
21512537--21512714
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
21512558--21512713
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
21519420--21519538
27
4.4
27
90
3
159
34
20
19
26
1.96
21520170--21520309
67
2.1
68
87
2
201
18
28
23
29
1.98
21520299--21520384
27
3.4
27
68
21
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24
25
16
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1.95
21520298--21520394
49
2.0
49
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0
176
23
27
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1.97
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27
4.4
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90
0
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19
25
1.95
21527731--21527814
27
3.1
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20
26
20
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1.97
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6.3
75
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0
702
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16
21
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225
2.1
225
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16
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33
1.95
21540207--21540287
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3.2
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64
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66
24
17
29
28
1.97
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50
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49
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207
26
19
25
29
1.98
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50
4.5
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192
24
17
26
30
1.97
21552409--21552452
22
2.0
22
82
8
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38
13
18
29
1.89
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4.1
41
89
4
250
29
24
23
22
1.99
21555478--21555589
27
4.2
26
80
7
125
35
23
25
15
1.94
21555478--21555589
54
2.1
54
84
3
145
35
23
25
15
1.94
21556256--21556518
40
6.6
39
86
4
278
25
27
21
25
1.99
21556256--21556518
120
2.2
119
82
4
307
25
27
21
25
1.99
21556450--21556527
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10
97
26
28
20
24
1.99
21562827--21562962
70
2.0
68
92
2
227
32
26
19
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
72
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2
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23
28
18
28
1.98
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2.0
65
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4
232
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15
18
27
1.91
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2.0
83
95
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24
27
21
27
1.99
21564328--21564453
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3.0
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73
15
143
23
27
22
26
1.99
21564346--21564598
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6.3
40
80
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230
26
27
20
24
1.99
21564344--21564651
80
3.8
80
80
9
236
27
27
21
24
1.99
21564471--21564651
40
4.5
40
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160
27
27
21
23
1.99
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3.1
32
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19
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3
52
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2.1
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18
19
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18
29
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1.98
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23
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22
0
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1
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18
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18
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12
23
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1.43
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2.0
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32
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4.7
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28
21
23
1.99
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1
179
26
28
21
23
1.99
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2.0
55
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0
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1.80
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2.0
265
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0
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18
27
1.97
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2.0
273
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21
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1.98
21599095--21599166
35
2.1
35
91
0
117
34
29
12
23
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21599403--21599611
102
2.1
102
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27
17
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1.98
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29
2.3
29
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13
27
1.94
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174
1.9
174
94
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14
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1.95
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29
2.7
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110
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30
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22
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2.6
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250
38
22
9
29
1.86
21604858--21605068
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21
9
29
1.86
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18
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0
17
1.48
21621275--21621364
15
6.1
15
81
8
96
48
33
0
17
1.48
21623149--21623238
34
2.7
34
83
8
105
32
25
17
24
1.97
21627217--21627259
19
2.3
19
95
0
77
27
23
6
41
1.80
21628328--21628423
27
3.6
27
76
5
95
41
17
18
21
1.90
21633297--21633339
22
2.0
22
90
0
68
55
4
0
39
1.20
21633288--21633350
32
2.0
31
84
3
81
55
6
0
38
1.25
21633318--21633349
10
3.2
10
95
0
55
53
6
0
40
1.26
21650961--21651008
10
4.8
10
97
0
78
35
0
6
58
1.23
21659079--21659156
29
2.7
28
84
11
104
25
15
30
28
1.96
21659109--21659436
174
1.9
174
96
0
611
29
14
24
31
1.94
21662581--21662627
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
21662598--21662674
17
4.1
19
88
11
115
36
14
10
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21662598--21662669
36
2.0
37
91
8
121
36
13
11
38
1.81
21663248--21664403
44
26.3
44
80
7
1179
27
24
15
31
1.96
21670946--21671767
19
43.2
19
98
1
1594
36
15
10
36
1.82
21672615--21672673
30
2.0
30
86
6
84
37
0
40
22
1.54
21672845--21672897
23
2.3
23
78
15
56
41
16
9
32
1.81
21677999--21678065
30
2.2
31
91
2
109
31
22
10
35
1.88
21681188--21681234
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
21681495--21681661
46
3.6
46
90
1
246
21
23
15
39
1.91
21681539--21681745
46
4.8
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12
197
22
22
16
37
1.94
21681582--21681745
84
2.0
84
96
0
301
22
21
17
37
1.94
21681666--21681760
46
2.1
46
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0
172
24
22
15
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1.93
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9
3.7
9
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14
52
77
2
0
20
0.90
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28
2.8
28
72
14
79
41
0
23
35
1.55
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18
3.2
19
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7
59
64
1
1
32
1.13
21694152--21694210
22
2.7
23
82
14
72
57
0
5
37
1.21
21694349--21694517
17
9.9
17
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23
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1
2
34
1.19
21694366--21694416
16
3.1
17
77
13
52
64
1
1
31
1.15
21694367--21694615
32
8.0
31
68
21
130
60
1
3
34
1.20
21694509--21694591
19
4.3
19
68
28
50
59
1
4
34
1.27
21694550--21694672
12
10.3
12
71
20
73
64
0
2
32
1.12
21696165--21696757
206
2.8
206
85
2
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27
22
18
31
1.97
21704794--21704824
14
2.1
15
94
5
55
51
3
6
38
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21708666--21708724
22
2.7
23
82
14
72
57
0
5
37
1.21
21708857--21708934
3
27.0
3
71
17
51
64
1
2
32
1.15
21708857--21708936
16
4.8
17
71
21
53
63
1
2
32
1.15
21708961--21709035
11
6.1
12
73
23
59
61
1
2
34
1.18
21708963--21709029
28
2.3
28
82
14
75
61
1
2
34
1.20
21709061--21709120
29
2.1
29
90
6
95
60
0
3
36
1.14
21708856--21709131
22
12.5
22
63
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70
59
0
5
34
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0
1
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1.09
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2.0
31
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0
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22
24
16
36
1.94
21714534--21714606
26
2.8
26
95
0
137
23
21
27
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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