Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  106989029

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   

This is table  253  of  322  ( 38559 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.94
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138
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18
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2.2
24
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1
3
54
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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19
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11.5
6
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5
2
76
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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25
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29
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18
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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1
4
40
1.33
84247000--84247037
19
2.0
19
100
0
76
47
15
10
26
1.78
84253297--84253345
21
2.3
21
79
6
55
46
0
24
28
1.53
84262711--84262751
11
3.7
11
83
0
55
19
14
4
60
1.51
84262745--84262829
36
2.4
36
95
0
152
25
3
14
56
1.54
84264794--84264844
16
3.1
16
81
13
52
29
5
1
62
1.29
84271178--84271273
49
2.0
49
93
0
165
30
16
18
34
1.93
84274428--84274476
18
2.7
18
90
3
71
36
4
12
46
1.60
84276179--84276219
17
2.4
17
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4
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29
4
9
56
1.53
84287809--84287847
6
6.5
6
93
0
69
12
0
35
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1.40
84287801--84287841
18
2.3
18
91
0
64
12
2
36
48
1.54
84301697--84301749
27
2.0
27
92
0
88
37
16
13
32
1.88
84306558--84306689
40
3.3
40
88
5
189
25
27
21
25
2.00
84309108--84309166
30
2.0
30
96
0
109
32
6
28
32
1.83
84309565--84309593
5
5.8
5
100
0
58
20
0
0
79
0.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84316741--84316822
26
3.2
26
96
0
155
36
26
6
30
1.81
84325092--84325137
21
2.2
21
84
3
58
41
2
4
52
1.33
84325128--84325215
29
3.1
30
72
18
80
56
1
1
40
1.14
84325166--84325199
17
1.9
18
94
5
61
58
0
0
41
0.98
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19
3.1
18
87
9
73
62
1
0
36
1.06
84325338--84325382
23
2.0
23
86
8
65
57
0
2
40
1.11
84325409--84325506
23
4.2
24
73
18
68
70
6
5
18
1.27
84325658--84325693
19
1.9
19
88
5
56
41
5
0
52
1.24
84337873--84338143
48
5.7
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11
209
25
22
30
21
1.99
84337860--84338143
96
3.0
96
83
6
317
26
22
30
21
1.99
84337866--84338143
144
1.9
143
84
7
366
25
22
30
21
1.98
84354025--84354237
95
2.3
94
83
7
258
39
20
9
30
1.84
84354362--84354432
20
3.8
18
73
17
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1
4
22
1.11
84354363--84354432
9
7.4
9
72
15
61
71
1
4
22
1.12
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10
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11
70
15
58
38
1
0
60
1.04
84354692--84354779
21
4.1
21
76
13
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35
1
0
63
1.02
84354692--84354779
22
4.1
22
78
11
78
35
1
0
63
1.02
84354689--84354785
11
9.4
10
72
12
63
38
1
0
60
1.03
84354799--84354977
89
2.0
91
85
6
249
32
8
19
39
1.82
84355458--84355533
34
2.4
31
79
14
100
28
11
6
52
1.63
84357590--84357640
19
2.7
19
87
0
75
56
5
0
37
1.23
84362050--84362138
37
2.4
38
86
1
126
34
8
21
34
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84365129--84365156
7
4.0
7
100
0
56
28
0
0
71
0.86
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35
2.4
35
84
5
91
38
9
22
29
1.85
84376006--84376076
35
2.0
35
97
0
133
36
11
18
33
1.86
84376759--84376787
12
2.5
12
94
5
51
86
0
13
0
0.58
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14
2.1
15
93
6
53
63
13
10
13
1.52
84419007--84419873
425
2.1
412
94
3
1493
27
22
20
30
1.98
84424690--84425651
479
2.0
479
100
0
1924
32
12
17
37
1.88
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19
2.0
19
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0
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23
21
7
47
1.77
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40
5.3
39
89
4
242
25
21
27
25
1.99
84428911--84429173
120
2.2
120
82
4
309
25
21
27
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322