Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  106989029

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   

This is table  297  of  322  ( 38559 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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134
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31
15
21
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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0
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0
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131
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
32
1.95
98788309--98789722
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2.3
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17
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1.95
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1.98
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50
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197
23
26
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98873192--98873340
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1.9
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1.98
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30
18
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1.98
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28
85
3
76
64
5
5
25
1.36
98909649--98909725
36
2.2
36
90
2
120
15
11
15
57
1.66
98914584--98914608
12
2.1
12
100
0
50
48
8
0
44
1.32
98914930--98914968
19
2.1
19
85
0
51
61
12
0
25
1.31
98915159--98915793
322
2.0
319
84
4
837
40
14
26
18
1.89
98922429--98922480
27
2.0
26
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11
70
25
5
15
53
1.63
98923548--98923580
15
2.2
15
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10
50
66
0
0
33
0.92
98923545--98923583
16
2.5
15
80
19
53
61
0
0
38
0.96
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38
2.1
38
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0
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46
11
20
22
1.82
98933403--98933462
29
2.1
29
100
0
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1.88
98934094--98934211
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2.1
57
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5
16
26
1.68
98935076--98935128
27
1.9
28
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3
72
7
69
0
22
1.13
98936312--98936353
22
1.9
22
95
0
75
33
9
2
54
1.46
98936302--98936352
22
2.4
21
84
9
68
37
7
1
52
1.42
98938278--98938318
21
2.0
21
85
0
55
51
2
9
36
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98939392--98939425
12
2.8
12
100
0
68
8
35
20
35
1.84
98944630--98944668
14
2.8
14
88
0
51
20
5
7
66
1.36
98944697--98944734
18
2.1
18
90
0
58
7
2
44
44
1.47
98945973--98946031
30
2.0
30
86
0
82
42
5
23
28
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50
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50
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298
25
18
25
30
1.98
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101
1.8
101
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4
269
25
18
25
30
1.98
98946799--98946988
101
1.9
101
91
2
310
25
20
24
30
1.99
98946646--98946980
151
2.2
151
90
3
530
25
18
25
30
1.98
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20
2.2
20
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1.95
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2.2
20
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0
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13
25
36
25
1.92
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29
2.0
29
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19
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1.91
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1.9
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86
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240
36
20
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35
1.82
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4.1
7
100
0
58
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0
0
27
0.85
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29
2.1
29
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72
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0
0
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2.2
36
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2
2
31
1.20
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10
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10
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4
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66
1.20
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27
2.0
27
88
0
79
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1
0
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1.06
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4
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4
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5
58
21
2
0
75
0.92
98974222--98974271
11
4.5
11
85
5
55
16
8
0
76
1.02
98974386--98974411
4
6.5
4
100
0
52
23
0
0
76
0.78
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2.5
62
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168
26
7
1
64
1.29
98978459--98978516
18
3.4
18
63
18
52
41
15
8
34
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98979110--98979162
25
2.3
24
78
15
58
52
13
0
33
1.40
98979826--98979875
5
9.6
5
91
8
82
58
0
0
42
0.98
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2.6
16
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51
0
0
48
1.00
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1.9
223
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492
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45
1.44
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19
2.4
19
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24
22
11
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1.86
98999331--98999830
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10
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33
16
19
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1.94
98999336--98999994
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14.6
44
73
7
387
33
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19
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35
17
17
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96
79
7
205
33
15
20
30
1.94
98999376--98999968
229
2.6
227
81
3
697
33
16
19
29
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322