Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  43  of  284  ( 34012 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15217662--15217964
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3.7
86
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1.97
15217795--15217937
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1.9
77
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26
16
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1.97
15221029--15221103
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6.2
42
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354
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1.95
15226632--15226899
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85
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2.6
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1.97
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2.7
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0
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1.8
101
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18
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1.98
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1.8
151
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2
407
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1.9
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2.0
20
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5
20
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2.0
20
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18
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9.0
101
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1.85
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5.8
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332
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16
24
1.96
15273738--15274031
101
2.9
100
83
3
378
32
25
17
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15274375--15274420
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20
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1.97
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101
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1.97
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19
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1.98
15276097--15276430
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2.2
151
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23
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1.97
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1.81
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1.98
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2.2
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22
1.96
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19.7
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15338427--15338581
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2.0
195
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2.0
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1.96
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2.0
30
96
0
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27
21
19
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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1
5
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1.33
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24
18
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1.98
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4.5
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0
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17
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2
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1.97
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150
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27
20
25
1.99
15414683--15414760
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1.9
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5
104
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28
20
23
1.99
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15424717--15424779
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28
1.99
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0
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1.97
15462079--15462470
178
2.2
178
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2
511
30
18
25
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15462753--15462838
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2.0
44
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1.99
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18
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1.98
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28
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40
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27
23
2.00
15471539--15471770
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22
27
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144
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421
24
30
18
26
1.98
15485705--15486023
48
6.6
48
79
2
336
23
30
19
26
1.98
15493231--15493289
30
2.0
29
83
3
73
30
23
8
37
1.85
15496095--15496279
40
4.7
40
83
7
218
23
22
28
26
1.99
15496148--15496312
79
2.1
79
83
6
201
24
20
27
26
1.99
15502203--15502471
46
5.8
46
78
14
293
21
20
28
29
1.98
15502200--15502463
93
2.8
93
97
0
483
21
20
28
29
1.98
15507826--15507860
14
2.5
14
86
13
54
57
14
5
22
1.59
15510560--15510611
25
2.1
25
85
0
68
50
1
0
48
1.12
15511824--15511883
21
2.8
22
80
5
70
1
43
21
33
1.63
15512294--15512322
13
2.1
14
93
6
51
55
10
0
34
1.34
15516281--15516424
51
2.9
50
82
5
184
25
17
25
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15518893--15519070
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
15518914--15519069
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
15519487--15519710
112
2.0
112
99
0
439
37
16
12
33
1.86
15520174--15520364
96
2.0
96
97
0
364
35
26
6
31
1.81
15522942--15522979
11
3.4
11
82
17
51
73
13
0
13
1.09
15522943--15522989
23
2.1
23
88
11
71
72
10
2
14
1.21
15524556--15524664
26
4.2
25
94
4
173
34
4
24
35
1.76
15524556--15524664
51
2.1
52
93
1
184
34
4
24
35
1.76
15526105--15526179
26
2.8
26
85
4
87
34
22
12
30
1.91
15526283--15526395
27
4.2
27
85
3
129
16
23
23
36
1.94
15526281--15526395
54
2.1
54
88
3
169
16
23
23
36
1.94
15526457--15526496
19
2.0
22
85
14
59
17
2
47
32
1.61
15528791--15528873
38
2.2
38
89
4
123
25
12
32
30
1.92
15529757--15529804
23
2.1
23
84
7
62
37
14
10
37
1.81
15534542--15534607
33
2.0
33
87
0
96
27
6
42
24
1.78
15540450--15540501
27
1.9
27
96
0
95
61
13
1
23
1.42
15545826--15545858
8
4.1
8
100
0
66
24
12
39
24
1.89
15549992--15550022
16
1.9
16
93
0
53
45
0
29
25
1.54
15550353--15550389
18
2.1
18
89
0
56
32
10
8
48
1.67
15552117--15552354
118
2.0
118
98
0
458
37
14
23
24
1.92
15558963--15558999
19
1.9
19
100
0
74
16
16
18
48
1.81
15560313--15560339
12
2.2
12
100
0
54
18
7
37
37
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15561120--15561145
13
2.0
13
100
0
52
15
0
15
69
1.20
15563346--15563379
9
3.7
9
84
7
50
44
8
5
41
1.60
15563346--15563384
19
2.1
19
100
0
78
41
10
5
43
1.61
15563719--15563751
17
1.9
17
100
0
66
39
18
24
18
1.92
15563999--15564141
57
2.5
57
82
7
166
28
18
23
29
1.98
15566981--15567023
17
2.5
17
81
11
52
6
23
0
69
1.12
15567822--15567940
29
4.2
29
75
2
107
31
13
26
27
1.94
15578938--15579007
36
1.9
36
100
0
140
32
2
22
41
1.69
15587389--15587580
40
4.8
40
88
1
260
25
24
27
22
2.00
15588950--15588979
16
1.9
16
93
6
53
23
6
36
33
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284