Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  190  of  284  ( 34012 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64099987--64100050
31
2.1
31
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5
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40
10
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34
1.80
64102130--64102188
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1.9
32
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3
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55
1.38
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193
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19
23
28
1.98
64108928--64109234
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3.3
94
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12
337
29
17
23
29
1.97
64108881--64109330
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2.5
181
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1
659
30
17
22
29
1.97
64109249--64109562
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6.8
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11
194
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19
26
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64109291--64109554
49
5.7
45
78
6
208
34
18
19
26
1.95
64109249--64109516
49
5.7
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73
9
140
35
18
19
26
1.94
64109063--64109605
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3.9
138
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432
34
17
19
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1.95
64111021--64111076
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2.2
24
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9
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17
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62
1.46
64111360--64111442
3
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7
51
28
9
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57
1.47
64111375--64111437
24
2.6
24
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5
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28
9
4
57
1.51
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121
2.0
120
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2
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33
8
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44
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23
2.0
22
88
12
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4
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1.16
64118732--64118777
22
2.0
23
88
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60
4
0
34
1.16
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2
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1.83
64119918--64119983
17
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2
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12
30
40
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1.85
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80
0
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0.84
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1.9
99
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10
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1.84
64127686--64127731
16
2.8
16
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58
2
4
34
1.30
64129992--64130134
57
2.4
57
82
9
171
29
19
26
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64130208--64130338
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2.0
67
98
0
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19
17
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28
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64137649--64137716
34
2.0
34
100
0
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23
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20
1.89
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30
2.1
30
90
0
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55
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4
25
1.58
64145573--64145630
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3
89
41
12
17
29
1.85
64149959--64150038
31
2.5
31
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2
97
47
16
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1.76
64151521--64151582
30
2.1
30
96
0
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16
25
22
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1.94
64162147--64162212
33
2.0
33
90
0
105
34
18
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25
1.96
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1
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1.14
64191067--64191133
28
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64191084--64191140
28
2.0
28
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0
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64199254--64199294
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29
0
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1.13
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1.61
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0
0
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2.0
21
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58
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2
37
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64227496--64227555
25
2.3
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1
36
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1.36
64227506--64227564
16
3.6
16
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57
10
1
35
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64231873--64231935
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2.0
32
100
0
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20
50
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2.2
18
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33
0
0
66
0.92
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2.2
27
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5
68
16
31
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26
1.96
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2.5
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325
55
13
0
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64247130--64247171
12
3.5
12
81
9
50
66
14
0
19
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
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15
22
18
42
1.88
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27
3.2
24
76
11
79
18
28
20
32
1.96
64260197--64260342
25
6.0
23
73
11
89
20
27
18
33
1.96
64260196--64260335
73
1.9
74
81
7
169
20
27
17
34
1.95
64265757--64265812
26
2.2
26
90
3
87
37
16
17
28
1.91
64269478--64269517
11
3.5
11
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3
53
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2
2
22
1.09
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3
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100
0
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0
0
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9
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1.64
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2.2
20
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1.59
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2.0
21
90
0
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1.88
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0
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0
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21
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1
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25
21
21
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1.98
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64
31
2
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1.66
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1
15
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1
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0.80
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2.3
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1
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1.78
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25
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13
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36
20
24
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1.95
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48
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175
35
20
25
18
1.95
64298333--64298494
74
2.2
74
86
2
227
35
20
25
18
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64298333--64298496
49
3.3
48
74
13
156
35
20
25
18
1.95
64300635--64300702
31
2.2
32
84
7
86
58
8
10
22
1.58
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16
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17
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3
15
0
0.82
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3
27.7
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4
71
36
4
1
57
1.27
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24
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2
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1
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1.34
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12
2.2
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100
0
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18
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18
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1.65
64315347--64315382
15
2.5
14
86
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54
44
2
8
44
1.48
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12
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11
74
16
57
18
5
2
73
1.14
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15
2.4
15
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54
45
0
8
45
1.34
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100
0
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0
0
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25
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19
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60
1.54
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2.0
48
97
0
176
20
25
14
38
1.91
64352520--64352581
24
2.6
24
94
0
106
37
6
25
30
1.81
64357906--64357959
26
2.1
26
92
0
90
33
7
18
40
1.78
64367620--64367672
20
2.6
21
88
5
74
67
1
5
24
1.22
64368268--64368307
21
2.0
20
85
5
53
57
5
10
27
1.52
64372277--64372309
12
2.8
12
90
9
50
30
18
6
45
1.73
64375303--64375465
17
9.4
17
67
19
70
68
4
6
20
1.31
64376845--64377308
44
9.9
49
73
15
210
28
19
17
34
1.94
64376842--64377322
95
5.2
95
80
6
445
28
19
17
35
1.94
64376902--64377343
45
9.6
45
75
13
314
28
20
16
34
1.95
64377001--64377343
89
3.8
90
80
6
302
29
21
16
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64376914--64377338
134
3.1
133
77
9
401
28
20
16
33
1.95
64377001--64377343
179
1.9
180
82
6
433
29
21
16
33
1.95
64384651--64384685
3
11.7
3
93
0
61
65
0
2
31
1.07
64386146--64386208
13
4.9
13
76
1
65
34
6
23
34
1.81
64389661--64389759
49
2.0
49
98
0
189
36
22
12
29
1.90
64389880--64389973
47
2.0
47
100
0
188
38
19
6
36
1.77
64393459--64393491
6
5.5
6
100
0
66
33
0
0
66
0.92
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34
1.9
34
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6
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48
0
3
48
1.17
64394780--64394823
14
3.1
14
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0
61
38
13
0
47
1.43
64397602--64397647
23
2.0
23
100
0
92
47
0
21
30
1.51
64397768--64397812
18
2.5
18
92
0
72
48
0
4
46
1.22
64400858--64400891
17
1.9
18
88
5
52
64
0
5
29
1.17
64404244--64404506
46
5.7
46
88
2
330
42
13
23
20
1.87
64404247--64404506
92
2.8
93
88
0
369
43
13
23
20
1.87
64406519--64406695
50
3.5
50
88
3
257
35
14
23
25
1.93
64406671--64406788
31
3.8
31
93
0
191
27
17
27
27
1.98
64414739--64414882
73
2.0
73
87
0
207
24
13
29
32
1.93
64414890--64415063
46
3.8
46
85
0
222
40
14
24
20
1.90
64415352--64415384
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
64416752--64416804
25
2.2
23
83
12
63
26
11
3
58
1.49
64421097--64421133
18
2.1
18
94
0
65
40
29
8
21
1.82
64426767--64426823
3
18.0
3
85
10
62
31
0
5
63
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64426906--64426952
12
4.0
12
80
2
51
36
0
4
59
1.17
64430555--64430607
22
2.5
21
74
17
56
39
1
0
58
1.09
64430572--64430624
27
2.0
27
85
10
74
41
0
0
58
0.98
64430676--64430708
14
2.3
15
89
5
50
39
3
3
54
1.31
64438029--64438077
20
2.5
20
89
0
71
28
6
10
55
1.57
64445437--64445468
15
2.1
15
100
0
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12
12
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1.80
64456492--64456535
22
2.0
22
100
0
88
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22
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1.92
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115
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0
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25
21
25
26
2.00
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2.1
29
85
8
81
77
1
8
13
1.07
64466440--64466486
24
2.0
24
84
8
62
72
0
19
8
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284