Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: At_chr10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 95480121

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   

This is table  22  of  284  ( 34012 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7435781--7435815
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1.96
7446459--7446614
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1.9
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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1.98
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Period
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Number
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21
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27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
24
1.99
7686550--7686669
54
2.2
54
86
5
172
23
20
18
38
1.93
7686550--7686669
27
4.4
27
76
10
111
23
20
18
38
1.93
7686661--7686950
27
10.8
26
89
2
339
38
15
12
33
1.86
7686661--7686950
54
5.4
54
90
3
415
38
15
12
33
1.86
7686658--7686950
81
3.6
81
87
4
403
38
16
12
33
1.86
7689056--7689090
17
2.1
17
88
0
52
54
0
5
40
1.24
7689032--7689106
36
2.1
35
85
9
98
53
2
2
41
1.29
7691005--7691053
25
2.0
25
92
8
82
26
22
28
22
1.99
7691174--7691227
25
2.2
25
82
0
63
33
20
25
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7691401--7691487
21
4.3
21
64
21
60
47
14
2
35
1.58
7691369--7691487
59
2.0
59
98
0
229
44
15
3
36
1.64
7697974--7698094
47
2.6
47
86
5
156
24
13
29
32
1.93
7702315--7702346
15
2.1
15
94
0
55
68
9
6
15
1.36
7710036--7710071
9
3.9
9
92
3
54
66
0
5
27
1.13
7713930--7713958
15
2.0
15
93
6
51
48
6
0
44
1.29
7719281--7719319
18
2.4
16
87
12
53
33
7
7
51
1.59
7719545--7719678
65
2.1
65
90
2
207
33
14
5
46
1.68
7722296--7722744
224
2.0
224
96
0
835
36
12
19
31
1.89
7728932--7729012
43
1.9
42
87
2
117
24
29
18
27
1.98
7728930--7729034
42
2.5
43
82
1
122
31
27
16
24
1.96
7731364--7731455
45
2.0
45
97
0
175
43
10
11
33
1.77
7733547--7733578
16
2.0
16
93
0
55
21
0
6
71
1.07
7733610--7733654
22
2.0
22
100
0
90
53
0
26
20
1.46
7733801--7733863
28
2.2
28
85
0
90
33
6
28
31
1.82
7739201--7739263
28
2.2
28
88
0
90
33
6
28
31
1.82
7739422--7739465
15
3.0
14
86
6
61
25
0
2
72
0.96
7739421--7739464
7
6.0
7
86
7
61
27
0
2
70
0.99
7740171--7740225
20
2.7
21
80
2
67
43
34
0
21
1.53
7740269--7740306
15
2.6
14
88
8
58
42
36
0
21
1.53
7740332--7740374
14
3.2
13
87
9
59
46
32
0
20
1.51
7740468--7740567
7
14.0
7
68
11
51
42
36
1
21
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7740468--7740515
22
2.2
22
85
3
62
43
29
0
27
1.55
7740510--7740555
22
2.1
22
83
0
56
41
41
2
15
1.59
7740521--7740567
22
2.2
22
85
11
62
40
44
0
14
1.46
7745789--7745909
63
1.9
63
84
0
161
23
25
23
27
2.00
7753664--7753790
63
2.0
63
81
6
150
25
23
22
28
1.99
7756277--7756306
16
1.9
15
93
6
51
76
3
6
13
1.11
7765035--7765071
12
3.0
13
84
11
51
29
40
18
10
1.85
7766870--7766895
13
2.0
13
100
0
52
53
0
0
46
1.00
7768930--7768959
7
4.3
7
95
0
51
50
0
0
50
1.00
7772302--7772343
21
2.0
21
81
9
50
33
4
9
52
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284