Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  106989029

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   

This is table  186  of  322  ( 38559 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61214664--61214688
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0
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0
0
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27
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2.0
151
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23
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18
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182
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48
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96
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25
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2.0
36
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0
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19
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
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2.0
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2.0
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0
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0
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16
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0
104
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32
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23
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39
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29
24
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1.99
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2.2
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2.00
61339094--61339270
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241
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23
27
23
2.00
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5.9
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23
23
26
26
2.00
61352887--61353148
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2.0
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71
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4
19
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15
7
0
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0.98
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27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
1.96
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27
6.6
27
80
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164
29
28
16
25
1.97
61409606--61409761
82
1.9
81
85
3
215
28
28
16
25
1.97
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2.0
19
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11
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15
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0
0
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1.62
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1.65
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12
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158
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1.80
61457523--61457566
21
2.1
21
91
0
70
40
15
6
36
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61458058--61458357
44
6.8
44
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3
352
32
24
13
30
1.93
61457914--61458143
118
1.9
119
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3
329
26
26
14
31
1.95
61458106--61458354
133
1.9
133
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1
374
30
24
12
32
1.93
61458027--61458357
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1.9
177
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1
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30
25
12
31
1.93
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88
87
0
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25
25
21
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1.99
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0
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15
2.6
15
83
0
51
17
23
5
53
1.63
61481479--61481522
2
22.0
2
85
0
61
45
2
2
50
1.27
61482202--61482245
2
22.0
2
85
0
61
45
2
2
50
1.27
61481932--61483333
701
2.0
701
99
0
2777
28
10
7
53
1.62
61482903--61482946
2
22.0
2
85
0
61
45
2
2
50
1.27
61483732--61483928
98
2.0
98
94
0
349
28
9
24
37
1.87
61503287--61503314
5
5.6
5
100
0
56
21
0
60
17
1.36
61503286--61503330
15
3.0
15
84
9
56
20
8
55
15
1.66
61505288--61505374
31
2.8
31
89
0
129
19
17
14
48
1.81
61507888--61507924
8
4.5
8
86
6
56
8
13
2
75
1.13
61507885--61507919
17
2.1
17
100
0
70
5
11
5
77
1.12
61507944--61507990
24
2.0
24
84
8
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53
4
0
42
1.20
61508115--61508142
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
61510784--61510868
27
3.2
26
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6
62
42
16
14
27
1.86
61510777--61510884
54
2.0
54
96
0
198
43
16
11
28
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61515061--61515088
5
5.6
5
100
0
56
21
0
60
17
1.36
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15
3.0
15
84
9
56
20
8
55
15
1.66
61515585--61516609
108
9.5
102
69
18
440
29
17
19
33
1.94
61515916--61516175
107
2.4
108
81
5
321
28
16
20
34
1.95
61516154--61516205
27
1.9
27
96
0
95
7
23
32
36
1.83
61516186--61516601
104
4.0
100
77
13
315
28
18
19
33
1.95
61516225--61516730
221
2.4
209
79
11
526
29
16
19
34
1.94
61519517--61519597
31
2.6
31
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0
108
18
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16
49
1.80
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2.3
36
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0
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10
21
1.83
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2.2
126
83
4
347
30
20
14
34
1.93
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2.5
95
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17
2
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1.64
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2.9
96
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7
305
41
16
2
39
1.63
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7
6.3
7
89
5
61
48
41
0
9
1.35
61526756--61526813
21
2.8
20
78
5
62
48
41
0
10
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37
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0
115
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1
2
49
1.25
61537850--61537880
5
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5
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0
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19
1.86
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2.8
12
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13
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81
3
0
15
0.80
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7
4.0
7
100
0
56
28
57
0
14
1.38
61547936--61547978
21
2.0
20
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50
39
32
0
27
1.57
61547974--61548025
7
7.6
7
82
8
63
32
51
0
15
1.43
61547961--61548025
21
3.2
19
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22
51
33
47
0
18
1.49
61548179--61548211
15
2.3
15
89
5
50
36
30
0
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61548722--61548858
40
3.5
40
89
3
197
18
19
21
39
1.93
61551259--61551288
15
1.9
16
93
6
53
56
0
0
43
0.99
61551253--61551315
18
3.9
16
73
16
51
50
0
4
44
1.23
61560220--61560296
39
2.0
39
82
10
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33
2
19
44
1.65
61560252--61560338
43
2.0
43
86
4
122
29
5
19
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1.74
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25
2.0
25
83
0
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2.0
43
95
0
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15.2
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309
41
20
17
20
1.90
61577275--61577689
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5.1
81
81
4
410
42
20
17
20
1.90
61578059--61578161
28
3.7
28
88
2
145
21
25
23
30
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322