Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  246  of  284  ( 34012 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82565978--82566012
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17
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0
0
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0
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2.0
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6
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2.0
46
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0
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3.2
22
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22
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2.0
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3.2
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0
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24
21
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26
1.99
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6.4
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313
25
21
26
26
1.99
82635829--82636004
40
4.4
39
84
6
203
25
21
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82635829--82636004
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80
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225
25
21
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26
1.99
82637601--82637689
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2.2
41
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0
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2.4
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2.0
25
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6
20
36
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2.2
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83
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35
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10
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64
0
1
34
1.01
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0
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0
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60
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2
2
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1.06
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1.10
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51
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30
1.94
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2.0
39
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0
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2.0
20
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50
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2
80
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1.68
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0
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2.8
46
90
0
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29
26
22
22
1.99
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2.2
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54
3
10
31
1.51
82687189--82687239
27
1.9
27
88
4
77
52
3
7
35
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
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21
26
23
1.99
82699909--82700596
122
5.6
122
84
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823
28
21
26
23
1.99
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19.7
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70
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17
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1.59
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15
1
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1.55
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0
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13
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25
0
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1.55
82702162--82702211
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22
0
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53
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93
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28
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1.99
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12
189
28
28
21
21
1.99
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0
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2.6
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145
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10
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1.54
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2.2
27
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100
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5
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1.63
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2.1
52
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1.54
82729456--82729633
27
6.6
27
82
3
178
29
27
15
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82729477--82729632
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1.9
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224
29
27
15
27
1.96
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40
2.0
40
97
0
147
37
7
25
29
1.84
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22
1.9
22
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0
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42
1.49
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2.6
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0
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27
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31
1.93
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111
30
34
18
16
1.93
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2.3
57
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35
16
19
1.94
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28
2.6
28
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0
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29
26
12
31
1.93
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75
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0
0.80
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0
0.79
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0
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2.1
21
82
0
52
34
25
2
38
1.68
82758005--82758030
7
3.7
7
100
0
52
26
0
15
57
1.38
82758530--82758591
30
2.1
30
87
6
90
32
43
12
11
1.79
82758644--82758682
18
2.2
18
90
0
60
25
25
10
38
1.87
82759067--82759139
31
2.3
32
77
9
78
41
0
5
53
1.24
82762108--82762484
126
3.0
127
85
3
471
27
16
15
40
1.89
82762611--82762717
34
3.3
34
77
10
141
42
20
0
36
1.52
82762576--82762718
64
2.2
64
92
4
236
44
20
1
34
1.60
82762621--82762718
30
3.1
30
76
11
115
44
19
0
35
1.51
82765381--82765508
43
3.2
43
66
21
121
28
7
8
55
1.56
82765378--82765567
78
2.5
77
86
3
249
28
6
10
55
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82768498--82768552
19
3.0
19
73
5
51
60
16
0
23
1.36
82777886--82777945
10
6.0
10
82
7
68
66
1
8
23
1.28
82787861--82787974
40
2.9
39
76
7
115
42
28
17
12
1.85
82791147--82791308
78
2.0
79
95
3
290
38
20
7
33
1.81
82792312--82792536
49
4.5
50
83
3
258
29
24
18
28
1.98
82792312--82792543
100
2.3
99
83
4
279
28
25
18
27
1.98
82792790--82792843
27
2.0
27
85
0
72
37
12
9
40
1.76
82797796--82797883
35
2.5
34
83
3
104
46
22
4
26
1.71
82813123--82813208
43
2.0
43
100
0
172
39
20
13
25
1.90
82813250--82813298
25
1.9
26
87
4
73
59
10
14
16
1.61
82821224--82821407
46
4.0
45
77
12
185
25
19
32
23
1.97
82827977--82828012
18
2.0
18
88
0
54
38
8
8
44
1.65
82831192--82831236
17
2.5
19
79
13
51
51
0
17
31
1.46
82831788--82831843
21
2.7
21
86
2
78
23
37
19
19
1.94
82836183--82836268
44
2.0
44
83
4
111
36
13
24
25
1.93
82836406--82836527
47
2.6
47
93
0
208
36
12
25
26
1.91
82836506--82836810
55
5.6
54
81
7
368
35
17
24
22
1.95
82836514--82836810
108
2.7
108
94
0
495
35
17
24
22
1.95
82836506--82836821
53
5.9
54
80
8
347
35
17
24
22
1.95
82841165--82841206
20
2.3
18
80
15
50
45
0
21
33
1.52
82841672--82842026
46
7.5
46
73
13
217
27
20
28
23
1.99
82841672--82841882
94
2.2
94
85
5
266
29
19
26
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82841672--82842032
48
7.6
49
74
10
173
27
20
29
22
1.99
82864903--82864963
20
3.2
20
68
21
51
47
1
6
44
1.39
82864988--82865031
16
2.8
16
76
13
54
59
0
6
34
1.24
82865413--82865450
20
1.9
20
84
10
51
57
0
10
31
1.32
82870571--82870877
47
6.5
47
74
13
204
26
21
29
22
1.99
82870568--82870786
94
2.4
94
83
5
277
24
21
30
23
1.99
82884014--82884052
18
2.2
18
100
0
78
66
5
7
20
1.36
82891239--82891272
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2.3
15
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52
29
5
0
64
1.17
82891281--82891306
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
82891741--82891783
22
2.0
22
86
9
61
34
2
6
55
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284