Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  106989029

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   

This is table  250  of  322  ( 38559 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.2
21
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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30
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83097807--83097875
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2
164
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1.97
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101
2.8
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332
23
17
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30
1.97
83152418--83152693
50
5.6
49
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306
23
17
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1.97
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28
20
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1.99
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45
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15
114
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28
20
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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137
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1.97
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1.96
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26
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28
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1.99
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1.87
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2.7
21
73
10
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52
12
14
21
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83212752--83212881
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20
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1.98
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28
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27
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21
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9
57
47
2
10
40
1.50
83227235--83227267
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
83228653--83228789
42
3.1
42
72
11
121
29
16
25
28
1.96
83228655--83228829
90
1.9
90
82
4
219
29
17
26
26
1.98
83231583--83231640
29
2.1
26
81
15
64
62
17
6
13
1.52
83234265--83234294
15
2.1
15
93
6
53
6
23
0
70
1.11
83238515--83238825
46
6.6
47
78
12
248
27
19
29
23
1.98
83238563--83238777
46
4.6
48
84
11
268
26
19
32
22
1.97
83238930--83238972
21
2.0
21
90
0
68
25
4
30
39
1.76
83254934--83254969
18
2.0
18
100
0
72
33
5
16
44
1.71
83257661--83257780
63
1.9
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163
33
7
7
51
1.58
83260142--83260314
46
3.8
44
74
15
129
28
20
27
23
1.99
83261419--83261491
38
1.9
38
88
0
110
21
19
38
20
1.94
83266945--83266976
10
3.3
10
95
4
57
62
0
6
31
1.20
83266972--83267034
27
2.3
26
76
10
63
50
11
0
38
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83267001--83267030
15
2.0
15
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0
51
40
10
0
50
1.36
83268619--83268680
30
2.1
30
90
0
97
29
3
6
61
1.37
83269005--83269036
10
3.3
10
95
4
57
62
0
6
31
1.20
83269032--83269094
27
2.3
26
76
10
63
50
11
0
38
1.38
83269061--83269090
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
83270110--83270168
30
2.0
30
100
0
118
20
33
0
45
1.51
83270734--83270784
22
2.4
22
80
3
59
17
39
31
11
1.86
83273436--83273581
52
2.8
52
89
3
204
25
15
28
30
1.96
83273691--83273806
30
3.9
30
82
3
128
30
20
4
44
1.71
83273691--83273820
30
4.4
30
78
10
106
32
19
3
44
1.68
83279555--83279593
15
2.6
15
88
12
62
79
2
17
0
0.84
83281181--83282141
83
11.5
83
95
2
1757
29
14
19
36
1.92
83282165--83283141
75
12.9
75
82
8
1051
29
16
20
33
1.95
83282738--83283141
85
5.0
83
77
10
328
29
15
19
35
1.92
83282923--83283110
72
2.5
76
87
4
249
32
16
19
31
1.94
83283087--83283188
53
1.9
52
84
7
134
25
13
27
33
1.94
83283010--83283266
124
2.0
129
87
4
371
27
15
22
33
1.95
83283140--83283417
85
3.7
72
82
8
272
31
16
20
31
1.95
83283140--83283419
73
3.7
71
79
11
256
31
16
20
31
1.95
83282921--83283417
273
1.8
266
81
8
584
31
16
20
31
1.95
83283423--83283596
54
3.2
54
95
0
303
28
14
19
37
1.91
83283542--83283923
71
5.3
74
86
5
487
30
17
17
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83283832--83284493
87
7.6
87
88
6
839
27
17
17
36
1.93
83283832--83284686
174
4.8
172
84
8
866
26
17
18
37
1.93
83284341--83284374
16
2.1
16
94
0
59
17
8
5
67
1.37
83284530--83284558
15
1.9
15
100
0
58
13
6
6
72
1.26
83284634--83284802
55
3.1
55
86
6
243
28
15
17
37
1.91
83285072--83285186
29
3.9
29
80
8
110
30
21
3
44
1.69
83285069--83285199
29
4.5
29
71
16
74
33
19
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18
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1.70
83292472--83292502
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5.2
6
96
0
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35
0
0
64
0.94
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3
25.0
3
77
15
77
64
2
3
28
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322