Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  106989029

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   

This is table  32  of  322  ( 38559 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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60
47
1
0
50
1.11
9750577--9750605
14
2.1
14
93
6
51
24
0
0
75
0.80
9750571--9750607
18
1.9
18
89
10
56
27
0
0
72
0.84
9750621--9750680
22
2.6
23
84
7
77
40
0
3
56
1.16
9750658--9750746
33
2.6
34
78
8
92
39
2
3
55
1.29
9750722--9750773
20
2.6
20
79
11
54
53
0
0
46
1.00
9750678--9751027
139
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137
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13
382
39
2
3
54
1.32
9750860--9750900
13
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13
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31
0
4
63
1.15
9750817--9750892
33
2.3
33
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10
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32
0
5
61
1.18
9750851--9750929
24
3.3
24
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37
1
3
56
1.25
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13
2.0
13
100
0
52
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0
0
61
0.96
9750985--9751027
22
1.9
23
90
4
70
44
0
0
55
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9750957--9751041
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29
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10
82
41
0
0
58
0.98
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30
3.5
30
82
5
120
25
16
26
31
1.96
9757562--9757646
40
2.1
40
91
2
116
51
3
7
37
1.46
9757573--9757644
20
3.6
20
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14
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2
6
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1.43
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23
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0
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20
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5
0
17
0.96
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20
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1
0
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1.06
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1
0
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1
1
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1.17
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0
0
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2
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17
2.7
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39
0
0
60
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18
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1.70
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23
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55
14
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20
2.0
20
100
0
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0
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28
4.3
29
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129
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0
11
41
1.46
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33
2.0
34
87
3
98
45
0
9
45
1.35
9777503--9777631
62
2.1
61
84
7
163
45
0
11
41
1.46
9777588--9777646
28
2.1
27
84
9
75
35
1
16
45
1.58
9777716--9778348
126
5.1
126
86
4
729
40
14
16
28
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9777715--9778343
248
2.5
248
83
7
737
40
14
16
28
1.88
9778114--9778378
119
2.2
119
99
0
521
38
15
15
29
1.89
9778446--9778517
25
2.9
25
82
0
81
54
5
19
20
1.64
9780955--9781041
21
4.0
23
75
10
74
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22
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17
1.93
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2.0
20
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0
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42
0
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1.30
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28
4.4
28
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139
45
0
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40
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9788404--9788532
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2.1
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179
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0
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248
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15
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1.87
9788625--9789371
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14
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1.86
9789469--9789540
25
2.9
25
82
0
81
54
5
19
20
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322