Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  106989029

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   

This is table  161  of  322  ( 38559 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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1
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18
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2
64
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2.0
201
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567
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5
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30
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2.0
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2
6
25
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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4
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133
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19
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5.2
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1.98
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18
24
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1.98
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172
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18
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1.98
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572
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32
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1.97
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5.2
19
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7
155
38
10
15
35
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53137116--53137199
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2.4
35
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111
38
10
14
36
1.81
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2.0
47
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13
32
1.94
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2.5
51
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188
24
24
17
34
1.95
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11
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11
4
42
1.60
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2.2
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10
54
67
5
5
20
1.33
53153728--53153828
3
33.3
3
71
5
51
57
3
10
27
1.51
53155530--53155674
45
3.1
47
82
7
147
29
21
15
33
1.95
53155576--53155674
45
2.2
44
89
7
155
29
23
16
31
1.96
53155577--53155698
45
2.7
45
86
3
122
30
22
17
30
1.96
53155682--53155949
68
3.9
68
86
0
374
26
20
24
28
1.99
53155681--53155949
136
2.0
136
92
0
448
26
20
24
28
1.99
53155995--53156629
85
7.5
85
91
1
977
21
24
20
33
1.97
53156050--53156620
41
13.5
41
64
10
200
20
24
21
33
1.97
53158507--53158547
16
2.4
18
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8
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2
9
7
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0.99
53158500--53158545
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2.1
22
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2
8
6
82
0.91
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12
3.9
12
79
10
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65
6
12
16
1.45
53162394--53162427
15
2.2
16
90
10
54
67
5
5
20
1.33
53162420--53162607
3
63.0
3
72
10
118
59
3
7
28
1.43
53164187--53165112
207
4.5
207
93
0
1487
29
22
17
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53164187--53165112
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2.2
413
91
0
1503
29
22
17
30
1.97
53165235--53165395
84
1.9
86
83
6
211
22
22
24
30
1.99
53165234--53165434
87
2.4
79
78
12
215
22
22
25
29
1.99
53166363--53166458
1
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1
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0
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4
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0
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4
11
0
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0.77
53166363--53166458
7
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7
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16
83
4
11
0
84
0.76
53166363--53166458
36
2.7
34
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9
104
4
11
0
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2.0
21
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18
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10
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1.82
53171838--53171979
35
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38
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10
35
1.82
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57
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11
4.0
11
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0
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2
2
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2.0
21
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55
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1.60
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0
0
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0
0
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3.1
15
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1.46
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2.0
27
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25
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30
1.9
30
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1.90
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22
2.0
22
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11
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23
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53187109--53187159
26
2.0
26
96
0
93
25
21
23
29
1.99
53191792--53191836
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2.1
22
91
4
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0
0
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18
2.2
16
90
9
56
32
0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53191796--53191848
16
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0
0
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0
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50
0
0
50
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1
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9
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1.30
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3
79
1.00
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100
0
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0
0
66
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322