Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  39  of  284  ( 34012 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.82
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19
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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1.96
13843641--13843823
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1.96
13843782--13843960
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56
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13877404--13877472
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29
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1.98
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1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.99
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1.99
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1.84
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30
17
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
26
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25
1.99
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0
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21
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29
18
22
1.98
14005081--14005290
106
2.0
106
95
0
375
26
20
23
29
1.99
14005316--14005375
30
2.0
30
100
0
120
40
16
6
36
1.75
14006102--14006217
58
2.0
58
98
0
223
40
3
16
39
1.65
14007881--14008026
40
3.7
40
84
7
181
23
22
27
26
2.00
14007881--14008059
80
2.2
80
81
6
195
25
21
26
25
2.00
14010065--14010170
28
3.8
28
79
1
122
28
15
32
24
1.95
14010470--14010943
27
17.7
27
86
1
551
38
20
11
30
1.87
14010470--14010943
80
5.9
80
84
3
567
38
20
11
30
1.87
14010896--14010983
27
3.3
27
88
3
115
39
15
17
27
1.90
14010910--14011011
27
3.8
26
79
12
75
34
17
19
28
1.95
14015376--14015547
46
3.7
45
76
11
179
29
26
20
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14015381--14015551
93
1.8
93
91
2
281
29
26
21
22
1.99
14022595--14022985
47
8.3
47
95
0
674
33
8
30
27
1.86
14023104--14023182
37
2.1
37
88
0
113
25
17
31
25
1.97
14043560--14043614
28
2.0
27
85
3
74
23
25
18
32
1.97
14043569--14043625
28
2.0
28
82
0
69
21
22
21
35
1.96
14048440--14048576
46
3.0
46
85
0
184
27
29
8
35
1.87
14048550--14048975
47
9.1
47
89
0
602
25
28
11
34
1.90
14048687--14048758
23
3.1
22
67
30
60
23
31
12
31
1.92
14048828--14048902
22
3.3
22
68
17
71
25
26
13
34
1.93
14052932--14053286
40
8.9
40
88
1
489
25
29
21
23
1.99
14054783--14054919
46
3.0
46
91
0
220
25
31
8
34
1.86
14054893--14055318
47
9.1
47
89
0
584
25
29
10
33
1.90
14065764--14065905
75
1.9
75
86
2
205
44
8
14
32
1.76
14065887--14066436
140
4.0
140
83
4
715
39
8
6
45
1.60
14068859--14069113
55
4.8
52
80
10
227
36
17
23
21
1.94
14068866--14069066
108
1.8
110
87
4
300
35
17
23
22
1.95
14073262--14073325
18
3.6
18
89
4
94
45
15
17
21
1.85
14073653--14073878
27
8.3
27
82
4
249
42
20
12
24
1.87
14073653--14073878
54
4.2
54
84
2
283
42
20
12
24
1.87
14073657--14073878
81
2.7
81
84
5
288
41
20
12
24
1.87
14082526--14082660
29
4.8
28
83
5
164
25
30
14
29
1.95
14082526--14082672
57
2.6
56
83
9
172
27
29
12
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14082884--14082942
16
3.7
16
95
0
91
5
16
23
54
1.62
14082892--14082943
24
2.2
23
89
3
77
5
15
25
53
1.63
14082892--14082943
8
6.6
8
80
10
63
5
15
25
53
1.63
14090482--14090590
28
3.9
28
77
9
114
25
30
12
31
1.93
14090525--14090610
28
3.1
27
81
6
100
27
31
12
27
1.93
14090821--14090863
16
2.7
16
85
0
59
4
16
20
58
1.56
14093982--14094157
46
3.8
46
78
8
196
28
30
19
21
1.98
14093989--14094160
93
1.8
93
92
2
292
27
30
20
21
1.98
14105784--14105928
27
5.4
27
84
3
175
35
17
20
26
1.95
14105784--14105929
54
2.7
54
83
0
193
34
17
20
26
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284