Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  214  of  284  ( 34012 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71023707--71023752
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3.1
15
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20
51
58
0
15
26
1.37
71024611--71024836
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25
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71037735--71037827
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2.0
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0
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39
10
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1.83
71038372--71038445
20
3.7
20
92
0
121
21
37
28
12
1.89
71041623--71041672
19
2.6
19
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9
57
56
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2
34
1.40
71043297--71043347
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3.2
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52
56
0
1
41
1.10
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2.0
23
90
4
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47
4
13
34
1.63
71051859--71052017
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5.9
27
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11
175
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24
19
1.96
71051859--71052020
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3.0
54
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238
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24
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1.96
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11.1
44
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8
306
19
22
21
36
1.95
71055693--71056164
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5.4
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82
6
450
20
22
21
36
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130
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21
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2.0
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92
0
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2.0
23
90
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0
0
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0
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0
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0
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100
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0
0
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100
0
50
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20
40
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18
3.8
18
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37
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40
1.75
71079386--71079474
36
2.4
37
83
1
108
37
8
13
40
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71088241--71088296
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2.2
26
96
0
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37
26
5
30
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12
2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
71090681--71090787
47
2.3
47
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0
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19
23
41
1.90
71090912--71091000
36
2.4
37
75
1
99
35
10
13
40
1.78
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94
5.7
94
80
3
524
33
19
19
27
1.96
71092263--71092758
187
2.6
187
82
2
593
33
19
19
27
1.96
71092890--71093042
44
3.3
44
69
19
123
35
18
19
26
1.95
71092263--71093105
94
9.0
94
74
6
501
34
18
19
27
1.95
71092880--71093018
50
3.0
47
72
17
128
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16
20
28
1.94
71093246--71093281
7
5.0
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52
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2
2
1.30
71093246--71093281
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2.5
15
86
4
56
52
41
2
2
1.30
71093240--71093281
22
2.0
21
90
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52
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4
1.44
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0
0
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100
0
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0
0
53
1.00
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2.5
22
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7
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45
1.50
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10
100
0
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7
0
0
0.38
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22
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73
19
63
66
6
0
26
1.16
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4
90
9
50
73
2
0
23
0.97
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23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
71112677--71112710
14
2.4
14
85
14
52
70
5
0
23
1.09
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2.1
19
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0
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38
25
0
35
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1.9
31
82
0
73
49
5
13
32
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
176
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2
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14
31
1.73
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20
2.3
20
88
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45
4
4
45
1.44
71121143--71121190
23
2.2
22
85
7
62
47
0
2
50
1.12
71135777--71135832
21
2.6
23
83
10
66
50
5
0
44
1.25
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42
4.0
42
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2
315
26
11
19
43
1.84
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42
2.5
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85
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147
29
26
13
29
1.94
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3.8
31
94
0
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24
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1.99
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50
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1.95
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2.0
31
93
0
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9
40
1.63
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50
2.5
51
90
5
199
35
16
22
25
1.94
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4.8
31
95
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20
28
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1.99
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7
157
29
15
25
29
1.96
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42
2.7
43
89
4
171
30
14
26
27
1.95
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18
5.1
18
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11
87
42
37
19
1
1.58
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6
10.7
6
82
0
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43
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1.60
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14
12
58
1.64
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17
5
44
1.73
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23
1.9
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1.03
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24
80
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65
83
3
3
9
0.88
71202174--71202228
11
4.8
11
75
6
56
83
3
3
9
0.88
71219044--71219088
16
2.7
17
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16
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48
0
0
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1.00
71220286--71220333
26
1.9
25
83
8
62
50
12
2
35
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71221290--71221339
3
16.7
3
100
0
100
32
0
0
68
0.90
71223096--71223133
20
1.9
20
88
0
58
23
10
28
36
1.88
71224765--71224797
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3.3
10
91
0
57
87
3
9
0
0.63
71229656--71229699
5
8.6
5
97
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79
59
0
2
38
1.10
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2.0
17
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0
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50
0
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2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
71237191--71237263
5
14.6
5
76
20
64
54
4
1
39
1.28
71237192--71237234
19
2.3
19
92
8
70
55
0
2
41
1.12
71237198--71237262
24
2.7
24
80
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69
56
4
1
36
1.29
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2.0
64
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0
179
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217
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12
23
38
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20
2.2
21
88
11
67
37
0
6
55
1.26
71257223--71257304
40
2.0
40
97
0
155
50
20
9
19
1.76
71258575--71258687
54
2.1
54
90
3
185
30
0
6
62
1.25
71259428--71259457
15
2.0
15
100
0
60
26
0
6
66
1.16
71262352--71262383
14
2.3
14
100
0
64
31
46
15
6
1.71
71267091--71267120
14
2.1
14
100
0
60
33
46
13
6
1.69
71268705--71269011
152
2.0
152
100
0
614
42
14
10
32
1.80
71269748--71269797
24
2.1
24
96
0
91
30
26
0
44
1.55
71272344--71272391
8
5.8
8
78
9
51
16
12
27
43
1.84
71275047--71275208
81
2.0
81
98
0
315
26
39
6
27
1.81
71276912--71276951
8
4.8
8
82
11
53
17
12
25
45
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71277385--71277478
34
2.8
33
84
7
118
39
15
1
43
1.54
71277515--71277592
34
2.3
35
84
4
97
48
19
2
29
1.62
71278643--71278685
19
2.2
20
84
12
54
39
0
2
58
1.11
71279221--71279253
17
1.9
17
93
0
57
36
18
12
33
1.88
71279950--71280029
32
2.5
32
84
6
110
23
11
15
50
1.76
71280071--71280177
49
2.2
48
77
11
110
29
10
11
48
1.72
71281440--71281474
5
6.6
5
87
12
52
22
0
0
77
0.78
71284077--71284268
95
2.0
95
98
0
375
33
17
26
22
1.96
71284818--71285002
39
4.7
39
95
0
334
29
26
22
22
1.99
71287877--71287921
12
3.6
13
77
16
51
55
0
4
40
1.20
71289032--71289225
50
3.9
50
73
8
160
29
11
20
38
1.88
71289059--71289248
100
1.9
100
80
4
222
30
11
19
38
1.87
71289646--71289690
12
3.6
13
77
16
51
55
0
4
40
1.20
71290403--71290482
40
2.0
41
95
2
144
28
7
11
52
1.64
71290850--71290892
22
2.0
22
100
0
86
34
9
23
32
1.87
71297510--71297674
39
4.2
39
92
0
267
30
26
20
23
1.98
71298134--71298171
9
4.3
9
96
3
69
44
7
0
47
1.32
71301065--71301134
35
2.0
35
88
0
104
47
17
20
15
1.83
71302553--71302598
5
9.6
5
90
9
78
19
0
0
80
0.71
71302872--71302903
17
1.9
17
93
6
57
28
18
9
43
1.81
71305397--71305511
55
2.1
56
80
8
128
34
22
23
19
1.96
71305430--71305511
27
3.0
27
80
7
94
31
23
25
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71305617--71305680
28
2.3
28
94
0
110
31
7
28
32
1.85
71305917--71305948
8
4.0
8
91
0
55
3
25
25
46
1.67
71316011--71316125
55
2.1
56
83
8
146
34
21
24
19
1.96
71316036--71316125
27
3.2
27
85
7
119
32
23
24
20
1.98
71321663--71321709
24
2.0
24
91
8
78
68
4
4
23
1.26
71326889--71326929
21
2.0
21
85
0
55
31
2
26
39
1.70
71329210--71329257
26
1.9
24
87
8
69
64
8
0
27
1.22
71335020--71335077
25
2.3
25
84
0
71
25
32
15
25
1.95
71335067--71335114
25
1.9
25
82
0
60
27
22
14
35
1.93
71336044--71336128
32
2.8
30
80
12
84
51
10
1
36
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284